| 学位论文数据集 | 第3-4页 |
| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 符号和缩略词说明 | 第11-21页 |
| 第一章 绪论 | 第21-49页 |
| 1.1 疟疾 | 第21页 |
| 1.2 抗疟疾药物 | 第21-24页 |
| 1.3 计算机辅助药物设计 | 第24-29页 |
| 1.3.1 计算机辅助药物设计的意义 | 第24-25页 |
| 1.3.2 计算机辅助药物设计原理 | 第25-26页 |
| 1.3.3 机器学习算法 | 第26-28页 |
| 1.3.4 基于受体的虚拟筛选方法 | 第28-29页 |
| 1.4 恶性疟原虫6-磷酸葡萄糖脱氢酶 | 第29-34页 |
| 1.4.1 恶性疟原虫6-磷酸葡萄糖脱氢酶功能简介 | 第29-30页 |
| 1.4.2 恶性疟原虫6-磷酸葡萄糖脱氢酶的结构特点 | 第30-32页 |
| 1.4.3 恶性疟原虫6-磷酸葡萄糖脱氢酶抑制剂的研究现状 | 第32-34页 |
| 1.5 恶性疟原虫二氢乳清酸脱氢酶 | 第34-43页 |
| 1.5.1 恶性疟原虫二氢乳清酸脱氢酶功能简介 | 第34-35页 |
| 1.5.2 恶性疟原虫二氢乳清酸脱氢酶的结构特点 | 第35-37页 |
| 1.5.3 恶性疟原虫二氢乳清酸脱氢酶抑制剂的研究现状 | 第37-43页 |
| 1.5.3.1 实验研究 | 第37-40页 |
| 1.5.3.2 恶性疟原虫二氢乳清酸脱氢酶抑制剂的构效关系研究 | 第40-43页 |
| 1.6 凝血因子FXIa简介 | 第43-45页 |
| 1.6.1 凝血因子FXIa的结构 | 第43-45页 |
| 1.6.2 抗凝血因子FXIa抑制剂的研究 | 第45页 |
| 1.7 本论文的研究意义和主要研究内容 | 第45-49页 |
| 第二章 恶性疟原虫6-磷酸葡萄糖脱氢酶抑制剂的分类研究 | 第49-65页 |
| 2.1 引言 | 第49页 |
| 2.2 数据集 | 第49-50页 |
| 2.3 实验方法 | 第50-57页 |
| 2.3.1 划分训练集/测试集方法 | 第51-52页 |
| 2.3.1.1 自组织神经网络法 | 第51页 |
| 2.3.1.2 MACCS分子指纹图谱 | 第51-52页 |
| 2.3.2 ADRIANA.Code分子描述符 | 第52-53页 |
| 2.3.3 分子描述符选择方法 | 第53-54页 |
| 2.3.4 建模方法 | 第54-55页 |
| 2.3.5 模型评估和验证 | 第55-57页 |
| 2.3.5.1 统计学参数的计算 | 第55-56页 |
| 2.3.5.2 偶然相关性检验 | 第56页 |
| 2.3.5.3 交互检验 | 第56-57页 |
| 2.4 实验结果与讨论 | 第57-63页 |
| 2.4.1 SVM模型效果 | 第57-58页 |
| 2.4.2 Y-扰乱结果 | 第58-59页 |
| 2.4.3 SOM法划分训练集和测试集得到的化学空间 | 第59-60页 |
| 2.4.4 PfG6PD抑制剂的结构-活性关系 | 第60-63页 |
| 2.5 本章小结 | 第63-65页 |
| 第三章 恶性疟原虫6-磷酸葡萄糖脱氢酶抑制剂生物活性定量构效关系预测研究 | 第65-77页 |
| 3.1 引言 | 第65页 |
| 3.2 数据集 | 第65-67页 |
| 3.3 实验方法 | 第67-70页 |
| 3.3.1 数据集划分 | 第67页 |
| 3.3.2 分子描述符的计算与选取 | 第67-70页 |
| 3.3.3 用于预测的SVM建模方法 | 第70页 |
| 3.4 实验结果与讨论 | 第70-75页 |
| 3.4.1 模型预测效果 | 第70-74页 |
| 3.4.2 Y-扰乱结果 | 第74页 |
| 3.4.3 描述符分析 | 第74-75页 |
| 3.5 本章小结 | 第75-77页 |
| 第四章 恶性疟原虫二氢乳清酸脱氢酶抑制生物活性的定量构效关系预测研究 | 第77-97页 |
| 4.1 引言 | 第77页 |
| 4.2 数据集 | 第77-78页 |
| 4.3 实验方法 | 第78-83页 |
| 4.3.1 描述符计算与选择 | 第78-82页 |
| 4.3.2 模型构建与检验 | 第82-83页 |
| 4.3.2.1 SVM回归模型的构建 | 第82页 |
| 4.3.2.2 统计学参数的计算 | 第82-83页 |
| 4.3.2.3 抑制剂-酶相互作用关系 | 第83页 |
| 4.4 实验结果与讨论 | 第83-95页 |
| 4.4.1 模型预测结果 | 第83-86页 |
| 4.4.2 Y-扰乱结果 | 第86-87页 |
| 4.4.3 描述符分析 | 第87-88页 |
| 4.4.4 抑制剂与恶性疟原虫二氢乳清酸脱氢酶的相互作用 | 第88-89页 |
| 4.4.5 潜在的高IC50化合物预测 | 第89-90页 |
| 4.4.6 与其他已发表工作的比较 | 第90-91页 |
| 4.4.7 利用动力学模拟方法研究抑制剂与PfDHODH的作用机理 | 第91-95页 |
| 4.4.7.1 晶体结构预处理和参数设置 | 第91-92页 |
| 4.4.7.2 结果分析 | 第92-95页 |
| 4.5 本章小结 | 第95-97页 |
| 第五章 凝血因子FXIa抑制剂的虚拟筛选 | 第97-109页 |
| 5.1 前言 | 第97页 |
| 5.2 实验方法 | 第97-101页 |
| 5.2.1 组合化学法 | 第97-99页 |
| 5.2.2 分子对接 | 第99-101页 |
| 5.2.2.1 GOLD软件 | 第99-100页 |
| 5.2.2.2 打分函数 | 第100-101页 |
| 5.3 实验数据来源和处理 | 第101页 |
| 5.4 实验结果 | 第101-107页 |
| 5.4.1 反应单体的过滤和分子片段对接 | 第101-102页 |
| 5.4.2 产物的分子对接 | 第102-104页 |
| 5.4.2.1 可能的产物组合和筛选 | 第102-103页 |
| 5.4.2.2 产物的分子对接 | 第103-104页 |
| 5.4.3 具有潜在成药性的产物分子 | 第104-107页 |
| 5.5 本章小结 | 第107-109页 |
| 第六章 总结与展望 | 第109-113页 |
| 6.1 总结 | 第109-110页 |
| 6.2 创新点 | 第110-111页 |
| 6.3 展望 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-121页 |
| 附录 | 第121-131页 |
| 致谢 | 第131-133页 |
| 作者发表的学术论文 | 第133-135页 |
| 作者及导师简介 | 第135-136页 |
| 附件 | 第136-137页 |
