| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第11-29页 |
| 1.1 乳腺癌亚型与雌激素受体(ER) | 第11-15页 |
| 1.1.1 乳腺癌的异质性与亚型分类 | 第11-13页 |
| 1.1.2 ER+(ER阳性)与ER阴性乳腺癌 | 第13-15页 |
| 1.2 ER阳性乳腺癌的术后辅助疗法 | 第15-19页 |
| 1.2.1 ER阳性乳腺癌的内分泌疗法 | 第15-17页 |
| 1.2.2 化疗、放疗和靶向治疗 | 第17-18页 |
| 1.2.3 ER阳性乳腺癌患者对内分泌疗法和其他辅助疗法的抵抗 | 第18-19页 |
| 1.3 基于基因表达谱构建分类器 | 第19-20页 |
| 1.4 本论文数据来源及其相关数据库 | 第20-25页 |
| 1.4.1 基因表达谱数据和数据库 | 第21-22页 |
| 1.4.2 基因功能注释和通路数据库 | 第22-24页 |
| 1.4.3 蛋白质相互作用网络和癌基因数据库 | 第24-25页 |
| 1.5 本论文的研究目的和意义 | 第25-27页 |
| 1.6 本论文各部分的主要内容 | 第27-29页 |
| 第二章 ER阳性与ER阴性乳腺癌失调基因的差异 | 第29-46页 |
| 2.1 引言 | 第29-30页 |
| 2.2 数据与方法 | 第30-34页 |
| 2.2.1 数据集和数据预处理 | 第30-31页 |
| 2.2.2 识别差异表达基因 | 第31页 |
| 2.2.3 比较ER阳性和ER阴性乳腺癌失调的基因 | 第31页 |
| 2.2.4 癌基因和人类蛋白质相互作用数据 | 第31-33页 |
| 2.2.5 富集分析 | 第33-34页 |
| 2.3 结果 | 第34-41页 |
| 2.3.1 ER阳性和阴性乳腺癌中失调方向相同但失调程度不同的基因 | 第34-36页 |
| 2.3.2 ER阳性和阴性乳腺癌中失调方向相反的基因 | 第36-41页 |
| 2.4 讨论 | 第41-44页 |
| 2.5 本章小结 | 第44-46页 |
| 第三章 构建并验证预测ER+乳腺癌对他莫昔芬敏感性的预测器 | 第46-72页 |
| 3.1 引言 | 第46-47页 |
| 3.2 数据与方法 | 第47-55页 |
| 3.2.1 基因表达谱和患者临床数据 | 第47-51页 |
| 3.2.2 基因表达芯片数据的预处理 | 第51页 |
| 3.2.3 基于相对基因表达构建RE-predictor | 第51-54页 |
| 3.2.4 SET指数和RS风险打分的计算 | 第54-55页 |
| 3.2.5 预测性能的评价及统计分析 | 第55页 |
| 3.3 结果 | 第55-68页 |
| 3.3.1 构建RE-predictor | 第55-56页 |
| 3.3.2 在独立患者群体中评价RE-predictor的预测性能 | 第56-61页 |
| 3.3.3 化疗-内分泌治疗患者群体中测试RE-predictor | 第61-62页 |
| 3.3.4 比较RE-predictor和基于绝对表达值预测器 | 第62-68页 |
| 3.4 讨论 | 第68-70页 |
| 3.5 本章小结 | 第70-72页 |
| 第四章 全文总结与展望 | 第72-77页 |
| 4.1 全文总结 | 第72-73页 |
| 4.2 后续工作展望 | 第73-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-105页 |
| 附录 | 第105-132页 |
| 攻读博士学位期间取得的成果 | 第132-134页 |
| 攻读博士学位期间参加的课题项目 | 第134页 |
