| 中文摘要 | 第1-15页 |
| ABSTRACT | 第15-20页 |
| 第一部分 秸秆覆盖还田与施肥对水稻土微生物学特性的影响 | 第20-97页 |
| 1. 文献综述 | 第20-34页 |
| ·免耕方式的研究现状 | 第20-21页 |
| ·免耕方式的简介 | 第20-21页 |
| ·残茬免耕和秸秆覆盖的研究现状 | 第21页 |
| ·有机与无机肥料配施研究进展 | 第21-24页 |
| ·有机无机肥料配合施用的原因 | 第21-22页 |
| ·有机无机肥料配合施用对土壤肥力的影响 | 第22-23页 |
| ·有机肥无机肥配施对作物生长和产量的影响 | 第23-24页 |
| ·有机肥无机肥配施对氮肥利用率的影响 | 第24页 |
| ·有机无机肥的施用对土壤微生物的影响 | 第24-28页 |
| ·长期施肥对土壤微生物生物量的影响 | 第25-26页 |
| ·长期施肥对土壤微生物群落结构和多样性的影响 | 第26-27页 |
| ·长期施肥对土壤酶活性的影响 | 第27-28页 |
| ·土壤微生物生态学研究方法 | 第28-33页 |
| ·微生物的纯培养方法 | 第28-29页 |
| ·土壤微生物生物量 | 第29页 |
| ·土壤酶 | 第29-30页 |
| ·生物标记物 | 第30-31页 |
| ·分子生物技术 | 第31-33页 |
| ·末端限制性片段长度多态性 | 第31页 |
| ·随机扩增多态性分析 | 第31-32页 |
| ·单链构象多态性分析 | 第32页 |
| ·变性梯度凝胶电泳 | 第32-33页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对水稻土微生物学特性研究的目的与意义 | 第33-34页 |
| 2. 实验材料与研究方法 | 第34-45页 |
| ·实验设计 | 第34页 |
| ·取样方法 | 第34-35页 |
| ·土壤中可培养微生物数量、微生物量碳和氮的测定 | 第35页 |
| ·土壤中可培养微生物数量的测定 | 第35页 |
| ·土壤微生物生物量碳和氮的测定 | 第35页 |
| ·土壤不同酶活性的测定 | 第35页 |
| ·土壤微生物群落结构多样性分析 | 第35-42页 |
| ·土壤总基因组DNA提取 | 第35-36页 |
| ·土壤细菌16s rDNA扩增 | 第36-37页 |
| ·细菌扩增引物 | 第36页 |
| ·细菌扩增程序 | 第36-37页 |
| ·土壤真菌ITS的扩增 | 第37-38页 |
| ·真菌ITS扩增引物 | 第37页 |
| ·真菌ITS扩增程序 | 第37-38页 |
| ·土壤固氮菌nif-H基因的PCR扩增 | 第38-40页 |
| ·固氮菌nif-H基因扩增引物 | 第38页 |
| ·固氮菌nif-H基因扩增程序 | 第38-40页 |
| ·土壤氨氧化细菌16S rDNA CTO的PCR扩增 | 第40-41页 |
| ·氨氧化细菌扩增引物 | 第40页 |
| ·氨氧化细菌扩增程序 | 第40-41页 |
| ·土壤氨氧化古菌Arch-amoA基因片段的PcR扩增 | 第41-42页 |
| ·氨氧化古菌Arch-amoA基因扩增引物 | 第41页 |
| ·氨氧化古菌扩增程序 | 第41-42页 |
| ·土壤微生物变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第42-44页 |
| ·DGGE操作步骤 | 第42-43页 |
| ·DGGE硝酸银染色法具体步骤 | 第43-44页 |
| ·DGGE条带回收、克隆和测序 | 第44页 |
| ·数据处理 | 第44-45页 |
| ·DGGE指纹图谱的生物信息学分析 | 第44页 |
| ·相似性分析及系统进化分析 | 第44页 |
| ·差异性分析 | 第44-45页 |
| 3. 结果与分析 | 第45-84页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤微生物数量的影响 | 第45-46页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤微生物生物量碳、氮的影响 | 第46-48页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤酶活性的影响 | 第48-51页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤脲酶活性的影响 | 第48-49页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤转化酶活性的影响 | 第49-50页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤多酚氧化酶活性的影响 | 第50页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤酸性磷酸酶活性的影响 | 第50-51页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤微生物群落结构的影响 | 第51-84页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对细菌群落结构的影响 | 第51-58页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥土壤细菌DGGE图谱分析 | 第51-52页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥土壤细菌多样性分析 | 第52-54页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥土壤细菌群落相似性分析 | 第54-55页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥土壤细菌DGGE条带测序分析 | 第55-58页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对真菌群落结构的影响 | 第58-64页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥土壤真菌DGGE图谱分析 | 第58-59页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥土壤真菌多样性分析 | 第59-60页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥土壤真菌群落相似性分析 | 第60-61页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥土壤真菌DGGE条带测序分析 | 第61-64页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对固氮基因nifH的影响 | 第64-71页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥固氮基因nifH DGGE图谱分析 | 第64-65页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥土壤固氮基因nifH多样性分析 | 第65-66页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥固氮基因nifH聚类分析 | 第66-68页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥固氮基因nifH DGGE条带测序分析 | 第68-71页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对氨氧化细菌群落结构的影响 | 第71-77页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥氨氧化细菌DGGE图谱分析 | 第71-72页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥氨氧化细菌多样性分析 | 第72-73页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥氨氧化细菌DGGE聚类分析 | 第73-74页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥氨氧化细菌DGGE测序分析 | 第74-77页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对氨氧化古菌群落结构的影响 | 第77-84页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥氨氧化古菌DGGE图谱分析 | 第77页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥氨氧化古菌DGGE图谱多样性分析 | 第77-79页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥氨氧化古菌聚类分析 | 第79-81页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥氨氧化古菌DGGE优势条带测序分析 | 第81-84页 |
| 4. 讨论 | 第84-93页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对水稻土微生物数量和微生物生物量的影响 | 第84-85页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对水稻土微生物数量的影响 | 第84页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对水稻土微生物生物量碳、氮的影响 | 第84-85页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对水稻土土壤酶活性的影响 | 第85-86页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对水稻土微生物群落结构的影响 | 第86-93页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对水稻土细菌群落结构的影响 | 第86-88页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对水稻土真菌群落结构的影响 | 第88-89页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对水稻土固氮基因nifH多样性的影响 | 第89-90页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对水稻土氨氧化细菌群落结构的影响 | 第90-91页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对水稻土氨氧化古菌群落结构的影响 | 第91-93页 |
| 5. 结论 | 第93-97页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤微生物数量、微生物生物量碳、氮与土壤酶活的影响 | 第93页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤微生物群落结构的影响 | 第93-95页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤细菌群落结构的影响 | 第93-94页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤真菌群落结构的影响 | 第94页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤固氮基因nifH多样性的影响 | 第94页 |
| ·秸秆覆盖还田与施肥对土壤氨氧化细菌和氨氧化古菌群落结构的影响 | 第94-95页 |
| ·本实验研究创新之处 | 第95-96页 |
| ·研究展望 | 第96-97页 |
| 第二部分 秸秆翻埋还田与施肥对氨氧化细菌和氨氧化古菌微生物学特性的影响 | 第97-138页 |
| 1. 文献综述 | 第97-103页 |
| ·硝化作用 | 第97-99页 |
| ·硝化作用简介 | 第97页 |
| ·硝化作用的影响因素 | 第97-98页 |
| ·硝化作用过程中的主要微生物 | 第98-99页 |
| ·施用钾肥对土壤及氨氧化微生物的影响 | 第99-100页 |
| ·土壤因素对氨氧化微生物的影响 | 第100-101页 |
| ·amoA基因片段和16SrDNA基因在氨氧化菌研究中的应用 | 第101-102页 |
| ·amoA基因片段在氨氧化菌研究中的应用 | 第101-102页 |
| ·16SrDNA基因在氨氧化菌研究中的应用 | 第102页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对氨氧化细菌和氨氧化古菌微生物特性的影响研究的目的与意义 | 第102-103页 |
| 2. 实验材料与研究方法 | 第103-108页 |
| ·实验设计 | 第103-104页 |
| ·取样方法 | 第104页 |
| ·土壤pH值测定 | 第104页 |
| ·土壤铵态氮硝态氮的测定 | 第104页 |
| ·土壤微生物生物量碳和氮的测定 | 第104-105页 |
| ·土壤不同酶活性的测定 | 第105页 |
| ·土壤氨氧化细菌和氨氧化古菌群落结构多样性分析 | 第105-107页 |
| ·土壤总DNA的提取 | 第105页 |
| ·土壤氨氧化细菌16SrDNA CTO的PCR扩增 | 第105-106页 |
| ·氨氧化细菌引物 | 第105页 |
| ·氨氧化细菌PCR程序 | 第105-106页 |
| ·土壤氨氧化古菌Arch-amoA基因片段的PcR扩增 | 第106-107页 |
| ·氨氧化古菌Arch-amoA基因引物 | 第106页 |
| ·氨氧化古菌PCR程序 | 第106-107页 |
| ·土壤微生物变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第107-108页 |
| ·数据处理 | 第108页 |
| ·DGGE指纹图谱的生物信息学分析 | 第108页 |
| ·相似性分析及细菌系统进化分析 | 第108页 |
| ·差异性及相关性分析 | 第108页 |
| 3. 结果与分析 | 第108-130页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对土壤铵态氮和硝态氮的影响 | 第108-110页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对微生物生物量碳和生物量氮的影响 | 第110-112页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对土壤酶活的影响 | 第112-117页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对土壤脲酶的影响 | 第112-113页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对土壤转化酶的影响 | 第113页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对土壤磷酸酶活性的影响 | 第113-114页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对多酚氧化酶的影响 | 第114-115页 |
| ·土壤微生物量、酶活性与土壤铵态氮、硝态氮和pH的相关性分析 | 第115-117页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对氨氧化细菌的影响 | 第117-124页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥氨氧化细菌DGGE图谱分析 | 第117-118页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥氨氧化细菌DGGE图谱多样性分析 | 第118-119页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥氨氧化细菌群类结构聚类分析 | 第119-121页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥氨氧化细菌DGGE测序分析 | 第121-124页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对氨氧化古菌的影响 | 第124-130页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥氨氧化古菌DGGE图谱分析 | 第124-125页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥氨氧化古菌DGGE图谱多样性分析 | 第125-126页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥氨氧化古菌DGGE图谱聚类分析 | 第126-127页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥氨氧化古菌DGGE优势条带测序分析 | 第127-130页 |
| 4. 讨论 | 第130-135页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对水稻土硝态氮、铵态氮的影响 | 第130页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对水稻土微生物生物量碳氮的影响 | 第130-131页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对水稻土土壤酶活性的影响 | 第131-132页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对水稻土氨氧化细菌和氨氧化古菌群落结构的影响 | 第132-135页 |
| ·秸秆翻埋还田和施肥对水稻土氨氧化细菌群落结构的影响 | 第132-133页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对水稻土氨氧化古菌群落结构的影响 | 第133-135页 |
| 5. 结论 | 第135-138页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对土壤硝态氮、铵态氮、微生物生物量碳、氮与土壤酶活的影响 | 第135页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对氨氧化细菌群落结构的影响 | 第135-136页 |
| ·秸秆翻埋还田与施肥对土壤氨氧化古菌群落结构的影响 | 第136页 |
| ·本实验研究创新之处 | 第136-137页 |
| ·研究展望 | 第137-138页 |
| 参考文献 | 第138-152页 |
| 致谢 | 第152-153页 |
| 攻读博士学位期间发表论文情况 | 第153页 |
