| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 背景介绍 | 第10-20页 |
| 1.1 线虫及其在农业方面的危害和防治 | 第10-11页 |
| 1.2 捕食线虫真菌概述 | 第11-13页 |
| 1.3 捕食线虫真菌相关基础研究进展 | 第13-14页 |
| 1.4 捕食线虫真菌研究前景 | 第14页 |
| 1.5 基因组研究简述 | 第14-17页 |
| 1.5.1 基因组的测序、组装和分析 | 第16-17页 |
| 1.5.2 捕食线虫真菌的基因组研究情况 | 第17页 |
| 1.6 本研究的相关基础和意义 | 第17-20页 |
| 第二章 长胞亚隔指孢基因组分析 | 第20-28页 |
| 2.1. 材料和方法 | 第20页 |
| 2.2. 所用软件 | 第20-28页 |
| 2.2.1. 非编码蛋白基因的预测 | 第20-21页 |
| 2.2.1.1 t-RNAscan-SE | 第20页 |
| 2.2.1.2 RNAmmer | 第20页 |
| 2.2.1.3 Rfam | 第20-21页 |
| 2.2.1.4 重复序列的预测 | 第21页 |
| 2.2.2. 基因预测 | 第21-23页 |
| 2.2.3. 功能注释 | 第23-25页 |
| 2.2.3.1 KEGG | 第23-24页 |
| 2.2.3.2 COG&KOG | 第24-25页 |
| 2.2.3.3 GO | 第25页 |
| 2.2.4. RIP | 第25-26页 |
| 2.2.5. 进化组 | 第26页 |
| 2.2.6. 比较基因组 | 第26-28页 |
| 第三章 长胞亚隔指孢基因组分析结果 | 第28-44页 |
| 3.1 基因组整体情况 | 第28-29页 |
| 3.2 基因预测 | 第29-30页 |
| 3.3 非编码蛋白的序列的预测 | 第30-31页 |
| 3.4 编码基因功能注释 | 第31-36页 |
| 3.4.1 COG&KOG | 第31-33页 |
| 3.4.2 KEGG | 第33-35页 |
| 3.4.3 GO | 第35-36页 |
| 3.5 重复序列和RIP | 第36-37页 |
| 3.6 比较基因组 | 第37-41页 |
| 3.7 进化组 | 第41-44页 |
| 第四章 捕食线虫真菌产生捕器的条件初探及长胞亚隔指孢捕食线虫模式的观察 | 第44-52页 |
| 4.1. 背景介绍 | 第44-45页 |
| 4.2. 实验仪器和试剂 | 第45-46页 |
| 4.2.1. 实验用生物材料 | 第45-46页 |
| 4.2.2. 主要生化试剂 | 第46页 |
| 4.2.3. 所用仪器 | 第46页 |
| 4.3. 菌丝和线虫培养 | 第46-48页 |
| 4.3.1. 培养基配方及配法 | 第46-47页 |
| 4.3.2. 菌丝培养 | 第47页 |
| 4.3.3. 观察 | 第47页 |
| 4.3.4. 拍照 | 第47-48页 |
| 4.4. 捕捉线虫观察 | 第48页 |
| 4.4.1. 线虫培养 | 第48页 |
| 4.4.2. 线虫收集 | 第48页 |
| 4.4.3. 观察 | 第48页 |
| 4.5. 实验结果 | 第48-52页 |
| 4.5.1. 捕器发生 | 第48-50页 |
| 4.5.2. 捕捉线虫 | 第50-52页 |
| 第五章 讨论 | 第52-54页 |
| 附录一 KEGG通路统计 | 第54-66页 |
| 附录二 GO注释结果 | 第66-74页 |
| 参考文献 | 第74-80页 |
| 致谢 | 第80页 |