| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-22页 |
| 1. 解淀粉芽胞杆菌的研究进展 | 第10-15页 |
| ·国内外解淀粉芽胞杆菌的研发概况 | 第10-12页 |
| ·解淀粉芽胞杆菌的生防作用机理 | 第12-13页 |
| ·解淀粉芽胞杆菌在农业生产应用中面临的问题与展望 | 第13-14页 |
| ·解淀粉芽胞杆菌的基因功能及基因组学的研究进展 | 第14-15页 |
| 2. 基因组学与比较基因组学 | 第15-21页 |
| ·基因组学与比较基因组学的研究历史 | 第15-16页 |
| ·基因组测序技术的发展 | 第16页 |
| ·高通量测序的组装技术的介绍 | 第16-20页 |
| ·基因组学与比较基因组学研究的应用 | 第20-21页 |
| 3 本研究选题依据及意义 | 第21-22页 |
| 第二章 8株芽胞杆菌的鉴定及其生物活性差异比较 | 第22-38页 |
| 1. 实验材料 | 第23-24页 |
| ·实验菌株及拮抗病原菌 | 第23页 |
| ·培养基 | 第23-24页 |
| ·酶和引物 | 第24页 |
| ·其它试剂 | 第24页 |
| 2. 实验方法 | 第24-28页 |
| ·形态观察与染色 | 第24-25页 |
| ·8株芽胞杆菌的分子鉴定 | 第25-26页 |
| ·分泌几丁质酶能力测定 | 第26页 |
| ·分泌蛋白酶能力测定 | 第26-27页 |
| ·分泌嗜铁素能力测定 | 第27页 |
| ·生物膜形成能力测定 | 第27页 |
| ·芽胞杆菌对水稻纹枯病菌的抑菌活性测定 | 第27页 |
| ·芽胞杆菌胞外物质对水稻纹枯病菌的抑菌活性测定 | 第27-28页 |
| 3. 实验结果与分析 | 第28-37页 |
| ·8株菌株的形态学差异 | 第28-30页 |
| ·8株芽胞杆菌的分子鉴定 | 第30-31页 |
| ·分泌几丁质酶能力测定 | 第31页 |
| ·分泌蛋白酶能力测定 | 第31-32页 |
| ·分泌嗜铁素能力测定 | 第32-33页 |
| ·生物膜形成能力测定 | 第33-35页 |
| ·解淀粉芽胞杆菌拮抗水稻纹枯病菌的抑菌活性测定 | 第35页 |
| ·解淀粉芽胞杆菌胞外物质拮抗水稻纹枯病菌的抑菌活性测定 | 第35-37页 |
| 4 讨论 | 第37-38页 |
| 第三章 解淀粉芽胞杆菌全基因组测序 | 第38-48页 |
| 1 实验材料 | 第38-39页 |
| ·实验菌株 | 第38页 |
| ·培养基及主要试剂 | 第38-39页 |
| 2 实验方法 | 第39-42页 |
| ·解淀粉芽胞杆菌全基因组提取 | 第39-40页 |
| ·高通量测序与序列的拼接、组装及精细图绘制 | 第40-41页 |
| ·四株解淀粉芽胞杆菌基因预测 | 第41页 |
| ·4株解淀粉芽胞杆菌基因组伊枯草素类物质基因比对分析 | 第41-42页 |
| 3 实验结果 | 第42-46页 |
| ·四株解淀粉芽胞杆菌基因组DNA提取及检测 | 第42页 |
| ·四株解淀粉芽胞杆菌基因组测序与序列拼接结果初步统计 | 第42-45页 |
| ·基因预测结果 | 第45页 |
| ·4株解淀粉芽胞杆菌基因组伊枯草类物质基因簇比较分析结果 | 第45-46页 |
| 4 下一步工作展望 | 第46-48页 |
| 全文总结 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-56页 |
| 附录 | 第56-62页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第62-64页 |
| 致谢 | 第64页 |