| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-19页 |
| ·分子生物学技术在水体微生物生态学的应用 | 第11-12页 |
| ·分析生物学研究方法 | 第12页 |
| ·变性梯度凝胶电泳（DGGE）研究进展 | 第12-15页 |
| ·DGGE 分离技术的原理 | 第13-14页 |
| ·PCR-DGGE 技术的优点和敏感性 | 第14-15页 |
| ·PCR-DGGE 技术的局限性 | 第15页 |
| ·DGGE 图谱的分析方法 | 第15-17页 |
| ·聚类分析法 | 第15-16页 |
| ·排序分析法 | 第16-17页 |
| ·多样性分析的应用 | 第17页 |
| ·本文研究内容及意义 | 第17-19页 |
| 第二章 真核浮游生物 18s rDNA 指纹图谱分析及群落结构多样性与环境因子的关系 | 第19-46页 |
| ·材料与方法 | 第19-22页 |
| ·千岛湖概况 | 第19-20页 |
| ·采样点设置 | 第20-21页 |
| ·样品的采集及预处理 | 第21页 |
| ·样品总 DNA 的提取 | 第21页 |
| ·样品的 PCR 扩增 | 第21-22页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第22页 |
| ·变性梯度凝胶电泳 | 第22-23页 |
| ·试剂溶液的配制 | 第22-23页 |
| ·理化指标的选取 | 第23-28页 |
| ·千岛湖营养盐时空变化 | 第24-28页 |
| ·千岛湖湖区真核浮游生物多样性分析 | 第28-29页 |
| ·真核浮游生物多样性指数分析及年变化趋势图 | 第29-38页 |
| ·Shannon 多样性指数（H）时空变化 | 第29-31页 |
| ·Simpson 优势度指数(D)时空变化 | 第31-32页 |
| ·物种数(S)时空变化 | 第32-34页 |
| ·Margalef 丰富度指数（R）时空变化 | 第34-36页 |
| ·Pielou 均匀度指数（J）时空变化 | 第36-38页 |
| ·真核浮游生物各多样性指数与环境因子的相关性分析 | 第38-44页 |
| ·全湖各多样性指数之间的相关性分析 | 第38页 |
| ·Shannon 多样性指数与环境因子的相关性分析 | 第38-39页 |
| ·Simpson 优势度指数与环境因子的相关性分析 | 第39-40页 |
| ·物种数（S）与环境因子的相关性分析 | 第40-41页 |
| ·Margalef 丰富度指数（R）与环境因子的相关性分析 | 第41-42页 |
| ·各站点 Pielou 均匀度指数（J）之间及与环境因子的相关性分析 | 第42-44页 |
| ·全年全湖真核多样性指数与环境因子的相关性分析 | 第44页 |
| ·讨论 | 第44-46页 |
| 第三章 原核浮游生物 16s rDNA 指纹图谱分析及群落结构多样性与环境因子的关系 | 第46-63页 |
| ·材料与方法 | 第46页 |
| ·千岛湖湖区原核浮游生物 DGGE 图谱分析 | 第46-47页 |
| ·原核浮游生物多样性指数分析及年变化趋势图 | 第47-56页 |
| ·Shannon 多样性指数（H）时空变化 | 第47-49页 |
| ·Simpson 优势度指数(D)时空变化 | 第49-50页 |
| ·物种数(S)时空变化 | 第50-52页 |
| ·Margalef 丰富度指数（R）时空变化 | 第52-54页 |
| ·Pielou 均匀度指数（J）时空变化 | 第54-56页 |
| ·原核浮游生物各多样性指数与环境因子的相关性分析 | 第56-62页 |
| ·全湖各多样性指数之间的相关性分析 | 第56页 |
| ·各站点 Shannon 多样性指数之间及与环境因子的相关性分析 | 第56-57页 |
| ·各站点 Simpson 优势度指数(D)之间及与环境因子的相关性分析 | 第57-58页 |
| ·各站点物种数（S）之间及与环境因子的相关性分析 | 第58-59页 |
| ·各站点 Margalef 丰富度指数（R）之间及与环境因子的相关性分析 | 第59-60页 |
| ·各站点 Pielou 均匀度指数（J）之间及与环境因子的相关性分析 | 第60-61页 |
| ·全年全湖原核多样性指数与环境因子的相关性分析 | 第61-62页 |
| ·讨论 | 第62-63页 |
| 第四章 显著条带测序以及数字化图谱的统计学分析 | 第63-94页 |
| ·材料方法 | 第63-64页 |
| ·统计学分析 | 第64-65页 |
| ·主成分分析简介 | 第64-65页 |
| ·典型对应分析简介 | 第65页 |
| ·结果 | 第65-81页 |
| ·显著条带分析 | 第65-81页 |
| ·种群结构的聚类分析和主成分分析 | 第81-90页 |
| ·样品的条带分布 | 第81-84页 |
| ·聚类分析 | 第84-85页 |
| ·主成分分析（PCA） | 第85-89页 |
| ·典型对应分析（CCA） | 第89-90页 |
| ·讨论 | 第90-94页 |
| ·原核浮游生物测序结果和系统发生关系 | 第90-91页 |
| ·真核浮游生物测序结果和系统发生关系 | 第91-92页 |
| ·聚类分析和主成分分析结果讨论 | 第92页 |
| ·典型对应分析结果讨论 | 第92-94页 |
| 结论 | 第94-96页 |
| 参考文献 | 第96-103页 |
| 致谢 | 第103-104页 |
