| 摘要 | 第1-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第6-22页 |
| 1 转录因子及其研究意义 | 第6-10页 |
| ·转录因子的定义与结构 | 第6-8页 |
| ·转录因子与原核生物转录调控 | 第8页 |
| ·转录因子调控转录的机制 | 第8页 |
| ·转录因子的研究意义 | 第8-10页 |
| ·转录因子与植物改良 | 第9页 |
| ·转录因子与疾病控制 | 第9-10页 |
| ·转录因子与致病微生物控制 | 第10页 |
| 2 论文选题依据 | 第10-16页 |
| ·枯草芽孢杆菌基因组与ylyA基因 | 第10-13页 |
| ·YlyA是DnaK抑制蛋白 | 第13-14页 |
| ·Smith-Waterman reports for YlyA强烈提示YlyA可能是DnaK抑制蛋白 | 第13页 |
| ·COG数据直接将YlyA描述为DnaK抑制蛋白 | 第13-14页 |
| ·YlyA在结构上具有DksA样C4型锌指结构 | 第14-16页 |
| ·Pfam蛋白数据库证据表明YlyA属于DksA/TraR家族成员 | 第14页 |
| ·UniProtKB/Swiss-Prot也预测了YlyA具有DksA C4型锌指结构 | 第14-15页 |
| ·Swiss-Prot/TrEMB数据库信息提示YlyA具有与DksA极为相似的C4型锌指(C4-type zinc finger)结构 | 第15-16页 |
| ·总结 | 第16页 |
| 3 DnaK研究进展 | 第16-18页 |
| ·dnak基因 | 第16-17页 |
| ·DnaK具有多种生理功能 | 第17-18页 |
| 4 DksA研究进展 | 第18-20页 |
| ·DksA是转录因子GreA的结构类似物 | 第18-19页 |
| ·ppGpp和iNTP对rRNA启动子的调节 | 第19-20页 |
| ·有文献报道的可与DksA相互作用的基因 | 第20页 |
| 5 本研究的内容和意义 | 第20-22页 |
| 第二章 ylyA'基因克隆及与ylyA序列比对分析 | 第22-33页 |
| 1 材料 | 第22-24页 |
| ·主要设备和仪器 | 第22页 |
| ·主要试剂 | 第22-23页 |
| ·菌株及培养基 | 第23页 |
| ·DNA marker与质粒载体 | 第23-24页 |
| 2. 方法 | 第24-28页 |
| ·模板制备 | 第24-25页 |
| ·引物设计 | 第25页 |
| ·PCR反应体系和反应条件 | 第25-26页 |
| ·PCR产物的纯化 | 第26页 |
| ·PCR产物的检测(琼脂糖凝胶电泳) | 第26-27页 |
| ·测序 | 第27-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-33页 |
| ·ylyA'全长序列的PCR扩增 | 第28页 |
| ·ylyA'序列 | 第28-29页 |
| ·ylyA与ylyA’序列比对(pairwise alignment) | 第29-30页 |
| ·序列翻译(BioEdit软件) | 第30-31页 |
| ·ORF(Open Reading Frame)分析 | 第31-33页 |
| 第三章 ylyA’的生物信息学分析 | 第33-43页 |
| 1. YlyA与YlyA'序列比对 | 第33页 |
| 2. 等电点与所带电荷 | 第33-34页 |
| 3. YlyA'是一个球形蛋白 | 第34-35页 |
| ·GlobPlot预测 | 第34-35页 |
| ·SMART/Pfam | 第35页 |
| 4. YlyA'蛋白不含有跨膜螺旋但含有疏水性区域 | 第35-37页 |
| ·跨膜螺旋分析 | 第35-36页 |
| ·疏水区域预测 | 第36-37页 |
| 5. 结构域分析 | 第37-39页 |
| 6. 功能预测 | 第39-43页 |
| 全文讨论 | 第43-45页 |
| 全文小结 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-51页 |
| 附录1 与YlyA具有相同功能的蛋白质及其微生物来源 | 第51-52页 |
| 附录2 各种生理L-α氨基酸的疏水性 | 第52-53页 |
| 附录3 Distance tree | 第53-55页 |
| Abstract | 第55-57页 |
| 致谢 | 第57页 |
