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武夷菌素生物合成基因簇的克隆及分析

摘要第1-6页
Abstract第6-14页
第一章 绪论第14-35页
   ·链霉菌简介及其基因组概述第14-16页
   ·抗生素生物合成基因簇的克隆策略第16-18页
     ·产生菌阻断突变体互补克隆第16页
     ·将目的基因直接克隆到标准宿主菌第16页
     ·利用已知的抗生素生物合成基因作探针从基因组文库中筛选同源基因第16页
     ·利用人工合成寡核苷酸探测基因文库第16-17页
     ·通过克隆抗生素耐药性基因得到生物合成基因第17页
     ·利用突变克隆分析生物合成基因第17页
     ·利用“自身克隆”或克隆到与该产生菌密切相关的宿主中第17-18页
     ·利用转座子克隆基因第18页
   ·基因组文库构建策略第18-24页
     ·pBR322 和pUC第18-19页
     ·λ噬菌体载体第19-20页
     ·酵母人工染色体载体(YAC)第20-21页
     ·细菌人工染色体(BAC)第21-22页
     ·Cosmid 载体(柯斯载体)第22-23页
     ·Fosmid 载体第23-24页
   ·抗生素生物合成基因研究进展第24-33页
     ·氨基糖苷类抗生素生物合成基因研究第24-26页
     ·非核糖体含硫多肽类抗生素生物合成基因研究第26-27页
     ·核苷类抗生素生物合成基因研究第27-30页
     ·聚酮类抗生素生物合成基因研究第30-33页
   ·武夷菌素的研究概况第33-34页
   ·本研究的目的和意义第34-35页
第二章 武夷菌素产生菌基因组文库的构建第35-43页
   ·材料第35-36页
     ·菌株和质粒第35页
     ·培养基第35-36页
     ·酶和试剂第36页
     ·仪器第36页
   ·方法第36-37页
     ·武夷菌素产生菌CK-15 基因组DNA 的制备第36-37页
     ·最适酶切条件的确定第37页
     ·基因组的大量酶切及酶切片段的回收第37页
     ·载体与酶切片段的连接第37页
     ·连接产物的包装及转染第37页
     ·文库质量鉴定第37页
   ·结果与分析第37-41页
     ·CK-15 基因组DNA 的制备第37-38页
     ·最适酶切条件的确定第38-39页
     ·酶切及回收第39-40页
     ·文库质量的鉴定第40-41页
   ·讨论第41-43页
第三章 基因组文库的筛选第43-52页
   ·材料第43页
     ·菌株、酶和试剂第43页
     ·培养基第43页
     ·仪器第43页
   ·方法第43-46页
     ·武夷菌素产生菌CK-15 基因组DNA 的制备第43-44页
     ·文库特异性引物的设计第44-46页
       ·引物序列与PCR 反应体系、PCR 反应程序第44-45页
       ·PCR 产物的回收第45页
       ·纯化后DNA 片段连接到T 载体第45页
       ·酶切验证插入片段第45-46页
     ·基因组文库筛选第46页
   ·结果与分析第46-50页
     ·不吸水链霉菌武夷变种基因组制备第46-47页
     ·文库特异性引物的筛选第47-49页
     ·基因组文库的筛选第49-50页
       ·阳性板的获得第49页
       ·阳性排的获得第49-50页
       ·以单个质粒进行扩增第50页
   ·讨论第50-52页
第四章 武夷菌素生物合成基因簇序列分析第52-64页
   ·材料第52-53页
     ·菌株和质粒第52页
     ·培养基和试剂第52-53页
     ·仪器第53页
   ·方法第53-54页
     ·2E4 阳性克隆Fosmid 质粒的制备第53页
     ·亚克隆及测序第53-54页
     ·对测序结果进行生物信息学分析第54页
   ·结果与分析第54-62页
     ·阳性克隆插入片段序列的ORF 识别第54页
     ·ORF 功能分析第54-62页
   ·讨论第62-64页
第五章 武夷菌素产生菌阻断突变株的筛选及分析第64-72页
   ·材料与方法第64-66页
     ·材料第64-65页
       ·供试菌株、培养基和试剂第64页
       ·培养基第64-65页
       ·试剂第65页
     ·单孢子悬浮液的制备与稀释倍数的确定第65页
     ·菌株诱变第65页
       ·亚硝基胍(NTG)诱变第65页
       ·氯化锂(LiCl)诱变第65页
       ·微波诱变第65页
       ·NTG 和LiCl 复合诱变第65页
     ·菌株筛选第65-66页
       ·琼脂块初筛第65-66页
       ·摇瓶发酵复筛第66页
     ·突变株遗传稳定性测定第66页
     ·突变株的形态学、培养特征的观察和抑菌谱测定第66页
     ·发酵液的HPLC 分析第66页
     ·数据处理第66页
   ·结果与分析第66-71页
     ·单孢子悬浮液稀释倍数的确定第66-67页
     ·不同诱变方法对CK-15 的诱变效果第67-68页
       ·亚硝基胍对CK-15 的诱变效果第67-68页
       ·氯化锂、微波单一诱变及氯化锂和亚硝基胍复合诱变对 CK-15 的诱变效果第68页
     ·突变株N1 的遗传稳定性测定第68-69页
     ·突变株形态学和培养特征分析第69页
     ·突变株的抑菌谱测定第69-70页
     ·突变株发酵液的HPLC 分析第70-71页
   ·讨论第71-72页
第六章 全文结论和展望第72-73页
参考文献第73-81页
致谢第81-82页
作者简历第82页

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