| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-34页 |
| 1.1 计算机模拟简介 | 第10-12页 |
| 1.2 分子动力学相关理论基础 | 第12-25页 |
| 1.2.1 分子动力学方法 | 第12-14页 |
| 1.2.2 布朗动力学方法 | 第14-15页 |
| 1.2.3 增强抽样方法简介 | 第15-25页 |
| 1.3 高性能计算在分子模拟中的应用 | 第25-29页 |
| 1.3.1 高性能计算发展概述 | 第25-26页 |
| 1.3.2 CUDA 与 GALAMOST 简介 | 第26-29页 |
| 1.4 本论文中涉及的其它相关领域简介 | 第29-34页 |
| 1.4.1 超分子化学简介 | 第29-30页 |
| 1.4.2 蛋白质折叠 | 第30-32页 |
| 1.4.3 生物体中具有扭结结构的大分子 | 第32-34页 |
| 第二章 主-客体复合制备规整多嵌段共聚物的动力学模拟研究 | 第34-54页 |
| 2.1 规整多嵌段共聚物合成简介 | 第34-36页 |
| 2.2 模型和方法 | 第36-44页 |
| 2.2.1 粗粒化模型 | 第36-39页 |
| 2.2.2 粗粒化作用势 | 第39-44页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第44-51页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第51-54页 |
| 第三章 均聚物和规则嵌段共聚物分子链coil-globule转变的研究 | 第54-72页 |
| 3.1 早期蛋白质模型 | 第54页 |
| 3.2 Coil-globule 转变 | 第54-56页 |
| 3.3 模型 | 第56-57页 |
| 3.4 模拟方法 | 第57-69页 |
| 3.5 结论 | 第69-72页 |
| 第四章 链拓扑结构和刚性对分子链 coil-globule 转变的影响 | 第72-86页 |
| 4.1 带拓扑结构的分子简介 | 第72-73页 |
| 4.2 模型 | 第73-75页 |
| 4.3 模拟方法 | 第75-76页 |
| 4.4 结果与讨论 | 第76-84页 |
| 4.5 结论 | 第84-86页 |
| 参考文献 | 第86-106页 |
| 作者简介及科研成果 | 第106-107页 |
| 致谢及基金资助 | 第107-108页 |
