| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1文献综述 | 第10-20页 |
| 1.1 转座子的概述 | 第10-11页 |
| 1.2 LTR转座子 | 第11-14页 |
| 1.2.1 LTR反转录转座子的结构与分类 | 第11-13页 |
| 1.2.2 LTR反转录转座子转座机制 | 第13-14页 |
| 1.3 LTR转座子的特征 | 第14-15页 |
| 1.3.1 LTR反转录转座子普遍性 | 第14页 |
| 1.3.2 LTR反转录转座子的高拷贝性 | 第14-15页 |
| 1.3.3 LTR反转录转座子对宿主的影响 | 第15页 |
| 1.3.3.1 对基因组大小、结构变异和进化的影响 | 第15页 |
| 1.3.3.2 对基因表达、功能和进化的影响 | 第15页 |
| 1.4 活性LTR反转录转座子 | 第15-17页 |
| 1.4.1 活性LTR反转录转座子的结构特征 | 第16页 |
| 1.4.2 甲基化与逆境胁迫对LTR转座子活性的影响 | 第16-17页 |
| 1.4.2.1 DNA甲基化对LTR转座子活性的影响 | 第16页 |
| 1.4.2.2 逆境胁迫对LTR转座子活性的影响 | 第16-17页 |
| 1.5 毛竹LTR转座子研究进展 | 第17页 |
| 1.6 研究目的和意义 | 第17-18页 |
| 1.7 技术路线 | 第18-20页 |
| 2.毛竹LTR转座子PHRE6的克隆与分析 | 第20-35页 |
| 2.1 实验材料 | 第20-21页 |
| 2.1.1 材料、菌株及载体 | 第20页 |
| 2.1.2 试剂及仪器 | 第20-21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-25页 |
| 2.2.1 毛竹叶片DNA的提取 | 第21-22页 |
| 2.2.2 反转录转座子PHRE6的克隆 | 第22-24页 |
| 2.2.2.1 PHRE6转座子的引物设计及扩增 | 第22页 |
| 2.2.2.2 PCR产物回收与克隆载体连接 | 第22-23页 |
| 2.2.2.3 大肠杆菌DH5α感受态制备 | 第23页 |
| 2.2.2.4 连接产物转化及阳性克隆筛选 | 第23-24页 |
| 2.2.2.5 质粒提取 | 第24页 |
| 2.2.3 PHRE6生物信息学分析 | 第24-25页 |
| 2.2.3.1 PHRE6的鉴定和在基因组的分布 | 第24-25页 |
| 2.2.3.2 PHRE6转座子的结构分析 | 第25页 |
| 2.2.3.3 PHRE6的进化分析 | 第25页 |
| 2.3 实验结果 | 第25-33页 |
| 2.3.1 毛竹基因组的提取 | 第25-26页 |
| 2.3.2 PHRE6全长的克隆 | 第26-27页 |
| 2.3.3 基因的序列分析 | 第27-33页 |
| 2.3.3.1 PHRE6的鉴定和在基因组的分布 | 第27-29页 |
| 2.3.3.2 PHRE6转座子的LTR序列 | 第29-30页 |
| 2.3.3.3 PHRE6转座子及其拷贝插入时间 | 第30页 |
| 2.3.3.4 PHRE6转座子的PBS和PPT序列 | 第30-31页 |
| 2.3.3.5 PHRE6转座子编码区分析 | 第31-32页 |
| 2.3.3.6 PHRE6转座子的分类 | 第32-33页 |
| 2.4 讨论 | 第33-35页 |
| 3.毛竹不同部位及胁迫条件下PHRE6转座子转录活性分析 | 第35-44页 |
| 3.1 实验材料 | 第35页 |
| 3.1.1 材料 | 第35页 |
| 3.1.2 试剂及仪器 | 第35页 |
| 3.2 实验方法 | 第35-39页 |
| 3.2.1 实验材料处理 | 第35-36页 |
| 3.2.2 毛竹总RNA提取 | 第36-37页 |
| 3.2.3 RNA的反转录 | 第37-38页 |
| 3.2.4 荧光定量PCR | 第38-39页 |
| 3.3 实验结果 | 第39-41页 |
| 3.3.1 毛竹总RNA提取 | 第39页 |
| 3.3.2 PHRE6转座子在毛竹不同部位的表达 | 第39-40页 |
| 3.3.3 PHRE6转座子在毛竹不同胁迫下的表达 | 第40-41页 |
| 3.4 讨论 | 第41-44页 |
| 4.毛竹不同胁迫下PHRE6的拷贝数变化 | 第44-50页 |
| 4.1 实验材料 | 第44页 |
| 4.2 实验方法 | 第44-45页 |
| 4.2.1 双标准曲线的荧光定量法 | 第44页 |
| 4.2.1.1 内参基因质粒与目的基因质粒的构建 | 第44页 |
| 4.2.1.2 标准曲线的制作 | 第44页 |
| 4.2.2 毛竹叶片DNA的提取 | 第44-45页 |
| 4.2.3 目的基因拷贝数的分析 | 第45页 |
| 4.3 实验结果 | 第45-48页 |
| 4.3.1 标准曲线的制作 | 第45-47页 |
| 4.3.2 PHRE6拷贝数的分析 | 第47-48页 |
| 4.4 .讨论 | 第48-50页 |
| 5.毛竹LTR反转录转座子转座监测系统的构建 | 第50-61页 |
| 5.1 实验材料 | 第50-51页 |
| 5.1.1 菌株和载体 | 第50页 |
| 5.1.2 试剂及仪器 | 第50-51页 |
| 5.2 实验方法 | 第51-57页 |
| 5.2.1 载体构建 | 第51-56页 |
| 5.2.1.1 两个LTR转座子编码区酵母表达载体pAG415-ORF构建 | 第51-56页 |
| 5.2.2 转座子在酵母中的转座 | 第56-57页 |
| 5.2.2.1 酵母双转化 | 第56-57页 |
| 5.2.2.2 筛选 | 第57页 |
| 5.3 实验结果 | 第57-61页 |
| 5.3.1 载体构建 | 第57-60页 |
| 5.3.2 转座子在酵母系统中的转座 | 第60-61页 |
| 6.总结与展望 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
