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小麦抗条锈病SSH cDNA文库ESTs的生物信息学分析

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
1 文献综述第11-24页
   ·植物抗病基因(R基因)研究进展第11-13页
   ·小麦抗条锈病基因研究进展第13-15页
   ·表达序列标签(EST)研究现状第15-19页
     ·EST的应用第17-19页
       ·新基因的发掘和基因的表达分析第17页
       ·基因的差异表达研究第17-18页
       ·基因组作图研究第18页
       ·寻找其它序列第18页
       ·制备DNA芯片第18-19页
     ·EST在小麦研究中的应用第19页
   ·电子定位第19-22页
     ·基因电子定位方法第20-21页
       ·利用同源序列电子定位基因第20页
       ·利用EST序列进行电子基因定位第20-21页
       ·直接利用基因序列电子定位第21页
     ·EST电子定位的特点第21-22页
   ·重要数据库简介第22-24页
     ·核酸序列数据库第22页
     ·蛋白质序列数据库第22-24页
研究目的与意义第24-26页
技术路线第26-27页
2 材料与方法第27-33页
   ·实验材料第27页
   ·应用软件及网络资源第27页
     ·DNAStar第27页
     ·序列数据库第27页
   ·实验方法第27-29页
     ·菌种活化第27-28页
     ·文库检测第28-29页
       ·检测所用引物第28页
       ·菌液PCR第28-29页
       ·琼脂糖电泳检测扩增产物第29页
       ·文库阳性克隆测序第29页
   ·EST序列分析与功能注释第29-33页
     ·有效EST的获得及拼接第29页
     ·EST序列及UniGene的比对分析与功能注释第29-30页
     ·EST电子定位第30-33页
       ·数据获取第30页
       ·本地化Blast分析系统的构建第30-31页
       ·EST的定位第31-33页
3 结果与分析第33-51页
   ·文库ESTs序列质量评价第33页
   ·文库ESTs比对分析第33-34页
   ·抗病进程相关基因的功能注释第34-43页
     ·抗病与防御相关基因第34-38页
       ·SHMT第34-35页
       ·茉莉酸诱导蛋白第35-36页
       ·热激蛋白第36-37页
       ·自噬作用相关蛋白第37页
       ·半胱氨酸合酶第37-38页
     ·转运相关基因第38-40页
       ·泛素蛋白第38-39页
       ·ABC转运蛋白第39-40页
     ·光合能量代谢相关基因第40-43页
   ·EST聚类拼接第43-44页
   ·UNIGENES比对分析及功能注释第44-47页
   ·电子定位第47-51页
4 讨论第51-57页
   ·条锈菌诱导表达SSH CDNA序列分析第51-52页
   ·川农19抗条锈病反应机制初探第52-54页
   ·MYB转录因子与甘氨酸脱羧酶复合体P蛋白亚基在植物抗逆反应中的作用第54页
   ·EST电子定位分析第54-57页
参考文献第57-61页
致谢第61页

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