摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4页 |
第一章 绪论 | 第7-11页 |
1.1 生物信息学简介 | 第7-9页 |
1.1.1 生物信息学的背景与定义 | 第7页 |
1.1.2 生物信息学的研究内容与研究方法 | 第7-8页 |
1.1.3 生物信息学的国内外研究现状与未来发展趋势 | 第8-9页 |
1.2 p53家族基因简介 | 第9页 |
1.3 层次聚类分析 | 第9-10页 |
1.4 本文的主要研究内容及创新点 | 第10-11页 |
1.4.1 主要研究内容 | 第10页 |
1.4.2 创新点 | 第10-11页 |
第二章 一种兼具生物和物理特征的E基因签名方法 | 第11-19页 |
2.1 材料与方法 | 第11-14页 |
2.1.1 材料来源 | 第11-12页 |
2.1.2 基因签名的产生 | 第12-13页 |
2.1.3 E欧氏距离和e均方差 | 第13-14页 |
2.2 结果分析及讨论 | 第14-18页 |
2.2.1 E基因签名图 | 第14-17页 |
2.2.2 E欧氏距离的层次聚类分析 | 第17-18页 |
2.3 本章小结 | 第18-19页 |
第三章 基于CGR方法的p53家族基因序列的层次聚类分析 | 第19-26页 |
3.1 材料与方法 | 第19-20页 |
3.1.1 材料来源 | 第19页 |
3.1.2 CGR游走模型 | 第19-20页 |
3.1.3 特征向量和欧氏距离 | 第20页 |
3.2 结果分析及讨论 | 第20-25页 |
3.2.1 物种相似性分析 | 第20-23页 |
3.2.2 欧氏距离的层次聚类分析 | 第23-24页 |
3.2.3 比较分析 | 第24-25页 |
3.3 本章小结 | 第25-26页 |
第四章 基于四重特征指标的p53家族基因序列的层次聚类分析 | 第26-32页 |
4.1 材料与方法 | 第26-28页 |
4.1.1 材料来源 | 第26页 |
4.1.2 特征指标 | 第26-27页 |
4.1.3 数据规范化 | 第27-28页 |
4.1.4 特征向量和欧氏距离 | 第28页 |
4.2 结果与分析 | 第28-31页 |
4.2.1 相似性分析 | 第28-30页 |
4.2.2 p53家族基因序列层次聚类分析 | 第30-31页 |
4.3 本章小结 | 第31-32页 |
第五章 总结与展望 | 第32-33页 |
5.1 总结 | 第32页 |
5.2 工作展望 | 第32-33页 |
致谢 | 第33-34页 |
参考文献 | 第34-37页 |
附录1:作者在攻读硕士学位期间发表的论文及参加的学术活动 | 第37-38页 |
附录2:36条mRNA序列的E欧氏距离矩阵和e均方差矩阵 | 第38-40页 |