| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 引言 | 第9-18页 |
| 1.1 向日葵锈病研究进展 | 第9页 |
| 1.2 DNA分子标记 | 第9-12页 |
| 1.3 SSR标记 | 第12-14页 |
| 1.3.1 SSR标记技术的概念和原理 | 第12-13页 |
| 1.3.2 SSR分子标记的开发 | 第13页 |
| 1.3.3 SSR标记的研究历程及特点 | 第13-14页 |
| 1.4 DNA分子标记在真菌研究中的应用 | 第14-16页 |
| 1.5 研究内容、目的与意义 | 第16-18页 |
| 1.5.1 研究内容与技术路线 | 第16-17页 |
| 1.5.2 研究目的与意义 | 第17-18页 |
| 2 基于向日葵锈菌转录组SSR数据挖掘 | 第18-27页 |
| 2.1 材料与方法 | 第18-19页 |
| 2.1.1 材料及数据来源 | 第18页 |
| 2.1.2 SSR的挖掘 | 第18页 |
| 2.1.3 ORF预测及含SSR序列基因表达水平分析 | 第18-19页 |
| 2.1.4 含SSR Unigene的的功能注释 | 第19页 |
| 2.2 结果与分析 | 第19-24页 |
| 2.2.1 重复基元的频率及分布 | 第19-20页 |
| 2.2.2 SSR长度特征 | 第20-22页 |
| 2.2.3 SSR位置及含SSR序列基因表达水平分析 | 第22-23页 |
| 2.2.4 含SSR的转录本的GO注释 | 第23-24页 |
| 2.3 讨论 | 第24-27页 |
| 3 SSR反应体系优化 | 第27-36页 |
| 3.1 材料方法 | 第27-29页 |
| 3.1.1 所用试剂及仪器 | 第27-28页 |
| 3.1.2 模板DNA制备 | 第28页 |
| 3.1.3 SSR引物设计 | 第28-29页 |
| 3.1.4 SSR体系优化 | 第29页 |
| 3.2 试验结果 | 第29-34页 |
| 3.2.1 基因组DNA的提取 | 第29-30页 |
| 3.2.2 引物设计 | 第30页 |
| 3.2.3 SSR-PCR反应体系优化 | 第30-32页 |
| 3.2.4 引物退火温度的优化 | 第32-34页 |
| 3.3 结论与讨论 | 第34-36页 |
| 3.3.1 向日葵锈菌夏孢子基因组提取 | 第34页 |
| 3.3.2 SSR-PCR反应条件优化 | 第34-35页 |
| 3.3.3 引物退火温度的优化 | 第35-36页 |
| 4 向日葵锈菌遗传多态性 | 第36-47页 |
| 4.1 材料方法 | 第36-37页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第36-37页 |
| 4.1.2 繁殖方法 | 第37页 |
| 4.1.3 总DNA提取 | 第37页 |
| 4.1.4 SSR扩增 | 第37页 |
| 4.1.5 数据采集 | 第37页 |
| 4.2 结果分析 | 第37-45页 |
| 4.2.1 总DNA提取结果分析 | 第37-39页 |
| 4.2.2 SSR-PCR结果及多态性分析 | 第39-41页 |
| 4.2.3 通过UPGMA进行遗传相似性分析 | 第41-45页 |
| 4.3 结论与讨论 | 第45-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-55页 |
| 个人简介 | 第55页 |