| 中文摘要 | 第9-19页 |
| ABSTRACT | 第19-28页 |
| DENOTATION | 第29-30页 |
| CHAPTER 1 CAUSAL DIAGRAMS THEORY | 第30-43页 |
| 1.1 CAUSAL DIAGRAMS | 第31-33页 |
| 1.2 Path implied in causal diagrams | 第33-34页 |
| 1.3 The d-Separation Rules Linking Causal Assumptions to Statistical Independencies | 第34-37页 |
| 1.4 do-calculus proposed by Judea Pearl | 第37-38页 |
| 1.5 BACK-DOOR AND FRONT-DOOR CRITERION | 第38页 |
| 1.6 INSTRUMENTAL VARIABLES | 第38-39页 |
| 1.7 Markov Blanket and its algorkhms | 第39-42页 |
| 1.8 Outline of the dissertation | 第42-43页 |
| CHAPTER 2 THEORY AND METHODOLOGY OF MATCHING ANDREGRESSION STRATEGY BASED ON CAUSAL INFERENCE | 第43-63页 |
| 2.1 Background | 第43-45页 |
| 2.2 Methods | 第45-50页 |
| 2.2.1 Matched case-control design under causal diagram | 第45-49页 |
| 2.2.2 Simulation | 第49-50页 |
| 2.3 Results | 第50-60页 |
| 2.4 Discussion | 第60-63页 |
| CHAPTER 3 OMIC BIOMARKERS SCREENING STRATEGY BASED ONCONDITIONAL INDEPENDENCE CRITERION | 第63-83页 |
| 3.1 Background | 第63-67页 |
| 3.2 Methods | 第67-73页 |
| 3.2.1 Markov Blanket-based repeated-fishing strategy (MBRFS) | 第67-70页 |
| 3.2.2 Simulation | 第70-72页 |
| 3.2.3 Application | 第72-73页 |
| 3.3 Results | 第73-78页 |
| 3.3.1 Simulation results | 第73-78页 |
| 3.3.2 Application results | 第78页 |
| 3.4 Discussion | 第78-83页 |
| CHAPTER 4 IDENTIFICATION AND CALCULATION OF PATHOGENICPATHWAY EFFECT BASED ON DO-CALCULUS | 第83-100页 |
| 4.1 Background | 第83-86页 |
| 4.2 Methods | 第86-91页 |
| 4.2.1 Pathogenic network simplification rules and calculation of causal effect | 第86-87页 |
| 4.2.2 Segmented series multiplication statistic | 第87-88页 |
| 4.2.3 Non-parametric permutation and bootstrap test | 第88-89页 |
| 4.2.4 Simulation | 第89-90页 |
| 4.2.5 Application | 第90-91页 |
| 4.3 RESULTS | 第91-97页 |
| 4.3.1 Simulation results | 第91-94页 |
| 4.3.2 Application results | 第94-97页 |
| 4.4 Discussion | 第97-100页 |
| CHAPTER 5 CONCLUSIONS | 第100-104页 |
| 5.1 Innovations | 第102页 |
| 5.2 Limitations | 第102-104页 |
| APPENDIX A | 第104-105页 |
| APPENDIX B | 第105-114页 |
| APPENDIX C | 第114-120页 |
| REFERENCE | 第120-128页 |
| ACKNOWLEDGEMENT | 第128-129页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第129-132页 |
| 学位论文平阅及答辩情况表 | 第132-133页 |
| 附英文发表论文 | 第133-157页 |
