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瑞氏木霉纤维素酶降解模式及其功能多样性研究

摘要第8-11页
Abstract第11-14页
缩略词表第15-16页
第1章 绪论第16-44页
    1.1 木质纤维素第16-21页
        1.1.1 纤维素第17-18页
        1.1.2 半纤维素第18-20页
        1.1.3 木质素第20-21页
    1.2 降解木质纤维素的真菌第21-23页
    1.3 瑞氏木霉(Trichoderma reesei)的纤维素酶系第23-28页
        1.3.1 纤维素酶的种类第23-26页
        1.3.2 不同酶组分之间的协同作用第26页
        1.3.3 一种新的纤维素转化策略第26-28页
    1.4 测定纤维素酶活的底物第28-31页
        1.4.1 可溶性底物第28-29页
        1.4.2 不溶性底物第29-31页
    1.5 纤维素酶活性测定第31-35页
        1.5.1 内切纤维素酶活性的测定第32页
        1.5.2 外切纤维素酶活性的测定第32-33页
        1.5.3 β-D-葡萄糖苷酶活性的测定第33页
        1.5.4 总纤维素酶活的测定第33-35页
    1.6 T. reesei的系统生物学研究第35-42页
        1.6.1 T. reesei纤维素酶和半纤维素酶的基因组研究第35-36页
        1.6.2 T. reesei基因组碳水化合物水解酶的分布第36-37页
        1.6.3 T. reesei突变株基因组测序以确定影响纤维素酶生产的菌株第37-38页
        1.6.4 T. reesei的转录组研究第38-40页
        1.6.5 T. reesei的分泌组研究第40-41页
        1.6.6 T. reesei的代谢组学研究第41-42页
    1.7 立题依据第42-44页
第2章 不同碳源下T. reesei胞外糖苷水解酶的分析研究第44-56页
    2.1 材料与方法第44-47页
        2.1.1 菌种第44页
        2.1.2 培养基及试剂第44-45页
        2.1.3 仪器与设备第45页
        2.1.4 粗酶液的提取第45-46页
        2.1.5 糖苷水解酶活性的测定第46页
        2.1.6 糖苷水解酶谱及寡糖谱分析第46-47页
        2.1.7 T. reesei功能蛋白质组学分析第47页
    2.2 结果与分析第47-54页
        2.2.1 不同碳源发酵粗酶液中还原糖测定以及寡糖谱分析第47-48页
        2.2.2 T. reesei胞外糖苷水解酶活性的测定及动态酶谱分析第48-51页
        2.2.3 T. reesei在不同的碳源上其功能蛋白组学分析第51-54页
    2.3 小结与讨论第54-56页
第3章 荧光辅助糖电泳技术与纤维素酶降解模式的分析第56-77页
    3.1 材料与方法第56-64页
        3.1.1 化学试剂第56页
        3.1.2 再生无定形纤维素(RAC)底物的制备第56-57页
        3.1.3 T. reesei的内切纤维素酶TrCel12A的异源表达第57-61页
        3.1.4 内切纤维素酶ChCel5A的表达纯化第61-62页
        3.1.5 T. reesei外切纤维素酶Ⅰ(TrCel7A)的纯化第62页
        3.1.6 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第62-63页
        3.1.7 酶解实验测定第63页
        3.1.8 样品荧光标记第63页
        3.1.9 电泳条件优化第63页
        3.1.10 电泳数据定量提取第63-64页
    3.2 结果与分析第64-75页
        3.2.1 TrCel12A的异源表达第64-65页
        3.2.2 ChCel5A的纯化第65页
        3.2.3 TrCel7A的纯化第65-67页
        3.2.4 利用FACE测定纤维寡糖的浓度第67-69页
        3.2.5 利用FACE分析产物谱快速确定纤维素酶的种类第69-70页
        3.2.6 利用时间过程的产物谱分析区分内切纤维素酶的降解模式第70-75页
    3.3 小结与讨论第75-77页
第4章 T.reesei不同内切纤维素酶不同降解机制的研究第77-94页
    4.1 材料与方法第77-80页
        4.1.1 菌株与质粒第77页
        4.1.2 培养基及相关试剂第77-78页
        4.1.3 菌种活化与培养第78页
        4.1.4 T. reesei RNA提取及反转录第78页
        4.1.5 内切纤维素酶基因克隆与重组质粒的构建第78-79页
        4.1.6 EG Ⅰ的异源表达第79页
        4.1.7 EG Ⅱ、EGⅣ的异源表达第79页
        4.1.8 不同家族内切纤维素酶水解RAC与寡糖的FACE检测第79页
        4.1.9 不同家族内切纤维素酶的生物信息学分析第79-80页
    4.2 结果与分析第80-92页
        4.2.1 内切纤维素酶基因的扩增第80-81页
        4.2.2 内切纤维素酶的表达纯化第81-82页
        4.2.3 内切纤维素酶水解RAC产物谱的FACE检测第82-84页
        4.2.4 内切纤维素酶水解寡糖产物谱的FACE检测第84-86页
        4.2.5 内切纤维素酶活性中心的结构与表面电势分析第86-88页
        4.2.6 内切纤维素酶活性部位与糖环的相互作用分析第88-90页
        4.2.7 内切纤维素酶结合寡糖的分子动力学模拟第90-92页
    4.3 小结与讨论第92-94页
第5章 荧光光谱测定纤维素酶与底物的结合能力第94-103页
    5.1 材料与方法第94-96页
        5.1.1 试剂第94-95页
        5.1.2 主要仪器设备第95页
        5.1.2 内切纤维素酶ChCel5A的表达纯化第95页
        5.1.3 T. reesei外切纤维素酶Ⅰ(TrCel7A)的纯化第95页
        5.1.4 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第95-96页
        5.1.5 纤维素酶活性的测定第96页
        5.1.6 荧光体荧光光谱的测定第96页
        5.1.7 荧光体与pNP类底物结合的荧光光谱测定第96页
    5.2 结果与分析第96-101页
        5.2.1 荧光体自身荧光光谱的测定第96-98页
        5.2.2 荧光光谱的淬灭与结合常数及结合能的计算第98-100页
        5.2.3 使用荧光光谱的方法计算纤维素酶与底的结合常数以及结合自由能第100-101页
    5.3 小结与讨论第101-103页
全文总结与展望第103-106页
参考文献第106-116页
攻读学位期间发表的学术论文第116-117页
致谢第117-119页
附件第119页

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