中文摘要 | 第4-5页 |
abstract | 第5页 |
第一章 引言 | 第8-16页 |
第1.1节 研究背景 | 第8-9页 |
1.1.1 非编码RNA(microRNA与lncRNA)介绍 | 第8-9页 |
1.1.2 癌症概念与介绍 | 第9页 |
第1.2节 国内外研究现况 | 第9-14页 |
1.2.1 非编码RNA(microRNA与lncRNA)与癌症研究现况 | 第9-12页 |
1.2.2 相关已知数据库 | 第12-14页 |
第1.3节 研究方案 | 第14-15页 |
1.3.1 研究内容 | 第14页 |
1.3.2 所需要解决的问题 | 第14页 |
1.3.3 研究方案 | 第14-15页 |
第1.4节 研究目的和意义 | 第15-16页 |
1.4.1 研究目的 | 第15页 |
1.4.2 研究意义 | 第15页 |
1.4.3 创新性分析 | 第15-16页 |
第二章 ncRCancer数据库构建 | 第16-34页 |
第2.1节 microRNA与癌症数据搜集 | 第16-18页 |
2.1.1 人工采集数据 | 第16-17页 |
2.1.2 公开数据库 | 第17-18页 |
第2.2节 lncRNA与癌症数据搜集 | 第18-20页 |
2.2.1 人工采集数据 | 第18-19页 |
2.2.2 公开数据库 | 第19-20页 |
第2.3节 microRNA与癌症网络构建 | 第20-26页 |
2.3.1 网络构建流程 | 第20-21页 |
2.3.2 microRNA数据清洗 | 第21-22页 |
2.3.3 癌症命名规范 | 第22-23页 |
2.3.4 网络数据整合 | 第23-26页 |
第2.4节 lncRNA与癌症网络构建 | 第26-29页 |
2.4.1 网络构建与数据清洗 | 第26-27页 |
2.4.2 网络数据整合 | 第27-29页 |
第2.5节 ncRCancer数据库 | 第29-34页 |
第三章 microRNA/lncRNA—癌症二元网络关联分析 | 第34-53页 |
第3.1节 microRNA与癌症关联网络拓扑分析 | 第34-39页 |
3.1.1 癌症分布分析 | 第34-36页 |
3.1.2 microRNA分布分析 | 第36-37页 |
3.1.3 网络分析 | 第37-39页 |
第3.2节 网络功能分析 | 第39-48页 |
3.2.1 生物标志物在网络中的位置 | 第39-40页 |
3.2.2 microRNA调控基因的能力 | 第40-43页 |
3.2.3 信号通道富集分析 | 第43-46页 |
3.2.4 基因本体分析 | 第46-48页 |
第3.3节 lncRNA与癌症关联网络拓扑分析 | 第48-53页 |
3.3.1 癌症分布分析 | 第48-49页 |
3.3.2 lncRNA分布分析 | 第49-51页 |
3.3.3 lncRNA关联癌症网络分析 | 第51-52页 |
3.3.4 生物标志物在网络中的位置 | 第52-53页 |
第四章 microRNA—lnc RNA—癌症三元网络整合分析 | 第53-65页 |
第4.1节 microRNA与lncRNA机制关系 | 第53-59页 |
4.1.1 microRNA与lncRNA对癌症的共同作用 | 第53-55页 |
4.1.2 lncRNA海绵microRNA | 第55-57页 |
4.1.3 microRNA与lncRNA的调控关系 | 第57-59页 |
第4.2节 基因和信号通道的作用 | 第59-62页 |
4.2.1 调节基因表达 | 第60-61页 |
4.2.2 信号通道传递 | 第61-62页 |
第4.3节 三元网络构建与分析 | 第62-65页 |
4.3.1 网络构建 | 第62-63页 |
4.3.2 网络分析 | 第63-65页 |
第五章 总结与展望 | 第65-68页 |
第5.1节 课题总结 | 第65-67页 |
第5.2节 课题展望 | 第67-68页 |
参考文献 | 第68-75页 |
附录 | 第75-85页 |
附录1 图表支撑数据 | 第75-80页 |
附录2 microRNA-mRNA网络数据分类 | 第80-85页 |
致谢 | 第85-86页 |