基于生物网络的疾病基因的识别与分析
摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4页 |
第一章 绪论 | 第7-13页 |
1.1 研究背景及意义 | 第7-9页 |
1.2 国内外研究现状 | 第9-11页 |
1.3 本文主要工作及创新点 | 第11-13页 |
第二章 相关基础准备 | 第13-19页 |
2.1 数据来源 | 第13-14页 |
2.1.1 基因表达数据 | 第13页 |
2.1.2 疾病基因数据 | 第13-14页 |
2.1.3 临床数据 | 第14页 |
2.2 PPI网络概述 | 第14-15页 |
2.2.1 PPI网络简介 | 第14-15页 |
2.2.2 PPI网络拓扑特性 | 第15页 |
2.3 生物学分析 | 第15-17页 |
2.3.1 网络模块分析 | 第15-16页 |
2.3.2 拓扑分析 | 第16-17页 |
2.3.3 功能富集分析 | 第17页 |
2.4 统计学分析 | 第17-19页 |
2.4.1 两独立样本t检验 | 第17-18页 |
2.4.2 卡方检验 | 第18页 |
2.4.3 Kaplan-Meier生存分析 | 第18页 |
2.4.4 Pearson相关性分析 | 第18-19页 |
第三章 基于生物网络的疾病基因的识别 | 第19-25页 |
3.1 引言 | 第19页 |
3.2 数据处理与方法 | 第19-21页 |
3.2.1 数据处理 | 第19-20页 |
3.2.2 方法 | 第20-21页 |
3.3 结果与分析 | 第21-24页 |
3.3.1 实验结果 | 第21-23页 |
3.3.2 结果分析 | 第23-24页 |
3.4 小结 | 第24-25页 |
第四章 候选基因在疾病中的表达涵义及临床意义 | 第25-37页 |
4.1 引言 | 第25-26页 |
4.2 数据处理与方法 | 第26页 |
4.3 结果与分析 | 第26-35页 |
4.3.1 候选基因在患病组和正常组的表达情况。 | 第26-27页 |
4.3.2 候选基因的表达与临床表型的相关性 | 第27-31页 |
4.3.3 候选基因对结直肠癌患者预后的影响 | 第31-34页 |
4.3.4 候选基因在疾病中表达的相关性 | 第34页 |
4.3.5 结果分析 | 第34-35页 |
4.4 小结 | 第35-37页 |
第五章 主要结论与展望 | 第37-38页 |
5.1 主要结论 | 第37页 |
5.2 展望 | 第37-38页 |
致谢 | 第38-39页 |
参考文献 | 第39-46页 |
附录:作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第46页 |