ABSTRACT | 第12-15页 |
摘要 | 第16-20页 |
CHAPTER ONE Introduction | 第20-24页 |
CHAPTER TWO Literature Review | 第24-31页 |
2.1 Characterization and functional of avian TCF3 gene | 第26-27页 |
2.2 Semi-quantitative RT-PCR technique to assess TCF3 expression | 第27-28页 |
2.3 TCF3 expression differential | 第28-29页 |
2.4 Selection depends on gene expression variations | 第29-30页 |
2.5 Single nucleotide polymorphisms (SNPs) | 第30-31页 |
CHAPTER THREE Materials and Methods | 第31-40页 |
3.1 Experimental stock and sample size | 第31-32页 |
3.1.1 Duck breeds | 第31页 |
3.1.2 Chicken breeds | 第31-32页 |
3.2 Phenotypic measurements | 第32-33页 |
3.3 Blood samples collection and processing | 第33页 |
3.4 Samples collection and preparation | 第33-35页 |
3.4.1 DNA isolation | 第33-34页 |
3.4.2 DNA purification and concentration | 第34-35页 |
3.5 RNA extraction and purification | 第35页 |
3.6 Reverse transcription (RT) | 第35页 |
3.7 Primer sequences | 第35-36页 |
3.8 Semi-quantitative RT-PCR | 第36-38页 |
3.8.1 Submerged agarose gel electrophoresis (SAGE) | 第37页 |
3.8.2 Gel image acquisition and quantitative analysis | 第37-38页 |
3.9 SSCP-PCR protocol | 第38-39页 |
3.9.1 SSCP-PCR reactions | 第38页 |
3.9.2 Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) | 第38-39页 |
3.9.3 Detection of single nucleotide polymorphisms (SNPs) | 第39页 |
3.10 Statistical analysis | 第39-40页 |
CHAPTER FOUR Results | 第40-63页 |
4.1 TCF3 expression patterns | 第40-41页 |
4.2 Differential expression of TCF3 in different samples | 第41-42页 |
4.3 Calibration of RT-PCR signals | 第42-43页 |
4.4 Variations of TCF3 relative expression level | 第43-46页 |
4.4.1 Chicken breeds | 第43页 |
4.4.2 Duck breeds | 第43-46页 |
4.5 Association of TCF3 relative expression level and phenotypic characters | 第46-52页 |
4.5.1 Chicken breeds | 第46页 |
4.5.2 Duck breeds | 第46-52页 |
4.6 Detection of single nucleotide polymorphisms (SNPs) | 第52-60页 |
4.6.1 Single nucleotide polymorphisms confirmation | 第53-55页 |
4.6.2 SSCP-PCR product automated sequencing | 第55-57页 |
4.6.3 Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) analysis | 第57-60页 |
4.7 Association of TCF3 relative expression level and SNPs.. | 第60-61页 |
4.8 The effect of SNPs genotypes and sex upon TCF3 relative expression level | 第61-63页 |
CHAPTER FIVE Discussion | 第63-70页 |
5.1 Expression pattern of TCF3 factors E12/E47 | 第63页 |
5.2 Monitoring of TCF3 relative expression variations | 第63-65页 |
5.3 TCF3 relative expression and sexual dimorphism | 第65-66页 |
5.4 Association of TCF3 relative expression and body weight characters | 第66-67页 |
5.5 Single nucleotide polymorphisms (SNPs) analysis | 第67-68页 |
5.6 Correlation between TCF3 relative expression and SNPs. | 第68-70页 |
CHAPTER SIX Summary and Conclusion | 第70-74页 |
References | 第74-83页 |
Acknowledgement | 第83-85页 |
Papers in Peer-reviewed Journals | 第85-86页 |