摘要 | 第1-7页 |
ABSTRACT | 第7-11页 |
第一章 文献综述 | 第11-17页 |
·前言 | 第11页 |
·癌症研究相关数据库 | 第11-16页 |
·癌症组学相关数据库 | 第11-12页 |
·癌症相关基因或标记物数据库 | 第12-13页 |
·抗癌成分数据库 | 第13-14页 |
·其他数据库 | 第14-16页 |
·本文研究意义和主要研究内容 | 第16-17页 |
第二章 CancerHSP数据库的构建 | 第17-28页 |
·CancerHSP的设计原理 | 第17页 |
·开发流程 | 第17-22页 |
·数据收集 | 第18页 |
·化合物信息获取 | 第18-19页 |
·靶标预测 | 第19页 |
·药物ADME参数计算 | 第19-20页 |
·数据库存储结构设计 | 第20-22页 |
·数据库后台和网页的构建 | 第22页 |
·CancerHSP的使用 | 第22-24页 |
·搜索 | 第22-23页 |
·浏览 | 第23页 |
·下载和更新 | 第23-24页 |
·CancerHSP的数据统计 | 第24-26页 |
·化合物的ADME参数分布 | 第24-25页 |
·细胞系的组织分布 | 第25-26页 |
·CancerHSP的用户访问统计 | 第26页 |
·本章小结 | 第26-28页 |
第三章 以紫杉醇为例分析天然产物药物开发及抗癌机制 | 第28-36页 |
·含有紫杉醇的植物 | 第28-29页 |
·紫杉醇ADME参数分析 | 第29-30页 |
·紫杉醇蛋白质靶标 | 第30-33页 |
·GO富集分析 | 第32页 |
·通路(Pathway)富集分析 | 第32-33页 |
·紫杉醇抗癌活性分析 | 第33-35页 |
·对癌细胞的敏感性分析 | 第33-34页 |
·紫杉醇敏感细胞的组织定位 | 第34-35页 |
·本章小结 | 第35-36页 |
第四章 基于CancerHSP数据集预测药物对癌细胞系的敏感性 | 第36-42页 |
·实验材料 | 第36-37页 |
·实验数据集 | 第36页 |
·分子描述符计算 | 第36-37页 |
·实验方法和技术路线 | 第37-39页 |
·数据分割 | 第37页 |
·训练集和测试集构建 | 第37-38页 |
·随机森林建模算法(Random Forest) | 第38页 |
·模型评价 | 第38-39页 |
·结果和讨论 | 第39-41页 |
·模型性能 | 第39-41页 |
·预测CancerHSP中化合物对A549细胞系的敏感度 | 第41页 |
·本章小结 | 第41-42页 |
第五章 结论与展望 | 第42-44页 |
参考文献 | 第44-50页 |
附录 | 第50-61页 |
致谢 | 第61-63页 |
作者简介 | 第63-64页 |