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分枝杆菌生物素合成途径中BioF的功能鉴定和基于结构的催化机制研究

目录第4-7页
摘要第7-11页
Abstract第11-15页
缩略词(Abbreviation)第16-17页
第一章 绪论第17-37页
    1.1 结核病与结核分枝杆菌介绍第17-28页
        1.1.1 结核病及其研究现状第17-20页
        1.1.2 结核分枝杆菌基本特征第20-22页
        1.1.3 结核分枝杆菌的耐药性及对策第22-23页
        1.1.4 耻垢分枝杆菌作为结核分枝杆菌的模式生物第23-24页
        1.1.5 分枝杆菌的遗传操作第24-28页
    1.2 分枝杆菌中的生物素合成途径研究第28-33页
        1.2.1 生物素的生理学功能简介第28-29页
        1.2.2 生物素合成途径简介第29-31页
        1.2.3 生物素前体分子合成途径研究第31页
        1.2.4 生物素合成途径在分枝杆菌中的重要性第31-32页
        1.2.5 针对生物素合成途径的抑制剂研究第32-33页
    1.3 BioF的研究进展第33-35页
        1.3.1 BioF的相关结构研究第33-34页
        1.3.2 BioF的催化机制研究第34-35页
        1.3.3 分枝杆菌中BioF的研究现状第35页
    1.4 论文的立题依据及主要内容第35-37页
第二章 MsBioF克隆、表达、纯化和鉴定第37-61页
    2.1 材料与方法第37-48页
        2.1.1 试验材料第37-42页
        2.1.2 实验方法第42-48页
    2.2 结果与分析第48-58页
        2.2.1 MsbioF基因的克隆第48-50页
        2.2.2 MsBioF的表达与纯化第50-53页
        2.2.3 MsBioF蛋白的体外寡聚状态第53-56页
        2.2.4 MsBioF及MsBioF与PLP混合后的分子量的质谱测定第56-57页
        2.2.5 MsBioF的多克隆抗体的制备及检测第57-58页
        2.2.6 MsBioF蛋白体内表达的鉴定第58页
    2.3 讨论第58-59页
        2.3.1 MsBioF在溶液中以单体的形式存在第58-59页
        2.3.2 MsBioF在溶液中不能与PLP形成加合物第59页
    2.4 本章小结第59-61页
第三章 MsBioF的结晶及结构解析第61-78页
    3.1 材料与方法第61-66页
        3.1.1 试验材料第61-62页
        3.1.2 实验方法第62-66页
    3.2 结果与分析第66-76页
        3.2.1 MsbioF结晶用蛋白的表达纯化第66-69页
        3.2.2 MsBioF的晶体初筛第69-71页
        3.2.3 MsBioF晶体和防冻液的优化第71-73页
        3.2.4 数据收集第73页
        3.2.5 MsBioF的整体结构描述第73-75页
        3.2.6 MsBioF结构的共性与特性第75-76页
    3.3 讨论第76-77页
        3.3.1 MsBioF结晶状态下以二聚体的形式存在第76页
        3.3.2 MsBioF与大肠杆菌中的同源蛋白整体结构类似但有局部差异第76-77页
    3.4 本章小结第77-78页
第四章 耻垢分枝杆菌中MsbioF的敲除和功能研究第78-97页
    4.1 材料与方法第78-87页
        4.1.1 试验材料第78-81页
        4.1.2 实验方法第81-87页
    4.2 结果与分析第87-95页
        4.2.1 耻垢分枝杆菌中MsbioF基因的敲除第87-89页
        4.2.2 △MsbioF的表型观察第89-92页
        4.2.3 耻垢分枝杆菌中BioF体内功能的检测第92-93页
        4.2.4 三氟代丙氨酸抑菌效果分析第93-95页
    4.3 讨论第95页
        4.3.1 MsbioF是耻垢分枝杆菌无外源生物素的条件下生长所必需的第95页
        4.3.2 三氟代丙氨酸体内不能很好地抑制菌体的生长第95页
    4.4 本章小结第95-97页
第五章 MsBioF可能的催化机制和活性调节方式研究第97-115页
    5.1 材料与方法第97-102页
        5.1.1 试验材料第97-99页
        5.1.2 实验方法第99-102页
    5.2 结果与分析第102-111页
        5.2.1 MsBioF可能的活性中心鉴定第102-105页
        5.2.2 维持MsBioF体内活性的不可缺少的活性位点分析第105-107页
        5.2.3 MsBioF的N端(1-37)对其体内活性的影响第107-109页
        5.2.4 Cys136对MsBioF体内活性的影响第109-111页
    5.3 讨论第111-114页
        5.3.1 MsBioF的活性位点是与大肠杆菌有差异的第111-112页
        5.3.2 两MsBioF单体通过N端交换形成二聚体是MsBioF体内活性所必需的第112页
        5.3.3 MsBioF体内二聚体的形成机制分析第112-113页
        5.3.4 MsBioF体内活性部位关键氨基酸相互作用的分析第113页
        5.3.5 MsBio可能的催化机制第113-114页
    5.4 本章小结第114-115页
第六章 结核分枝杆菌中BioF的相关研究第115-132页
    6.1 材料与方法第115-121页
        6.1.1 实验材料第115-117页
        6.1.2 实验方法第117-121页
    6.2 结果与分析第121-129页
        6.2.1 MtbioF1基因的表达纯化第121-124页
        6.2.2 MtBioF1蛋白的体外寡聚状态第124-125页
        6.2.3 MtbioF1和MtbioF2基因回补△MsbioF的表型观察第125-127页
        6.2.4 MtBioF可能的活性位点和及其功能分析第127-129页
    6.3 讨论第129-131页
        6.3.1 结核分枝杆菌中在生物素合成中发挥作用的是MtbioF1第129-130页
        6.3.2 结核分枝杆菌和耻垢分枝杆菌中BioF的功能是保守的第130页
        6.3.3 MtBioF1对应活性中心对其体内活性的影响第130页
        6.3.4 MtBioF1在溶液中以单体的形式存在第130-131页
    6.4 本章小结第131-132页
全文总结与展望第132-135页
    本课题的不足之处和未来计划第133-135页
参考文献第135-143页
致谢第143-144页
攻读博士学位期间发表和待发表的学术论文第144-145页
学位论文评阅及答辩情况表第145页

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