| 摘要 | 第10-12页 |
| ABSTRACT | 第12-14页 |
| 缩略词 | 第15-17页 |
| 第一章 绪论 | 第17-22页 |
| 1.1 环境因素影响微生物分布 | 第17页 |
| 1.2 研究微生物群落的方法 | 第17-19页 |
| 1.3 荧光原位杂交(FISH)技术的分类 | 第19-20页 |
| 1.4 本论文研究的立题依据 | 第20-22页 |
| 第二章 利用高通量测序方法探究文登高岛盐场中慢生单胞菌的分布 | 第22-31页 |
| 2.1 实验材料 | 第22页 |
| 2.1.1 实验样品 | 第22页 |
| 2.1.2 实验耗材 | 第22页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-25页 |
| 2.2.1 样品处理 | 第22-23页 |
| 2.2.2 Illumina Miseq高通量测序 | 第23-25页 |
| 2.3 实验结果及分析 | 第25-29页 |
| 2.3.1 16S rDNA高通置测序OTU聚类结果 | 第25-26页 |
| 2.3.2 α多样性与慢生单胞菌群落丰度分析 | 第26-29页 |
| 2.4 本章小结 | 第29-31页 |
| 第三章 沉积物慢生单胞菌特异性探针的设计与验证 | 第31-41页 |
| 3.1 实验材料 | 第31页 |
| 3.1.1 实验试剂 | 第31页 |
| 3.1.2 培养基 | 第31页 |
| 3.1.3 实验仪器及软件 | 第31页 |
| 3.2 实验方法 | 第31-33页 |
| 3.2.1 沉积物慢生单胞菌16S rDNA生物信息学分析 | 第31-32页 |
| 3.2.2 特异性探针的设计与合成 | 第32页 |
| 3.2.3 特异性探针的特异性检测 | 第32-33页 |
| 3.3 实验结果与分析 | 第33-40页 |
| 3.3.1 探针的设计结果 | 第33-37页 |
| 3.3.2 探针序列的验证 | 第37-40页 |
| 3.4 本章小结 | 第40-41页 |
| 第四章 利用荧光原位杂交技术探究文登高岛盐场中沉积物慢生单胞菌的分布 | 第41-52页 |
| 4.1 实验材料 | 第41-44页 |
| 4.1.1 实验样品与菌株 | 第41页 |
| 4.1.2 实验探针 | 第41-42页 |
| 4.1.3 实验试剂与耗材 | 第42页 |
| 4.1.4 实验仪器 | 第42页 |
| 4.1.5 溶液与培养基配制 | 第42-44页 |
| 4.2 实验方法 | 第44-46页 |
| 4.2.1 样品处理 | 第44-45页 |
| 4.2.2 荧光原位杂交 | 第45页 |
| 4.2.3 荧光显微镜观察 | 第45页 |
| 4.2.4 自发荧光物质 | 第45-46页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第46-51页 |
| 4.3.1 特异性探针荧光原位杂交验证结果 | 第46-47页 |
| 4.3.2 环境样品中沉积物慢生单胞菌的分布 | 第47-51页 |
| 4.4 本章小结 | 第51-52页 |
| 第五章 三株海洋新菌的多相分类 | 第52-73页 |
| 5.1 实验材料 | 第52页 |
| 5.1.1 实验菌株 | 第52页 |
| 5.1.2 培养基 | 第52页 |
| 5.1.3 实验试剂 | 第52页 |
| 5.1.4 实验仪器 | 第52页 |
| 5.2 实验方法 | 第52-55页 |
| 5.2.1 表型特征测定 | 第53页 |
| 5.2.2 生理生化分析 | 第53-54页 |
| 5.2.3 遗传分子鉴定 | 第54页 |
| 5.2.4 化学分类特征鉴定 | 第54-55页 |
| 5.3 实验结果与分析 | 第55-72页 |
| 5.3.1 浅黄色嗜琼脂杆菌(Agaribacter flava)2p52~T的多相分类鉴定 | 第55-60页 |
| 5.3.2 噬琼脂海单胞菌(Marinomonas agarovorans)QM202~T的多相分类鉴定 | 第60-66页 |
| 5.3.3 短杆状玫瑰变色菌(Roseovarius brevitalea)XAY1247~T的多相分类鉴定 | 第66-72页 |
| 5.4 本章小结 | 第72-73页 |
| 第六章 总结与展望 | 第73-75页 |
| 6.1 不同生活环境中慢生单胞菌的分布 | 第73页 |
| 6.2 三株海洋新物种的多相分类鉴定 | 第73页 |
| 6.3 展望 | 第73-75页 |
| 参考文献 | 第75-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 资助情况 | 第82-83页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第83-84页 |
| 附件 | 第84页 |
