| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 1 绪论 | 第12-26页 |
| 1.1 引言 | 第12-14页 |
| 1.2 分子标记概述 | 第14-18页 |
| 1.2.1 分子标记 | 第14-16页 |
| 1.2.2 分子标记的主要类型 | 第16-18页 |
| 1.3亚麻分子标记及应用 | 第18-20页 |
| 1.3.1 亚麻分子标记 | 第18-19页 |
| 1.3.2 亚麻SSR分子标记开发及应用 | 第19-20页 |
| 1.4 遗传群体概述 | 第20-21页 |
| 1.5 遗传连锁图谱 | 第21-23页 |
| 1.6 QTL定位 | 第23-24页 |
| 1.7 亚麻基因组研究 | 第24页 |
| 1.8 本研究的目的和意义 | 第24-26页 |
| 2 亚麻特异性SSR分子标记开发 | 第26-42页 |
| 2.1 材料 | 第26-27页 |
| 2.2 方法 | 第27-29页 |
| 2.2.0 亚麻基因组DNA提取 | 第27-28页 |
| 2.2.1 亚麻简化基因组测序 | 第28页 |
| 2.2.2 亚麻SSR鉴定 | 第28页 |
| 2.2.3 SSR引物对设计 | 第28页 |
| 2.2.4 多态性SSR标记检测体系的确定 | 第28-29页 |
| 2.2.5 亚麻品种遗传多样性分析 | 第29页 |
| 2.3 结果与分析 | 第29-41页 |
| 2.3.0 亚麻DNA提取优化步骤 | 第29-30页 |
| 2.3.1 亚麻测序及全基因组SSR搜索 | 第30-32页 |
| 2.3.2 亚麻全基因组SSR的开发和检测 | 第32-39页 |
| 2.3.3 亚麻SSR反应体系的确立及优化 | 第39页 |
| 2.3.4 亚麻全基因组SSR验证及结果分析 | 第39-41页 |
| 2.4 本章小结 | 第41-42页 |
| 3 亚麻遗传连锁图谱构建 | 第42-63页 |
| 3.1 材料 | 第42页 |
| 3.2 方法 | 第42-49页 |
| 3.2.1 亚麻全基因组DNA提取 | 第42页 |
| 3.2.2 亚麻SRAP标记PCR体系的优化 | 第42-43页 |
| 3.2.3 亚麻作图分离群体构建 | 第43页 |
| 3.2.4 多态性引物筛选 | 第43-45页 |
| 3.2.5 分离群体基因型分析 | 第45页 |
| 3.2.6 亚麻遗传连锁图谱的构建 | 第45-46页 |
| 3.2.7 文库构建及高通量测序 | 第46页 |
| 3.2.8 SLAF-Seq数据分组及基因型鉴定 | 第46页 |
| 3.2.9 高密度遗传连锁图谱构建 | 第46-49页 |
| 3.3 结果及讨论 | 第49-62页 |
| 3.3.1 亚麻SRAP分子标记技术体系建立及优化 | 第49-50页 |
| 3.3.2 亚麻分离群体的构建 | 第50页 |
| 3.3.3 多态性引物的筛选 | 第50页 |
| 3.3.4 群体标记分析 | 第50-51页 |
| 3.3.5 遗传连锁图谱的构建 | 第51-52页 |
| 3.3.6 标记在图谱上的分布 | 第52-53页 |
| 3.3.7 SLAF-Seq数据及评价 | 第53-54页 |
| 3.3.8 标签分析 | 第54-56页 |
| 3.3.9 高密度遗传连锁图谱基本信息 | 第56-58页 |
| 3.3.10 连锁图谱质量评估 | 第58-62页 |
| 3.4 本章小结 | 第62-63页 |
| 4 亚麻基因组组装 | 第63-67页 |
| 4.1 材料与方法 | 第63页 |
| 4.2 结果与分析 | 第63-65页 |
| 4.3 本章小结 | 第65-67页 |
| 5 亚麻纤维相关性状QTL定位 | 第67-74页 |
| 5.1 材料及方法 | 第67-69页 |
| 5.1.1 材料 | 第67页 |
| 5.1.2 方法 | 第67-69页 |
| 5.2 结果及讨论 | 第69-73页 |
| 5.2.1 亲本和群体目标性状变异分析 | 第69页 |
| 5.2.2 目标性状方差分析和群体频数分布 | 第69-71页 |
| 5.2.3 QTL定位分析 | 第71-73页 |
| 5.3 本章小结 | 第73-74页 |
| 讨论 | 第74-77页 |
| 结论 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-89页 |
| 附录 | 第89-116页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第116-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
| 个人简历 | 第118-120页 |
| 东北林业大学博士学位论文修改情况确认表 | 第120页 |