中文摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5页 |
缩略词表 | 第6-11页 |
第一章 文献综述 | 第11-29页 |
1. 桃蚜简介 | 第11-14页 |
1.1 桃蚜的分布及危害 | 第11页 |
1.2 桃蚜的生物学特性 | 第11-13页 |
1.3 桃蚜的综合防治 | 第13-14页 |
2. 黄瓜花叶病毒简介 | 第14-15页 |
2.1 发生及危害 | 第14页 |
2.2 基因组特点 | 第14-15页 |
2.3 传播特点 | 第15页 |
3. 蚜虫传毒机理的研究进展 | 第15-20页 |
3.1 非循环型传毒 | 第16-18页 |
3.2 循环型传毒 | 第18-20页 |
4. 转录组研究在农业昆虫中的应用 | 第20-23页 |
4.1 转录组测序的步骤与分析方法 | 第20-22页 |
4.2 转录组研究在农业昆虫中的应用 | 第22-23页 |
5. 蛋白质组技术在农业昆虫中的应用 | 第23-27页 |
5.1 蛋白质组学的研究技术 | 第24-25页 |
5.2 蛋白质组研究在农业昆虫中的应用 | 第25-27页 |
6. 转录组与蛋白质组联合分析在农业中的应用 | 第27-28页 |
7. 本研究的目的及意义 | 第28-29页 |
第二章 桃蚜表皮蛋白基因的扩增与分析 | 第29-49页 |
1. 材料与方法 | 第29-32页 |
1.1 供试虫源 | 第29页 |
1.2 引物设计 | 第29-30页 |
1.3 桃蚜口针的获取 | 第30-31页 |
1.4 总RNA的提取 | 第31页 |
1.5 反转录 | 第31页 |
1.6 PCR扩增 | 第31-32页 |
1.7 序列比对 | 第32页 |
2. 结果与分析 | 第32-47页 |
2.1 引物筛选及反应条件优化 | 第32-33页 |
2.2 不同组织间的目的基因扩增 | 第33-34页 |
2.3 测序结果分析 | 第34-47页 |
3. 小结与讨论 | 第47-49页 |
第三章 桃蚜传毒过程相关基因的研究 | 第49-55页 |
1. 材料与方法 | 第49-51页 |
1.1 供试虫源 | 第49页 |
1.2 烟草 | 第49页 |
1.3 饥饿处理 | 第49页 |
1.4 虫子处理 | 第49-50页 |
1.5 总RNA的提取 | 第50页 |
1.6 反转录 | 第50-51页 |
1.7 荧光定量PCR | 第51页 |
2. 结果与分析 | 第51-53页 |
2.1 桃蚜传毒过程中体内CMV CP的变化情况 | 第51-52页 |
2.2 桃蚜传毒过程中体内表皮蛋白基因的变化情况 | 第52-53页 |
3. 小结与讨论 | 第53-55页 |
第四章 桃蚜传毒过程CMV CP与MPCUPS互作关系的研究 | 第55-64页 |
1 材料与方法 | 第55-61页 |
1.1 实验材料 | 第55页 |
1.2 RNA提取 | 第55页 |
1.3 反转录 | 第55-56页 |
1.4 PCR扩增及纯化 | 第56-58页 |
1.5 酶切反应 | 第58页 |
1.6 连接 | 第58-59页 |
1.7 连接产物转入大肠杆菌DH5α | 第59页 |
1.8 菌落PCR验证 | 第59页 |
1.9 酵母双杂交系统 | 第59-61页 |
2 结果与分析 | 第61-63页 |
2.1 酵母双杂交载体的构建 | 第61页 |
2.2 利用Y2H研究CMV CP与MpCuPs的互作 | 第61-63页 |
3 小结与讨论 | 第63-64页 |
第五章 桃蚜传毒过程MPCP4功能的研究 | 第64-72页 |
1 材料与方法 | 第64-69页 |
1.1 供试虫源 | 第64页 |
1.2 主要试剂 | 第64页 |
1.3 主要仪器 | 第64-65页 |
1.4 含T7启动子的模板DNA制备 | 第65-66页 |
1.5 dsRNA的制备 | 第66-67页 |
1.6 RNA干扰实验 | 第67-69页 |
2 结果与分析 | 第69-71页 |
2.1 dsRNA合成 | 第69页 |
2.2 dsRNA作用时间和浓度的优化 | 第69-70页 |
2.3 dsRNA处理后桃蚜体内CMV CP的变化情况 | 第70-71页 |
3 讨论 | 第71页 |
4 小结 | 第71-72页 |
第六章 利用转录组测序技术研究桃蚜传毒机制 | 第72-84页 |
1. 材料与方法 | 第72-74页 |
1.1 测序样品的准备 | 第72-73页 |
1.2 样品制备及上机测序 | 第73页 |
1.3 原始数据整理 | 第73-74页 |
1.4 从头组装 | 第74页 |
1.5 组装后转录组功能注释 | 第74页 |
1.6 表达差异分析 | 第74页 |
2. 结果与分析 | 第74-82页 |
2.1 样品总RNA的提取 | 第74-75页 |
2.2 剪切测序数据 | 第75-76页 |
2.3 组装后转录组注释 | 第76-78页 |
2.4 差异基因分析 | 第78-82页 |
3. 小结与讨论 | 第82-84页 |
第七章 利用蛋白质组测序技术研究桃蚜传毒机制 | 第84-94页 |
1. 材料与方法 | 第84-88页 |
1.1 实验试剂 | 第84页 |
1.2 实验仪器 | 第84页 |
1.3 测序样品的准备 | 第84-85页 |
1.4 蛋白质的提取及定量 | 第85-86页 |
1.5 酶解 | 第86页 |
1.6 iTRAQ | 第86-88页 |
1.7 数据分析 | 第88页 |
2. 结果与分析 | 第88-91页 |
2.1 测定蛋白浓度 | 第88页 |
2.2 差异蛋白分析 | 第88-91页 |
3. 小结与讨论 | 第91-94页 |
第八章 转录组与蛋白质组的关联分析 | 第94-99页 |
1. 材料与方法 | 第94页 |
1.1 测序样品的准备 | 第94页 |
1.2 转录组数据分析 | 第94页 |
1.3 qPCR验证 | 第94页 |
1.4 蛋白质组数据分析 | 第94页 |
1.5 转录组和蛋白质组联合分析 | 第94页 |
2. 结果与分析 | 第94-97页 |
2.1 差异表达基因的qPCR验证 | 第94-95页 |
2.2 差异表达的蛋白与差异表达的基因的关联分析 | 第95-97页 |
3. 小结与讨论 | 第97-99页 |
结论与展望 | 第99-100页 |
1. 结论 | 第99页 |
2. 本研究创新之处 | 第99页 |
3. 问题与展望 | 第99-100页 |
参考文献 | 第100-113页 |
致谢 | 第113-114页 |
附录 | 第114-119页 |
作者简介 | 第119页 |