| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-28页 |
| 1.1 烟草青枯病研究现状 | 第14-18页 |
| 1.1.1 烟草青枯病的病原、病症及致病机理 | 第14页 |
| 1.1.2 烟草青枯病的遗传机理 | 第14-15页 |
| 1.1.3 烟草青枯病的防治方法 | 第15-18页 |
| 1.2 DNA分子标记技术 | 第18-21页 |
| 1.2.1 DNA分子标记的分类 | 第18-21页 |
| 1.2.2 分子标记的开发 | 第21页 |
| 1.3 烟草遗传图谱的研究进展 | 第21-22页 |
| 1.4 烟草QTL定位的研究进展 | 第22-26页 |
| 1.4.1 QTL定位的作图群体 | 第23页 |
| 1.4.2 QTL定位的方法 | 第23-24页 |
| 1.4.3 动态QTL的研究 | 第24-25页 |
| 1.4.4 烟草青枯病抗性QTL的研究 | 第25-26页 |
| 1.5 研究意义、目的及内容 | 第26-28页 |
| 1.5.1 研究目的及意义 | 第26-27页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第27-28页 |
| 第二章 基于RAD-seq数据开发烟草SSR和InDel标记 | 第28-42页 |
| 2.1 材料与方法 | 第29-31页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第29页 |
| 2.1.2 烟草基因组DNA的提取 | 第29-30页 |
| 2.1.3 简化基因组测序 | 第30页 |
| 2.1.4 基因组SSR和InDel位点的鉴别及SSR和InDel引物的设计 | 第30-31页 |
| 2.1.5 PCR扩增和检测方法 | 第31页 |
| 2.2 结果与分析 | 第31-39页 |
| 2.2.1 烟草简化基因组序列的产出和质量检测 | 第31-32页 |
| 2.2.2 烟草简化基因组中SSR位点的频率和分布 | 第32-33页 |
| 2.2.3 烟草基因组SSR位点基序重复次数 | 第33-35页 |
| 2.2.4 烟草简化基因组中InDel位点的频率 | 第35页 |
| 2.2.5 烟草SSR和InDel引物设计与多态性验证 | 第35-39页 |
| 2.3 讨论 | 第39-42页 |
| 2.3.1 烟草简化基因组SSR位点分布特征 | 第39-40页 |
| 2.3.2 SSR标记的开发和多态性SSR标记 | 第40-41页 |
| 2.3.3 InDel标记的开发及多态性标记 | 第41-42页 |
| 第三章 烟草SSR和InDel标记遗传图谱的构建 | 第42-54页 |
| 3.1 材料与方法 | 第43-44页 |
| 3.1.1 烟草材料 | 第43页 |
| 3.1.2 烟草RIL群体的基因分型 | 第43-44页 |
| 3.1.3 RIL群体基因型统计分析及遗传图谱的构建 | 第44页 |
| 3.2 结果与分析 | 第44-50页 |
| 3.2.1 亲本间SSR、InDel标记的多态性 | 第44-45页 |
| 3.2.2 标记的偏分离分析 | 第45-48页 |
| 3.2.3 烟草SSR和InDel遗传连锁图的构建 | 第48-50页 |
| 3.3 讨论 | 第50-54页 |
| 3.3.1 作图群体的构建 | 第50-51页 |
| 3.3.2 标记的偏分离 | 第51-52页 |
| 3.3.3 烟草遗传图谱的饱和度 | 第52-54页 |
| 第四章 烟草青枯病抗性的QTL定位 | 第54-66页 |
| 4.1 材料与方法 | 第55-57页 |
| 4.1.1 供试材料 | 第55页 |
| 4.1.2 试验设计 | 第55-56页 |
| 4.1.3 青枯病病情调查及分析 | 第56页 |
| 4.1.4 动态QTL定位 | 第56-57页 |
| 4.2 结果与分析 | 第57-63页 |
| 4.2.1 亲本及RIL群体青枯病的病情指数分析 | 第57-59页 |
| 4.2.2 烟草青枯病抗性QTL定位 | 第59-63页 |
| 4.3 讨论 | 第63-66页 |
| 4.3.1 不同时期及年份的青枯病定位结果 | 第63-64页 |
| 4.3.2 不同群体的定位结果比较分析 | 第64-65页 |
| 4.3.3 烟草青枯病抗性的QTL定位 | 第65-66页 |
| 第五章 结论与展望 | 第66-69页 |
| 5.1 研究结论 | 第66-67页 |
| 5.1.1 烟草多态性SSR和InDel标记的开发 | 第66页 |
| 5.1.2 烟草遗传图谱的构建 | 第66页 |
| 5.1.3 烟草青枯病抗性的QTL定位 | 第66-67页 |
| 5.2 展望 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-82页 |
| 硕士研究生期间发表的论文 | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83页 |
