| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-6页 |
| 目录 | 第6-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-12页 |
| ·课题的研究背景及意义 | 第9-11页 |
| ·生物信息学简介 | 第10页 |
| ·目前生物信息学研究的热点领域 | 第10-11页 |
| ·论文的主要工作与创新 | 第11页 |
| ·论文的组织 | 第11-12页 |
| 第二章 蛋白质二级结构预测 | 第12-21页 |
| ·蛋白质二级结构简介(secondary structure) | 第12-15页 |
| ·蛋白质的分子结构 | 第12-13页 |
| ·蛋白质的二级结构 | 第13-15页 |
| ·蛋白质二级结构预测的意义 | 第15-16页 |
| ·蛋白质二级结构预测的方法 | 第16-19页 |
| ·预测方法的分类 | 第16-17页 |
| ·在线预测方法服务资源 | 第17-19页 |
| ·蛋白质二级结构预测存在的问题 | 第19-20页 |
| ·本章小结 | 第20-21页 |
| 第三章 马铃薯蛋白质二级结构预测中数据的来源 | 第21-29页 |
| ·引言 | 第21页 |
| ·生物信息数据库和蛋白质数据库 | 第21-24页 |
| ·生物信息数据库 | 第21-22页 |
| ·蛋白质数据库 | 第22-24页 |
| ·马铃薯生物信息数据库 | 第24-25页 |
| ·马铃薯生物数据来源、格式及其内容 | 第24页 |
| ·数据的获取 | 第24-25页 |
| ·数据的存储 | 第25页 |
| ·二级结构预测评测数据和测试数据的来源 | 第25-28页 |
| ·评测数据来源 | 第25-28页 |
| ·测试数据的来源 | 第28页 |
| ·本章小结 | 第28-29页 |
| 第四章 基于神经网络的马铃薯蛋白质二级结构预测 | 第29-43页 |
| ·马铃薯蛋白质二级结构预测模型 | 第29-32页 |
| ·传统神经网络预测模型 | 第29-30页 |
| ·多神经网络预测模型 | 第30-32页 |
| ·神经网络预测算法 | 第32-35页 |
| ·BP算法 | 第32-33页 |
| ·动量法和学习率自适应调整策略 | 第33-34页 |
| ·遗传算法(GA)优化 | 第34-35页 |
| ·氨基酸序列输入编码方式 | 第35-40页 |
| ·编码方式 | 第36-38页 |
| ·本系统神经网络输入编码方式 | 第38-40页 |
| ·二级结构预测模型评测算法及精度衡量结果 | 第40-42页 |
| ·模型评测算法 | 第40-41页 |
| ·精度衡量结果 | 第41-42页 |
| ·本章小结 | 第42-43页 |
| 第五章 马铃薯蛋白质二级结构预测模型的实现及应用 | 第43-56页 |
| ·马铃薯蛋白质二级结构预测模型 | 第43-52页 |
| ·二级结构预测模型 | 第43页 |
| ·蛋白质二级结构预测模块的实现 | 第43-52页 |
| ·马铃薯蛋白质二级结构预测结果和分析 | 第52-55页 |
| ·已知二级结构的马铃薯蛋白质数据预测 | 第52-53页 |
| ·未知二级结构的马铃薯蛋白质数据预测 | 第53-55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 第六章 结束语 | 第56-58页 |
| ·总结 | 第56页 |
| ·进一步工作 | 第56-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-63页 |
| 附录A 攻读学位期间发表论文目录 | 第63-64页 |
| 附录B INSDSeqxml文件的DTD模型 | 第64-65页 |
| 附录C 马铃薯生物信息数据格式 | 第65-66页 |
| 附录D 数据预处理程序代码 | 第66页 |