| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 引言 | 第9-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-31页 |
| ·代谢工程简介 | 第10-17页 |
| ·代谢工程发展现状 | 第10-11页 |
| ·代谢工程存在的问题及解决办法 | 第11-14页 |
| ·代谢网络的系统研究方法 | 第14-17页 |
| ·代谢网络构建的研究现状 | 第17-22页 |
| ·代谢网络构建的研究进展 | 第17页 |
| ·基因组尺度代谢网络构建的一般过程 | 第17-19页 |
| ·构建基因组尺度代谢网络常用数据库及技术方法 | 第19-21页 |
| ·重构代谢网络的应用 | 第21-22页 |
| ·代谢网络静态分析的研究现状 | 第22-25页 |
| ·代谢网络静态分析方法概述 | 第22-24页 |
| ·代谢网络结构分析简介 | 第22-23页 |
| ·代谢网络静态定量分析简介 | 第23-24页 |
| ·代谢网络静态分析方法的常用软件及技术 | 第24页 |
| ·对代谢网络进行静态分析的意义与价值 | 第24-25页 |
| ·代谢网络动力学分析的研究现状 | 第25-28页 |
| ·代谢网络动力学分析的研究进展 | 第25-26页 |
| ·代谢网络动力学建模方法简介 | 第26-27页 |
| ·网络动力学的辅助分析方法与工具 | 第27-28页 |
| ·克雷伯氏菌代谢网络重构及动力学研究现状 | 第28-29页 |
| ·克雷伯氏菌简介 | 第28页 |
| ·克雷伯氏菌代谢网络重构研究现状 | 第28-29页 |
| ·克雷伯氏菌代谢动力学研究进展 | 第29页 |
| ·本论文研究的主要内容及意义 | 第29-31页 |
| 2 本地代谢网络数据库的构建 | 第31-43页 |
| ·引言 | 第31-32页 |
| ·方法及过程 | 第32-41页 |
| ·数据库的整体设计 | 第32-37页 |
| ·用户需求分析 | 第33-34页 |
| ·数据结构分析 | 第34-36页 |
| ·数据表结构设计 | 第36-37页 |
| ·生物代谢数据的获取与整理 | 第37-38页 |
| ·代谢网络数据库的构建 | 第38-41页 |
| ·结果与说明 | 第41页 |
| ·本章小结 | 第41-43页 |
| 3 K.pneumoniae 342代谢网络构建及结构分析 | 第43-51页 |
| ·K.pneumoniae 342简介 | 第43页 |
| ·K.pneumoniae 342代谢网络的构建 | 第43-46页 |
| ·方法及过程 | 第43-46页 |
| ·结果 | 第46页 |
| ·K.pneumoniae 342代谢网络的结构分析 | 第46-50页 |
| ·方法及过程 | 第46-49页 |
| ·代谢网络的可视化 | 第46-49页 |
| ·K.pneumoniae 342代谢网络结构分析 | 第49页 |
| ·结果 | 第49-50页 |
| ·本章小结 | 第50-51页 |
| 4 用于动力学分析的K.pneumoniae 342代谢网络构建 | 第51-57页 |
| ·引言 | 第51页 |
| ·BioModels Database简介 | 第51-52页 |
| ·Systems Biology Workbench简介 | 第52-54页 |
| ·用于动力学分析的K.pneumoniae 342代谢网络构建 | 第54-56页 |
| ·方法及过程 | 第54-55页 |
| ·结果 | 第55-56页 |
| ·本章小结 | 第56-57页 |
| 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-64页 |
| 附录A 文中所用程序源代码示例 | 第64-71页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
