| Abstract | 第5-6页 |
| 摘要 | 第7-16页 |
| CHAPTER 0 | 第16-31页 |
| 0. Literature Review | 第16-31页 |
| 0.1. General Introduction | 第16-18页 |
| 0.1.1. Marine environment diversity | 第16页 |
| 0.1.2. Microorganism in Marine Environment | 第16-18页 |
| 0.2. Antagonistic Marine Bacteria | 第18页 |
| 0.3. Marine Bacteria and Antibiotic Resistance | 第18-20页 |
| 0.3.1. Antibiotic Resistance Hazards | 第18-19页 |
| 0.3.2. Marine bacteria as a remedy of microbial resistance | 第19-20页 |
| 0.4. Structure of Marine Bacterial Antibiotics | 第20-25页 |
| 0.4.1. Actinobacteria | 第20-22页 |
| 0.4.2. Pseudoalteromonas spp | 第22页 |
| 0.4.3. Vibrionaceae | 第22页 |
| 0.4.4. Firmicutes | 第22-23页 |
| 0.4.5. Rhodobacteraceae | 第23页 |
| 0.4.6. Pseudomonas spp | 第23页 |
| 0.4.7. Cyanobacteria | 第23-25页 |
| 0.5. Marine Bacteria as Probiotics | 第25-30页 |
| 0.5.1. Defnition of Probiotics | 第25-27页 |
| 0.5.2. Selecting and Developing Probiotics | 第27-28页 |
| 0.5.3. Selection criteria of Probiotics | 第28页 |
| 0.5.4. Qualified Presumption of Safety (QPS) | 第28-30页 |
| 0.6. Significance of the study | 第30页 |
| 0.7. Objectives of the study | 第30-31页 |
| CHAPTER 1 | 第31-38页 |
| 1. Sampling and Isolation of broad spectrum antagonistic bacteria from marine | 第31-38页 |
| 1.1. Introduction | 第31-32页 |
| 1.2. Materials and Methods | 第32-34页 |
| 1.2.1. Samples collection | 第32-33页 |
| 1.2.2. Isolation of bacterial flora from marine samples | 第33页 |
| 1.2.3. Screening of bacterial isolates for Antibacterial activity | 第33页 |
| 1.2.4. Statistical calculation | 第33-34页 |
| 1.3. Results | 第34-36页 |
| 1.4. Discussion | 第36-37页 |
| 1.5. Conclusion | 第37-38页 |
| CHAPTER 2 | 第38-50页 |
| 2. Antagonistic potential of marine isolates DK1-SA11 and DK6-SH8 | 第38-50页 |
| 2.1. Introduction | 第38-39页 |
| 2.2. Materials and Methods | 第39-42页 |
| 2.2.1. Bacteria | 第39页 |
| 2.2.2. Identification of marine isolates and phylogeny analysis | 第39-40页 |
| 2.2.3. Preparation of cell free extract | 第40页 |
| 2.2.4. Antibacterial activity of CFE | 第40-41页 |
| 2.2.5. Thermal and proteolytic stability of CFEs | 第41页 |
| 2.2.6. Effect of pH on CFEs | 第41页 |
| 2.2.7. Antagonistic activity against fish and shellfish pathogens | 第41页 |
| 2.2.8. Statistical calculations | 第41-42页 |
| 2.3. Results | 第42-47页 |
| 2.3.1. Identification of marine isolates | 第42-44页 |
| 2.3.2. Antimicrobial activity of CFE | 第44页 |
| 2.3.3. Thermal, proteolytic and pH stability of CFE | 第44-46页 |
| 2.3.4. Antagonistic spectrum | 第46-47页 |
| 2.4. Discussion | 第47-49页 |
| 2.5. Conclusions | 第49-50页 |
| CHAPTER 3 | 第50-61页 |
| 3. Phenotypic and genotypic characterization of marine isolate DK1-SA1135 | 第50-61页 |
| 3.1. Introduction | 第50-51页 |
| 3.2. Materials and Methods | 第51-53页 |
| 3.2.1. Bacteria | 第51页 |
| 3.2.2. Microscopic Morphology | 第51页 |
| 3.2.3. Biotyping | 第51页 |
| 3.2.4. Genotypic Classification | 第51-53页 |
| 3.3. Results | 第53-59页 |
| 3.3.1. Microscopic and Macroscopic Characterization | 第53页 |
| 3.3.2. Analytical profile index of DK1-SA11 | 第53-57页 |
| 3.3.3. Genotypic Classification | 第57-59页 |
| 3.4. Discussion | 第59-60页 |
| 3.5. Conclusions | 第60-61页 |
| CHAPTER 4 | 第61-76页 |
| 4. Safety and tolerance assessment of marine isolate DK1-SA11 for its putative application as probiotics | 第61-76页 |
| 4.1. Introduction | 第61-62页 |
| 4.2. Materials and Methods | 第62-66页 |
| 4.2.1. Bacterial strains | 第62-63页 |
| 4.2.2. Animals | 第63页 |
| 4.2.3. Analysis of enzyme activity | 第63页 |
| 4.2.4. Acid and Bile tolerance test | 第63-64页 |
| 4.2.5. Plasmids analysis | 第64页 |
| 4.2.6. Antibiotic resistance analysis | 第64页 |
| 4.2.7. Enterotoxin genes | 第64页 |
| 4.2.8. Enterotoxin detection | 第64页 |
| 4.2.9. Hemolysis and lecithinase detection | 第64-65页 |
| 4.2.10. Toxicity study in vivo | 第65页 |
| 4.2.11. Acute toxicity assay in Danio rerio | 第65页 |
| 4.2.12. Acute toxicity in mice | 第65-66页 |
| 4.2.13. Chronic toxicity in mice | 第66页 |
| 4.2.14. Statistical calculations | 第66页 |
| 4.3. Results | 第66-73页 |
| 4.3.1. Semi-quantitative enzymatic activity analysis | 第66-68页 |
| 4.3.2. Gastrointestinal track tolerance assay | 第68页 |
| 4.3.3. Antibiotic sensitivity and resistance transfer analysis | 第68-70页 |
| 4.3.4. Virulence analysis | 第70页 |
| 4.3.5. Toxicity study in vivo | 第70-73页 |
| 4.4. Discussion | 第73-75页 |
| 4.5. Conclusion | 第75-76页 |
| CHAPTER 5 | 第76-92页 |
| 5. Growth optimization of Marine isolate DK1-SA11 | 第76-92页 |
| 5.1. Introduction | 第76页 |
| 5.2. Materials and Methods | 第76-79页 |
| 5.2.1. Bacteria | 第76-77页 |
| 5.2.2. Growth and production of CFS | 第77页 |
| 5.2.3. Antimicrobial Activity of CFS | 第77页 |
| 5.2.4. Selection of growth media | 第77-78页 |
| 5.2.5. Effect of incubation temperatures, rotation speed, NaCl and pH | 第78页 |
| 5.2.6. Effect of carbohydrates on antibacterial activity | 第78-79页 |
| 5.2.7. Effect of Heat shock, cold storage and enzymes treatment on CFS | 第79页 |
| 5.2.8. Statistical calculations | 第79页 |
| 5.3. Results | 第79-89页 |
| 5.3.1. Antimicrobial activity of Cell free suspension | 第79-80页 |
| 5.3.2. Optimum growth conditions | 第80-86页 |
| 5.3.3. Effect of Carbohydrates on antimicrobial activity | 第86页 |
| 5.3.4. Effect of heat shock, cold storage and enzymatic treatments | 第86-89页 |
| 5.4. Discussion | 第89-91页 |
| 5.5. Conclusions | 第91-92页 |
| CHAPTER 6 | 第92-107页 |
| 6. Analysis and compound profiling of strain DK1-SA1177 | 第92-107页 |
| 6.1. Introduction | 第92-95页 |
| 6.2. Material and Methods | 第95-99页 |
| 6.2.1. Bacteria | 第95页 |
| 6.2.2. Growth conditions | 第95页 |
| 6.2.3. Ethyl acetate extract activity | 第95-96页 |
| 6.2.4. TLC-Bioautography | 第96页 |
| 6.2.5. Extraction scheme and compound profiling | 第96-98页 |
| 6.2.6. Acid Extraction | 第98页 |
| 6.2.7. HPLC profiling of Extracts | 第98页 |
| 6.2.8. MALDI-TOF mass spectrometry analysis | 第98-99页 |
| 6.3. Results | 第99-105页 |
| 6.3.1. Ethyl acetate extraction and TLC –bioautography | 第99-101页 |
| 6.3.2. TLC-Bioautography | 第101-102页 |
| 6.3.3. Classification of Lipopeptides | 第102-103页 |
| 6.3.4. HPLC profiling of Extracts | 第103-104页 |
| 6.3.5. Mass Spectrum analysis of lipopeptides | 第104-105页 |
| 6.4. Discussion | 第105-106页 |
| 6.5. Conclusion | 第106-107页 |
| 7. References | 第107-125页 |
| 8. Cumulative Conclusion | 第125-126页 |
| Innovations | 第126页 |
| Further study | 第126-127页 |
| Acknowledgement | 第127-128页 |
| List of Publications | 第128-130页 |
