| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 第一章 引言 | 第16-28页 |
| 1.1 奶牛子宫 | 第16-18页 |
| 1.1.1 奶牛子宫的体内位 | 第17页 |
| 1.1.2 奶牛的子宫结构 | 第17-18页 |
| 1.1.3 母牛子宫组织结构 | 第18页 |
| 1.2 奶牛子宫内膜炎 | 第18-23页 |
| 1.2.1 奶牛子宫内膜炎的定义及类型 | 第18-19页 |
| 1.2.2 临床子宫内膜炎的分级评价 | 第19-20页 |
| 1.2.3 奶牛子宫内膜炎的危害 | 第20-21页 |
| 1.2.4 奶牛子宫内膜炎的病因 | 第21-22页 |
| 1.2.5 奶牛子宫内膜炎的病理特征 | 第22-23页 |
| 1.3 子宫内膜上皮细胞 | 第23页 |
| 1.4 奶牛子宫内膜炎的分子细胞研究 | 第23-24页 |
| 1.5 蛋白组学与转录组学技术 | 第24-27页 |
| 1.5.1 蛋白组学技术及其主要研究内容 | 第24-26页 |
| 1.5.2 转录组学技术及其主要研究内容 | 第26-27页 |
| 1.6 生物组学技术在奶牛子宫内膜炎研究中的应用 | 第27页 |
| 1.7 本研究的目的与意义 | 第27-28页 |
| 第二章 子宫内膜炎奶牛血浆蛋白组学研究 | 第28-41页 |
| 2.1 实验材料与方法 | 第28-32页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第28-29页 |
| 2.1.2 主要试剂与仪器设备 | 第29页 |
| 2.1.3 血液收集与处理 | 第29页 |
| 2.1.4 蛋白提取与准备 | 第29页 |
| 2.1.5 蛋白iTRAQ标记 | 第29-30页 |
| 2.1.6 蛋白分离 | 第30页 |
| 2.1.7 质谱鉴定 | 第30页 |
| 2.1.8 蛋白质鉴定 | 第30-31页 |
| 2.1.9 蛋白质定量与差异表达蛋白筛选 | 第31页 |
| 2.1.10 蛋白质功能注释分析 | 第31页 |
| 2.1.11 血浆蛋白含量检测 | 第31-32页 |
| 2.1.12 数据统计与分析 | 第32页 |
| 2.2 实验结果与分析 | 第32-37页 |
| 2.2.1 蛋白样品浓度检测 | 第32页 |
| 2.2.2 iTRAQ质谱与蛋白鉴定结果 | 第32-33页 |
| 2.2.3 肽段匹配的误差分析 | 第33页 |
| 2.2.4 质谱鉴定血浆蛋白的特征分析 | 第33-34页 |
| 2.2.5 差异表达蛋白统计 | 第34-35页 |
| 2.2.6 差异表达蛋白功能注释的富集分析 | 第35页 |
| 2.2.7 差异表达蛋白的KEGGpathway富集分析 | 第35-36页 |
| 2.2.8 补体通路相关的血浆差异表达蛋白 | 第36页 |
| 2.2.9 血浆免疫球蛋白与补体蛋白变化 | 第36-37页 |
| 2.3 讨论 | 第37-40页 |
| 2.3.1 子宫内膜炎引起奶牛血浆蛋白组变化 | 第37页 |
| 2.3.2 子宫内膜炎引起奶牛血浆蛋白功能变化 | 第37-38页 |
| 2.3.3 子宫内膜炎显著影响奶牛血液补体与凝血通路变化 | 第38-40页 |
| 2.4 小结 | 第40-41页 |
| 第三章 子宫内膜炎奶牛子宫蛋白组学研究 | 第41-63页 |
| 3.1 实验材料与方法 | 第41-46页 |
| 3.1.1 实验动物 | 第41-42页 |
| 3.1.2 主要试剂与仪器设备 | 第42页 |
| 3.1.3 子宫组织收集与处理 | 第42页 |
| 3.1.4 蛋白提取与准备 | 第42-43页 |
| 3.1.5 蛋白iTRAQ标记 | 第43页 |
| 3.1.6 蛋白分离 | 第43页 |
| 3.1.7 质谱鉴定 | 第43-44页 |
| 3.1.8 蛋白质鉴定 | 第44页 |
| 3.1.9 蛋白质定量与差异表达蛋白筛选 | 第44页 |
| 3.1.10 生物信息学注释与分析 | 第44-45页 |
| 3.1.11 子宫组织中蛋白水平变化检测 | 第45页 |
| 3.1.12 数据统计与分析 | 第45-46页 |
| 3.2 实验结果与分析 | 第46-59页 |
| 3.2.1 组织病理学分析 | 第46-47页 |
| 3.2.2 蛋白样品浓度检测 | 第47-48页 |
| 3.2.3 鉴定质量评估 | 第48-49页 |
| 3.2.4 质谱与蛋白鉴定结果 | 第49页 |
| 3.2.5 质谱鉴定子宫组织蛋白的特征分析 | 第49-50页 |
| 3.2.6 差异表达蛋白的统计分析 | 第50页 |
| 3.2.7 差异表达蛋白的聚类分析 | 第50-51页 |
| 3.2.8 差异表达蛋白的Venny分析 | 第51-53页 |
| 3.2.9 差异表达蛋白的功能注释富集分析 | 第53-54页 |
| 3.2.10 差异表达蛋白的KEGG通路富集分析 | 第54-58页 |
| 3.2.11 子宫组织中蛋白含量变化 | 第58-59页 |
| 3.3 讨论 | 第59-61页 |
| 3.4 小结 | 第61-63页 |
| 第四章 子宫内膜炎奶牛子宫转录组学研究 | 第63-79页 |
| 4.1 实验材料与方法 | 第63-67页 |
| 4.1.1 实验动物 | 第63页 |
| 4.1.2 主要试剂与仪器设备 | 第63页 |
| 4.1.3 RNA提取 | 第63-64页 |
| 4.1.4 转录组文库制备 | 第64页 |
| 4.1.5 测序 | 第64页 |
| 4.1.6 测序质量评估 | 第64页 |
| 4.1.7 差异表达基因及其生物信息分析 | 第64-66页 |
| 4.1.8 RT-PCR验证子宫组织中基因表达 | 第66-67页 |
| 4.1.9 数据分析与统计 | 第67页 |
| 4.2 实验结果与分析 | 第67-76页 |
| 4.2.1 RNA含量与质量等级 | 第67页 |
| 4.2.2 测序质量评估 | 第67-68页 |
| 4.2.3 参考基因比对及基因鉴定统计 | 第68-69页 |
| 4.2.4 序列在参考基因上的分布 | 第69页 |
| 4.2.5 差异表达基因统计 | 第69-70页 |
| 4.2.6 差异表达基因的聚类分析 | 第70-71页 |
| 4.2.7 差异表达基因的维恩分析 | 第71页 |
| 4.2.8 差异表达基因的GO功能显著性富集分析 | 第71-73页 |
| 4.2.9 差异表达基因的Pathway显著性富集分析 | 第73-75页 |
| 4.2.10 奶牛子宫组织中基因表达变化 | 第75-76页 |
| 4.3 讨论 | 第76-77页 |
| 4.4 小结 | 第77-79页 |
| 第五章 奶牛子宫内膜细胞体外炎症研究 | 第79-88页 |
| 5.1 实验材料与方法 | 第79-82页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第79页 |
| 5.1.2 试剂与仪器 | 第79页 |
| 5.1.3 奶牛子宫内膜细胞的分离与体外培养 | 第79-80页 |
| 5.1.4 奶牛子宫内膜上皮细胞与基质细胞的纯化培养与鉴定 | 第80页 |
| 5.1.5 LPS诱导子宫细胞的炎症反应 | 第80页 |
| 5.1.6 ELISA法检测细胞蛋白表达 | 第80-81页 |
| 5.1.7 RT-PCR检测细胞基因表达 | 第81-82页 |
| 5.1.8 实验数据统计分析 | 第82页 |
| 5.2 实验结果与分析 | 第82-85页 |
| 5.2.1 奶牛子宫内膜细胞的原代培养 | 第82页 |
| 5.2.2 子宫内膜上皮细胞的纯化培养与鉴定 | 第82-83页 |
| 5.2.3 LPS诱导下细胞基因表达变化 | 第83-84页 |
| 5.2.4 子宫内膜细胞中补体相关蛋白表达变化 | 第84-85页 |
| 5.3 讨论 | 第85-87页 |
| 5.4 小结 | 第87-88页 |
| 第六章 全文结论 | 第88-89页 |
| 参考文献 | 第89-99页 |
| 附录 | 第99-146页 |
| 致谢 | 第146-147页 |
| 作者简历 | 第147页 |
