| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 1 绪论 | 第11-25页 |
| ·被子植物叶绿体基因组研究现状 | 第12-21页 |
| ·被子植物叶绿体基因组的基本结构 | 第12-13页 |
| ·叶绿体基因组序列测定方法的发展 | 第13-14页 |
| ·被子植物叶绿体基因组结构变异 | 第14-18页 |
| ·被子植物叶绿体基因丢失 | 第18-19页 |
| ·叶绿体系统发育基因组学研究进展 | 第19-20页 |
| ·叶绿体基因组在植物条形码和近缘类群系统发育研究中的应用 | 第20-21页 |
| ·比较叶绿体基因组在居群生物学中的应用 | 第21页 |
| ·蜡梅科研究现状 | 第21-23页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第23-25页 |
| 2 蜡梅科叶绿体基因组进化 | 第25-47页 |
| ·材料和方法 | 第26-28页 |
| ·材料选择和DNA提取 | 第26页 |
| ·引物设计、PCR扩增和测序 | 第26页 |
| ·基因注释 | 第26-27页 |
| ·叶绿体基因组结构变化检测 | 第27-28页 |
| ·叶绿体基因组的分化 | 第28页 |
| ·碱基替换分析 | 第28页 |
| ·结果 | 第28-42页 |
| ·蜡梅科叶绿体基因组的大小与结构 | 第28-36页 |
| ·编码区的微结构变化 | 第36-38页 |
| ·倒位变化 | 第38页 |
| ·直接重复变化 | 第38-39页 |
| ·插入与缺失的变异 | 第39-40页 |
| ·蜡梅叶绿体基因组的序列分化 | 第40页 |
| ·蜡梅科叶绿体基因组的编码区碱基替换分析 | 第40-42页 |
| ·讨论 | 第42-46页 |
| ·叶绿体基因组结构进化 | 第42页 |
| ·叶绿体基因组的微结构和进化 | 第42-44页 |
| ·序列分化与物种形成 | 第44-45页 |
| ·蜡梅科中ycf1基因的进化 | 第45-46页 |
| ·本章小结 | 第46-47页 |
| 3 被子植物高变叶绿体基因标记开发与应用 | 第47-72页 |
| ·材料和方法 | 第48-53页 |
| ·属内叶绿体基因组的收集与高分辨率的片段开发 | 第48-50页 |
| ·引物设计与通用性检测 | 第50页 |
| ·片段变异性评估 | 第50-52页 |
| ·高变叶绿体基因标记在桃类研究中的应用 | 第52-53页 |
| ·结果 | 第53-68页 |
| ·叶绿体基因组中高变片段的鉴别 | 第53页 |
| ·引物通用性的验证结果 | 第53-63页 |
| ·Nelumbo、Panax和Prunus三个属中21个片段多态性 | 第63页 |
| ·桃类植物21个高变片段的验证结果 | 第63-68页 |
| ·讨论 | 第68-71页 |
| ·本章小结 | 第71-72页 |
| 结论 | 第72-73页 |
| 问题与展望 | 第73-75页 |
| 参考文献 | 第75-88页 |
| 附录 | 第88-110页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第110-111页 |
| 致谢 | 第111-112页 |