| 英文缩略词 | 第1-5页 |
| 中文摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 前言 | 第7-14页 |
| 1 鼠类与人类关系紧密 | 第7页 |
| 2 鼠类是病毒的天然储藏库 | 第7-8页 |
| 3 目前我国对鼠源性病毒的研究状况 | 第8-9页 |
| 4 宏基因组学的优越性 | 第9-11页 |
| 5 鼠类肠道病毒的宏基因组研究进展 | 第11-13页 |
| 6 病毒宏基因组学的主要技术路线 | 第13页 |
| 7 课题的意义 | 第13-14页 |
| 材料与方法 | 第14-35页 |
| 1 材料 | 第14-21页 |
| 2 方法 | 第21-35页 |
| 结果 | 第35-50页 |
| 1 12份样品随机PCR的结果 | 第35-37页 |
| 2 测序结果及读段（reads）拼接分析 | 第37-38页 |
| 3 针对拼接得到的所有重叠群序列，进行了 BLASTx/n 的比对分析 | 第38-39页 |
| 4 对病毒相关的重叠群序列，根据具体的病毒科，进一步进行了病毒分类 | 第39-41页 |
| 5 各病毒科相关重叠群分析 | 第41-50页 |
| 讨论 | 第50-53页 |
| 结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 综述 | 第59-66页 |
| 参考文献 | 第63-66页 |
| 致谢 | 第66页 |