| 摘要 | 第10-12页 |
| 英文摘要 | 第12-13页 |
| 1 前言 | 第14-22页 |
| 1.1 蛋白质组学概述 | 第14页 |
| 1.2 蛋白质组学研究方法 | 第14-17页 |
| 1.2.1 双向凝胶电泳技术 | 第14-15页 |
| 1.2.2 质谱技术 | 第15页 |
| 1.2.3 同位素的相对和绝对定量标记技术 | 第15-16页 |
| 1.2.4 生物信息学分析技术 | 第16页 |
| 1.2.5 其他研究方法 | 第16-17页 |
| 1.3 木薯蛋白质组学研究进展 | 第17-19页 |
| 1.3.1 木薯基因组和蛋白质组学 | 第17-18页 |
| 1.3.2 木薯野生和栽培种蛋白质组 | 第18-19页 |
| 1.4 蛋白质对木薯块根淀粉高效积累的分子调控研究 | 第19-21页 |
| 1.4.1 木薯块根淀粉高效积累的模式 | 第19页 |
| 1.4.2 木薯块根淀粉高效积累的蛋白质调控机理 | 第19-21页 |
| 1.5 研究目的与技术路线 | 第21-22页 |
| 1.5.1 研究目的与意义 | 第21页 |
| 1.5.2 技术路线 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-30页 |
| 2.1 材料 | 第22页 |
| 2.2 i TRAQ分析流程 | 第22-27页 |
| 2.2.1 标准实验流程 | 第22-25页 |
| 2.2.2 信息分析流程 | 第25-27页 |
| 2.3 木薯块根总RNA提取 | 第27-28页 |
| 2.3.1 试验准备 | 第27页 |
| 2.3.2 木薯块根总RNA提取方法 | 第27-28页 |
| 2.3.3 总RNA检测 | 第28页 |
| 2.4 Q-PCR分析 | 第28-30页 |
| 2.4.1 反转录合成c DNA | 第28页 |
| 2.4.2 PCR引物设计 | 第28-29页 |
| 2.4.3 q RT--PCR反应体系及程序 | 第29-30页 |
| 3 结果与分析 | 第30-116页 |
| 3.1 i TRAQ测序结果 | 第30-36页 |
| 3.1.1 肽段匹配误差分布 | 第30页 |
| 3.1.2 重复性分析 | 第30-31页 |
| 3.1.3 基本鉴定信息 | 第31-32页 |
| 3.1.4 相对分子质量分布 | 第32页 |
| 3.1.5 肽段长度分布 | 第32-33页 |
| 3.1.6 肽段序列覆盖度 | 第33页 |
| 3.1.7 Unique肽段数量分布 | 第33-34页 |
| 3.1.8 差异蛋白统计 | 第34页 |
| 3.1.9 GO注释 | 第34-36页 |
| 3.1.10 COG注释 | 第36页 |
| 3.2 差异蛋白的Pathway分析 | 第36-105页 |
| 3.2.1 碳代谢和能量代谢的差异蛋白 | 第37页 |
| 3.2.2 光合作用相关途径及差异蛋白 | 第37页 |
| 3.2.3 氨基酸代谢的差异蛋白 | 第37-65页 |
| 3.2.4 DNA和RNA相关代谢的差异蛋白 | 第65页 |
| 3.2.5 蛋白质相关代谢的差异蛋白 | 第65-84页 |
| 3.2.6 辅因子与维生素相关代谢的差异蛋白 | 第84-88页 |
| 3.2.7 信号转导代谢的差异蛋白 | 第88页 |
| 3.2.8 防御和运输代谢的差异蛋白 | 第88-94页 |
| 3.2.9 脂质代谢的差异蛋白 | 第94页 |
| 3.2.10 其他次生代谢的差异蛋白 | 第94-105页 |
| 3.3 差异蛋白质相互作用网络构建 | 第105-114页 |
| 3.3.1 碳代谢和能量代谢互作分析 | 第105-106页 |
| 3.3.2 光合作用相关途径互作分析 | 第106页 |
| 3.3.3 氨基酸代谢互作分析 | 第106-107页 |
| 3.3.4 DNA和RNA相关代谢互作分析 | 第107-108页 |
| 3.3.5 蛋白质相关代谢途径互作分析 | 第108-109页 |
| 3.3.6 辅因子与维生素相关代谢互作分析 | 第109-110页 |
| 3.3.7 信号转导代谢的差异蛋白互作分析 | 第110-111页 |
| 3.3.8 防御和运输代谢的差异蛋白互作分析 | 第111页 |
| 3.3.9 脂类代谢的差异蛋白互作分析 | 第111-112页 |
| 3.3.10 其他次生代谢的差异蛋白互作分析 | 第112-113页 |
| 3.3.11 总差异蛋白互作分析 | 第113-114页 |
| 3.4 q RT-PCR验证 | 第114-116页 |
| 4 讨论 | 第116-120页 |
| 4.1 蛋白质组学技术比较 | 第116页 |
| 4.2 木薯块根淀粉积累相关蛋白质的相互调控作用 | 第116-118页 |
| 4.3 差异蛋白质转录表达水平验证 | 第118-120页 |
| 5 结论 | 第120-122页 |
| 参考文献 | 第122-128页 |
| 致谢 | 第128-130页 |
| 个人简历 | 第130页 |