摘要 | 第6-8页 |
ABSTRACT | 第8-10页 |
第一章 前言 | 第11-32页 |
1.1 引言 | 第11-12页 |
1.2 ABL激酶抑制剂研究简介 | 第12-17页 |
1.2.1 Abl激酶的结构与调节机制 | 第12-14页 |
1.2.2 Abl激酶引发白血病的病理机制 | 第14页 |
1.2.3 Bcr-Abl抑制剂的发展概况 | 第14-16页 |
1.2.4 Bcr-Abl激酶抑制剂理论研究进展 | 第16-17页 |
1.3 计算机辅助药物设计(COMPUTER-AIDED DRUG DESIGN,CADD) | 第17-22页 |
1.3.1 三维定量构效关系(3D-QSAR) | 第18-19页 |
1.3.2 分子对接 | 第19-20页 |
1.3.3 分子动力学模拟 | 第20-22页 |
1.4 本文选题意义 | 第22-23页 |
参考文献 | 第23-32页 |
第二章 苯并噻唑与苯并咪唑类BCR-ABL激酶T315I突变体抑制剂的 3D-QSAR,分子对接和分子动力学的研究 | 第32-57页 |
2.1 引言 | 第32-33页 |
2.2 计算与研究方法 | 第33-41页 |
2.2.1 分子对接 | 第37-38页 |
2.2.2 分子模型与叠加 | 第38-39页 |
2.2.3 3D-QSAR模型的构建 | 第39页 |
2.2.4 PLS分析和 3D-QSAR模型的验证 | 第39-41页 |
2.3 结果与讨论 | 第41-51页 |
2.3.3 分子动力学模拟 | 第47-49页 |
2.3.4 结合自由能分析 | 第49-50页 |
2.3.5 设计高抑制活性的新化合物 | 第50-51页 |
2.4 结论 | 第51-53页 |
参考文献 | 第53-57页 |
第三章 苯甲酰胺类衍生物的 3D-QSAR、对接分析及分子动力学研究 | 第57-85页 |
3.1 引言 | 第57-58页 |
3.2 计算与研究方法 | 第58-64页 |
3.2.1 数据集 | 第58-61页 |
3.2.2 分子对接 | 第61-62页 |
3.2.3 分子模型与叠加 | 第62页 |
3.2.4 3D-QSAR模型的构建 | 第62页 |
3.2.5 偏最小二乘法(PLS)分析和QSAR模型的验证 | 第62-63页 |
3.2.6 分子动力学模拟 | 第63-64页 |
3.2.7 结合自由能的计算 | 第64页 |
3.3 结果与讨论 | 第64-79页 |
3.3.1 对接结果 | 第64-66页 |
3.3.2 Co MSIA的结果分析 | 第66-68页 |
3.3.3 Co MSIA等势图分析 | 第68-72页 |
3.3.4 分子动力学模拟和结合自由能分析 | 第72-79页 |
3.4 总结 | 第79-80页 |
参考文献 | 第80-85页 |
第四章 吡唑并[3,4-D]嘧啶类似物的 3D-QSAR、对接分析及分子动力学研究 | 第85-110页 |
4.1 前言 | 第85-86页 |
4.2 计算与实验方法 | 第86-91页 |
4.2.1 数据集 | 第86-87页 |
4.2.2 分子对接 | 第87-88页 |
4.2.3 分子模型与叠加 | 第88-89页 |
4.2.4 3D-QSAR模型的构建 | 第89页 |
4.2.5 分子动力学模拟 | 第89-90页 |
4.2.6 结合自由能的计算 | 第90-91页 |
4.3 结果与讨论 | 第91-103页 |
4.3.1 Abl_wt对接结果 | 第91页 |
4.3.2 Abl_T315I对接结果 | 第91页 |
4.3.3 Src对接结果 | 第91-92页 |
4.3.4 Co MFA结果分析 | 第92-95页 |
4.3.5 Co MFA等势图分析 | 第95-98页 |
4.3.6 分子动力学模拟 | 第98-101页 |
4.3.7 结合自由能分析 | 第101-103页 |
4.4 结论 | 第103-105页 |
参考文献 | 第105-110页 |
第五章 总结与展望 | 第110-112页 |
硕士期间发表的论文 | 第112-113页 |
致谢 | 第113页 |