干旱胁迫下獐茅SSh文库的构建及耐旱相关基因的筛选
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 目录 | 第7-10页 |
| 引言 | 第10-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-21页 |
| 1.1 干旱研究现状 | 第11-12页 |
| 1.1.1 干旱的定义和分类 | 第11页 |
| 1.1.2 干旱对农业的影响 | 第11-12页 |
| 1.2 干旱胁迫下植物的响应 | 第12-13页 |
| 1.3 干旱相关基因的研究进展 | 第13-16页 |
| 1.3.1 干旱相关功能基因 | 第13-15页 |
| 1.3.2 干旱相关调控基因 | 第15-16页 |
| 1.4 差异表达基因的研究方法 | 第16-20页 |
| 1.4.1 表达序列标签 | 第16-17页 |
| 1.4.2 mRNA差异显示 | 第17页 |
| 1.4.3 cDNA-RDA法 | 第17页 |
| 1.4.4 基因芯片技术 | 第17页 |
| 1.4.5 基因表达系列分析 | 第17-18页 |
| 1.4.6 抑制性消减杂交 | 第18-20页 |
| 1.5 獐茅研究现状 | 第20页 |
| 1.6 本研究的目的意义 | 第20-21页 |
| 2 文库构建材料的准备 | 第21-32页 |
| 2.1 实验材料 | 第21页 |
| 2.2 实验仪器 | 第21-22页 |
| 2.3 实验方法 | 第22-24页 |
| 2.3.1 干旱处理方法 | 第22页 |
| 2.3.2 干旱胁迫实验设计 | 第22-23页 |
| 2.3.3 干旱胁迫程度界定 | 第23-24页 |
| 2.3.4 獐茅干旱胁迫实验 | 第24页 |
| 2.3.5 文库构建材料的准备 | 第24页 |
| 2.4 实验结果与分析 | 第24-30页 |
| 2.4.1 干旱胁迫程度界定 | 第24-25页 |
| 2.4.2 獐茅SMC和RWC随干旱时间的变化 | 第25-27页 |
| 2.4.3 文库构建材料的准备 | 第27-29页 |
| 2.4.4 文库构建材料的生长状况及相应的参数 | 第29-30页 |
| 2.5 讨论 | 第30-31页 |
| 2.6 小结 | 第31-32页 |
| 3 SSH文库的构建 | 第32-48页 |
| 3.1 实验材料 | 第32页 |
| 3.2 实验仪器及试剂 | 第32-33页 |
| 3.3 实验方法 | 第33-43页 |
| 3.3.1 总RNA提取 | 第33-34页 |
| 3.3.2 mRNA的分离 | 第34-35页 |
| 3.3.3 SSH文库的构建 | 第35-43页 |
| 3.4 实验结果与分析 | 第43-47页 |
| 3.4.1 RNA提取及mRNA的分离 | 第43-44页 |
| 3.4.2 Rsa Ⅰ酶切结果 | 第44-45页 |
| 3.4.3 接头连接效率PCR鉴定 | 第45页 |
| 3.4.4 两轮消减杂交 | 第45页 |
| 3.4.5 文库容量鉴定 | 第45-46页 |
| 3.4.6 插入片段PCR检测 | 第46-47页 |
| 3.5 小结 | 第47-48页 |
| 4 文库测序及数据分析 | 第48-56页 |
| 4.1 实验材料 | 第48页 |
| 4.2 实验方法 | 第48-50页 |
| 4.2.1 文库测序 | 第48页 |
| 4.2.2 文库分析 | 第48-50页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第50-55页 |
| 4.3.1 测序结果统计 | 第50页 |
| 4.3.2 数据组装 | 第50-51页 |
| 4.3.3 Unigene功能注释 | 第51-52页 |
| 4.3.4 Unigene功能分类 | 第52-55页 |
| 4.4 小结 | 第55-56页 |
| 5 文库验证及关键基因的筛选 | 第56-74页 |
| 5.1 实验材料 | 第56页 |
| 5.2 实验仪器及试剂 | 第56-57页 |
| 5.2.1 实验仪器 | 第56页 |
| 5.2.2 实验试剂 | 第56-57页 |
| 5.3 实验方法 | 第57-62页 |
| 5.3.1 内参基因的克隆 | 第57-58页 |
| 5.3.2 qPCR引物设计 | 第58-61页 |
| 5.3.3 獐茅总RNA的提取及cDNA的获取 | 第61-62页 |
| 5.4 实验结果与分析 | 第62-73页 |
| 5.5 小结 | 第73-74页 |
| 结论 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-81页 |
| 附录A pMD18-T Vector结构图 | 第81页 |
| 附录B 实验中到的Marker | 第81-82页 |
| 附录C 文库功能注释结果 | 第82-98页 |
| 附录D 内参eEF-1α的基因序列 | 第98页 |
| 附录E 部分基因的溶解曲线和标准曲线 | 第98-103页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第103-104页 |
| 致谢 | 第104-105页 |
