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慢病毒介导shRNA稳定持续抑制口蹄疫病毒增殖的两类细胞系的建立

摘要第1-6页
Abstract第6-13页
第一章 绪论第13-26页
   ·当前口蹄疫的分布和流行第13-14页
     ·口蹄疫概述第13页
     ·口蹄疫的分布和流行第13-14页
   ·口蹄疫病毒基因组基本结构及其特性第14-19页
     ·5' 非翻译区(5'-UTR)第16页
       ·VPg、S 片段和poly (C)第16页
       ·PKs、IRES 和cre第16页
     ·开放读码框(ORF)第16-18页
       ·引导蛋白酶( Leader proteinase, L~(pro))第17页
       ·结构蛋白P1 编码区第17页
       ·非结构蛋白P2、P3 编码区第17-18页
     ·3'非翻译区(3'-UTR)第18-19页
   ·RNAI 实现方法及在免疫相关基因功能鉴定中的应用第19-25页
     ·RNAi 转运方式第19-22页
       ·理化介导法第19-20页
       ·质粒DNA 载体法第20-21页
       ·病毒载体法第21-22页
     ·siRNA 细胞内形成方式第22-23页
       ·直接化学合成第22页
       ·体外转录合成第22页
       ·由RNaseⅢ催化长的dsRNA 得到siRNA第22页
       ·由表达载体在细胞内表达siRNA第22-23页
       ·由PCR 来源的siRNA 表达盒在细胞内表达siRNA第23页
     ·RNAi 在免疫相关基因功能鉴定中的进展第23-25页
       ·RNAi 技术鉴定基因功能的原理第23-24页
       ·RNAi 在免疫相关基因功能鉴定中的应用进展第24-25页
     ·现存问题及展望第25页
   ·本研究的目的和意义第25-26页
第二章 口蹄疫病毒SHRNA 的设计及表达载体的构建第26-34页
   ·材料与方法第26-31页
     ·主要试剂、载体及菌种第26页
     ·主要溶液及配制第26-27页
     ·FMDV 基因组2B 和3D 基因序列的同源性分析和shRNA 靶序列的选择第27页
     ·shRNA 表达模板的设计和合成第27-28页
     ·表达shRNA 的DNA 插入片段的载体构建第28-29页
     ·pEN/U6-shRNA 表达质粒的构建及鉴定第29-30页
     ·重组质粒的大量提取和纯化第30-31页
   ·结果第31-32页
     ·FMDV 基因组2B 和3D 序列同源性分析结果第31页
     ·靶序列的初步筛选结果第31页
     ·重组载体pEN/U6-shRNA 的鉴定第31页
     ·重组质粒的大量制备与纯化第31-32页
   ·讨论第32-34页
     ·关于干扰靶区的确定第32页
     ·关于shRNA 序列的选择和制备第32-34页
第三章 口蹄疫病毒3D 基因与增强型绿色荧光蛋白的真核共表达第34-39页
   ·材料和方法第34-36页
     ·细胞、菌株、载体及毒株第34页
     ·试剂第34页
     ·引物设计及合成第34-35页
     ·病毒RNA 的提取和RT-PCR第35页
     ·真核共表达质粒pEGFP+3D 的构建第35页
     ·重组质粒转染PK-15 细胞第35页
     ·EGFP 相对表达分析第35页
     ·3D 基因转录水平的检测第35-36页
   ·结果第36-38页
     ·3D 基因的RT-PCR 扩增第36页
     ·重组质粒pEGFP+3D 的鉴定第36页
     ·EGFP 在PK-15 细胞内的表达第36页
     ·EGFP 的相对表达分析第36-37页
     ·3D 基因转录水平检测结果第37-38页
   ·讨论第38-39页
第四章 质粒表达的SHRNA 对保守基因在PK-15 细胞中表达的抑制第39-43页
   ·材料和方法第39-40页
     ·载体、感受态细菌、细胞株和毒株第39页
     ·主要试剂及仪器设备第39页
     ·细胞培养用溶液第39页
     ·pEN/U6-shRNA 和pEGFP+3D 无内毒素超纯质粒的提取第39-40页
     ·pEGFP+3D 质粒与pEN/U6-shRNA 质粒共转染第40页
     ·对靶基因对应蛋白表达的抑制效果第40页
       ·荧光显微镜观察第40页
       ·流式细胞仪检测第40页
   ·结果第40-42页
     ·荧光显微镜观察shRNA 表达质粒对EGFP+3D 融合蛋白表达的抑制效果第40页
     ·流式细胞术检测shRNA 表达质粒对EGFP+3D 融合蛋白抑制效果第40-42页
   ·讨论第42-43页
第五章 慢病毒介导的SHRNA 靶向干扰FMDV 保守基因稳定细胞株的建立第43-51页
   ·材料与方法第43-46页
     ·试剂、菌种及载体第43页
     ·细胞及其培养第43页
     ·pLenti6/Dest 慢病毒表达载体的构建及鉴定第43-44页
       ·LR 重组反应第43-44页
       ·重组体转化感受态细胞及阳性质粒鉴定第44页
     ·慢病毒的包装第44页
     ·Blasticidin 细胞致死浓度的确定第44页
     ·转基因阳性细胞克隆的筛选第44页
     ·shRNA 整合基因组的单克隆细胞株的PCR 鉴定第44-45页
     ·转基因阳性细胞的抗病毒试验第45-46页
       ·转基因阳性细胞接毒第45页
       ·间接免疫荧光检测抗病毒水平第45页
       ·TCID_(50) 测定转基因阳性细胞抗病毒效果第45页
       ·real-time RT-PCR 检测转基因阳性细胞中FMDV 复制的抑制效果第45-46页
   ·结果第46-49页
     ·pEX/U6-shRNA 表达质粒干扰序列测序鉴定第46页
     ·两种细胞杀稻瘟菌素最小致死浓度的确定第46页
     ·shRNA 表达盒整合鉴定第46页
     ·转基因阳性细胞克隆的获得第46-47页
     ·转基因阳性细胞接毒后细胞病变效应(CPE)观察结果第47-48页
     ·间接免疫荧光检测转基因阳性细胞的抗病毒效果第48页
     ·TCID_(50) 测定转基因阳性细胞抗病毒水平第48页
     ·real-time RT-PCR 检测转基因阳性细胞中FMDV 复制的抑制效果第48-49页
   ·讨论第49-51页
     ·细胞转染和稳定筛选第49-50页
     ·转基因阳性细胞克隆的培养和鉴定第50页
     ·转基因阳性细胞克隆抑制FMDV 复制的检测第50-51页
第六章 全文结论第51-52页
参考文献第52-57页
致谢第57-58页
作者简介第58页

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