家猪和野猪大脑组织的比较转录组研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-23页 |
| ·动物的驯化 | 第10-13页 |
| ·野猪与家猪 | 第13-15页 |
| ·大脑 | 第15-17页 |
| ·转录组测序 | 第17-23页 |
| ·转录组测序(RNA-seq) | 第17页 |
| ·RNA测序技术平台 | 第17-20页 |
| ·RNA-seq原理 | 第20页 |
| ·RNA-seq技术优势 | 第20-21页 |
| ·RNA-seq的应用 | 第21-23页 |
| 2 研究内容与目的意义 | 第23-24页 |
| 3 材料和方法 | 第24-38页 |
| ·实验样品采集 | 第24页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第24-25页 |
| ·主要仪器设备 | 第24-25页 |
| ·主要试剂 | 第25页 |
| ·试验方法 | 第25-38页 |
| ·Total RNA的提取 | 第25页 |
| ·Total RNA的质检 | 第25-26页 |
| ·高通量测序 | 第26-32页 |
| ·RNA-seq测序数据处理 | 第32-35页 |
| ·RNA-seq数据可靠性验证 | 第35-38页 |
| 4 结果与分析 | 第38-58页 |
| ·Total RNA提取结果 | 第38页 |
| ·荣昌猪和野猪大脑组织转录组特征分析 | 第38-45页 |
| ·基因组mapping结果 | 第38-41页 |
| ·可变剪切鉴定结果 | 第41页 |
| ·序列变异(SNV和INDELS)鉴定结果 | 第41-42页 |
| ·野猪和荣昌猪大脑组织转录组特征比较分析 | 第42-44页 |
| ·野猪和荣昌猪大脑组织转录组聚类分析 | 第44-45页 |
| ·荣昌猪和野猪大脑组织转录组差异分析 | 第45-57页 |
| ·荣昌猪和野猪大脑组织差异转录本鉴定 | 第45-46页 |
| ·荣昌猪和野猪大脑组织差异转录本功能分析 | 第46-57页 |
| ·测序结果的可靠性验证 | 第57-58页 |
| ·通过Q-PCR分析验证RNA-seq结果 | 第57-58页 |
| 5 讨论 | 第58-66页 |
| ·RNA-seq测序的优越性 | 第58-59页 |
| ·猪作为动物模型的原因 | 第59-60页 |
| ·荣昌猪和野猪大脑组织转录组特征与功能的关系 | 第60-61页 |
| ·荣昌猪和野猪大脑组织转录组差异与功能的关系 | 第61-65页 |
| ·免疫相关转录本差异与功能的关系 | 第61-63页 |
| ·神经传导相关转录本差异与功能的关系 | 第63页 |
| ·糖代谢相关转录本差异与功能的关系 | 第63-65页 |
| ·激素分泌相关转录本差异与功能的关系 | 第65页 |
| ·RNA-seq结果的可靠性 | 第65-66页 |
| 6 创新 | 第66页 |
| 7 结论 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第77页 |
