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绿头鸭MHCⅠ类基因遗传多样性研究

摘要第5-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 文献综述第10-19页
    1.1 MHC概述第10页
    1.2 MHC Ⅰ类分子结构第10-11页
    1.3 功能第11-12页
    1.4 MHC基因的多态性第12页
        1.4.1 MHCI类分子的多肽结合区呈多态性第12页
        1.4.2 MHC分子在种间、个体间呈多态性第12页
    1.5 MHC基因多态性研究的应用第12-14页
        1.5.1 MHC与疾病的抗性第13页
        1.5.2 家禽MHC与抗病育种第13页
        1.5.3 在系统进化中的应用第13-14页
        1.5.4 在种群保护方面的作用第14页
    1.6 MHC多态性研究方法第14-15页
        1.6.1 RSCA参比链介导的构象分析第14页
        1.6.2 PCR-SSCP单链构象多态性第14-15页
        1.6.3 不分位点直接测序第15页
    1.7 PCR-SSCP简述第15-16页
        1.7.1 PCR - SSCP的基本原理第15页
        1.7.2 PCR - SSCP技术优缺点第15-16页
    1.8 PCR-SSCP用于MHC Ⅰ基因多态性分析第16-17页
    1.9 本研究的目的和意义第17-19页
第二章 试验材料与方法第19-36页
    2.1 试验材料与仪器第19-22页
        2.1.1 试验动物样本第19页
        2.1.2 试剂第19页
        2.1.3 部分主要试剂的配制第19-22页
        2.1.4 试验仪器第22页
    2.2 试验方法第22-36页
        2.2.1 绿头鸭全血采集第22页
        2.2.2 绿头鸭基因组DNA的提取第22-23页
        2.2.3 脏器总RNA提取第23-24页
        2.2.4 基因组DNA的检测第24页
        2.2.5.电泳检测RNA样品第24-25页
        2.2.6 大肠杆菌感受态细胞的Cacl2法制备及质粒转化第25-26页
        2.2.7 MHC Ⅰ类基因扩增第26-29页
        2.2.8 RACE获取cDNA全长第29-32页
        2.2.9 PCR产物连接,克隆测序第32-33页
        2.2.10 全长cDNA序列获取第33页
        2.2.11 MHC Ⅰ类外显子2和外显子3表达位点群体PCR-SSCP第33页
        2.2.12 巢氏PCR第33页
        2.2.13 PCR-SSCP检测第33-34页
        2.2.14 等位基因的确定第34-35页
        2.2.15 群体MHC基因多态性分析方法及软件第35-36页
第三章 试验结果第36-55页
    3.1 绿头鸭基因组DNA的提取第36页
    3.2 组织样品RNA的提取结果第36-37页
    3.3 验证基因是否编码第37-38页
    3.4 3’RACE和 5’RACE结果第38-39页
    3.5 RACE回收产物做克隆检测结果第39-40页
    3.6 绿头鸭MHC Ⅰ全长序列分析第40-42页
    3.7 群体PCR-SSCP结果第42-46页
        3.7.1 PCR结果获取分析第42-43页
        3.7.2 个体SSCP结果分析第43-44页
        3.7.3 群体SSCP结果分析第44-46页
    3.8 获取MHC-I等位基因多态性分析第46-55页
        3.8.1 MHC-I外显子2等位基因核酸序列多态性分析第46-47页
        3.8.2 MHC-I外显子2等位基因氨基酸序列多态性分析第47-49页
        3.8.3 MHC-I外显子2等位基因进化树分析第49页
        3.8.4 MHC-I外显子2位点遗传学分析第49-50页
        3.8.5 MHC-I外显子3等位基因核酸序列多态性分析第50-51页
        3.8.6 MHC-I外显子3等位基因氨基酸序列多态性分析第51-53页
        3.8.7 MHC-I外显子3等位基因进化树学分析第53页
        3.8.8 MHC-I外显子3位点遗传学分析第53-55页
第四章 讨论第55-57页
    4.1 PCR - SSCP技术之于本研究的效果讨论第55页
    4.2 绿头鸭与其他物种间的氨基酸序列聚类分析第55页
    4.3 MHC Ⅰ类基因遗传多态性分析第55-56页
    4.4 绿头鸭MHC Ⅰ基因的遗传群体学分析第56-57页
第五章 结论第57-58页
展望第58-59页
参考文献第59-70页
个人简介第70-71页
致谢第71-72页

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