病毒准种单体型重建优化算法设计与分析
摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第一章 绪论 | 第9-18页 |
1.1 生物信息学概述 | 第9-10页 |
1.2 遗传学基础 | 第10-12页 |
1.3 病毒准种及其测序 | 第12-15页 |
1.4 病毒准种单体型重建及其意义 | 第15-16页 |
1.5 本文主要内容和结构 | 第16-18页 |
第二章 病毒准种单体型重建问题研究 | 第18-28页 |
2.1 研究背景及现状 | 第18-19页 |
2.2 病毒准种单体型重建步骤 | 第19-27页 |
2.2.1 预处理 | 第19-22页 |
2.2.2 测序错误纠正 | 第22-23页 |
2.2.3 单体型全局重建 | 第23-26页 |
2.2.4 单体型频率推断 | 第26-27页 |
2.3 本章小结 | 第27-28页 |
第三章 病毒准种单体型重建优化算法 | 第28-41页 |
3.1 OVQR算法设计 | 第28-35页 |
3.1.1 综合预处理 | 第29-30页 |
3.1.2 融合纠错算法 | 第30-32页 |
3.1.3 基于多项分布的单体型重建 | 第32-35页 |
3.1.4 基于聚类算法频率推断 | 第35页 |
3.2 实验与结果分析 | 第35-40页 |
3.3 本章小结 | 第40-41页 |
第四章 病毒准种模拟测序生成器设计 | 第41-51页 |
4.1 模拟生成器设计 | 第41-47页 |
4.1.1 病毒株生成方式设计 | 第41-42页 |
4.1.2 病毒株突变位点分布模型设计 | 第42-46页 |
4.1.3 病毒株频率分布模型设计 | 第46页 |
4.1.4 模拟测序工具的调用 | 第46-47页 |
4.2 结果呈现 | 第47-49页 |
4.3 可视化界面 | 第49页 |
4.4 本章小结 | 第49-51页 |
第五章 总结 | 第51-53页 |
5.1 主要贡献及创新点 | 第51-52页 |
5.2 展望 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-57页 |
致谢 | 第57-59页 |
攻读硕士学位期间参与的科研项目 | 第59-61页 |