| 摘要 | 第3-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第11-54页 |
| 1.1 无尾目两栖动物的生物多样性 | 第11-45页 |
| 1.1.1 无尾目两栖动物概述 | 第11-15页 |
| 1.1.2 无尾目两栖动物各科简介 | 第15-40页 |
| 1.1.3 无尾目两栖动物的研究现状 | 第40-45页 |
| 1.2 系统发育学概述 | 第45-52页 |
| 1.2.1 系统发育树概述 | 第45-47页 |
| 1.2.2 分歧时间估算概述 | 第47-49页 |
| 1.2.3 生物地理学概述 | 第49-50页 |
| 1.2.4 分子系统发育学的研究现状与挑战 | 第50-52页 |
| 1.3 本研究的目的与意义 | 第52-54页 |
| 第二章 大规模PCR产物高通量测序方法的开发 | 第54-90页 |
| 2.1 引言 | 第54-65页 |
| 2.1.1 测序技术简介 | 第54-62页 |
| 2.1.2 高通量测序技术在分子系统发育学上的研究进展 | 第62-65页 |
| 2.2 材料与方法 | 第65-82页 |
| 2.2.1 样本与分子标记的选取 | 第65-66页 |
| 2.2.2 试剂、仪器及来源 | 第66页 |
| 2.2.3 DNA提取与检测 | 第66-68页 |
| 2.2.4 PCR扩增与电泳检测 | 第68-71页 |
| 2.2.5 高通量PCR产物文库构建 | 第71-78页 |
| 2.2.6 数据分析 | 第78-81页 |
| 2.2.7 系统发育分析 | 第81-82页 |
| 2.3 结果 | 第82-87页 |
| 2.3.1 目标片段的回收率 | 第83-85页 |
| 2.3.2 最小测序深度 | 第85页 |
| 2.3.3 拼接序列与数据库序列的相似度 | 第85-86页 |
| 2.3.4 拼接序列在系统发育树上的表现 | 第86-87页 |
| 2.4 讨论 | 第87-90页 |
| 2.4.1 突破了测序平台的选择限制 | 第87页 |
| 2.4.2 不同长度的PCR产物可直接高通量测序 | 第87-88页 |
| 2.4.3 增加测序深度可以忽略PCR产物间的不均一性 | 第88页 |
| 2.4.4 潜在的不足 | 第88-90页 |
| 第三章 无尾目两栖动物的系统发育关系、分歧时间及生物地理分析 | 第90-133页 |
| 3.1 引言 | 第90-92页 |
| 3.2 材料与方法 | 第92-109页 |
| 3.2.1 样本选取 | 第92-95页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第95-97页 |
| 3.2.3 系统发育分析 | 第97-102页 |
| 3.2.4 分歧时间估计 | 第102-105页 |
| 3.2.5 多样性分化速率随时间变化的分析 | 第105页 |
| 3.2.6 生物地理分析 | 第105-109页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第109-133页 |
| 3.3.1 数据集概述 | 第109页 |
| 3.3.2 稳健、可靠的系统发育树 | 第109-118页 |
| 3.3.3 三大类群同时发生辐射进化 | 第118-127页 |
| 3.3.4 新蛙类的发源地是非洲板块 | 第127-132页 |
| 3.3.5 现生树栖无尾目两栖动物均起源于K-Pg之后 | 第132-133页 |
| 第四章 总结与展望 | 第133-137页 |
| 4.1 研究总结 | 第133-135页 |
| 4.2 研究展望 | 第135-137页 |
| 参考文献 | 第137-151页 |
| 附录 | 第151-179页 |
| 攻读学位期间研究成果 | 第179-180页 |
| 致谢 | 第180-181页 |
