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生物序列及其索引的压缩存储技术的研究与实现

摘要第1-4页
Abstract第4-8页
第1章 绪论第8-18页
   ·课题背景第8-9页
   ·国内外综述第9-16页
     ·传统的数据压缩方法第9-11页
     ·生物序列数据的压缩算法第11-13页
     ·生物序列索引结构第13-16页
   ·本文的研究目的和意义第16-17页
   ·本文的内容安排第17-18页
第2章 生物序列的压缩技术第18-26页
   ·生物序列压缩特点第18页
   ·并行压缩算法第18-24页
     ·结构并行第18-19页
     ·单个处理机对序列片段的压缩第19-23页
     ·归并生成全局字典第23-24页
   ·压缩与解压缩第24-25页
   ·本章小结第25-26页
第3章 压缩的分层存储索引结构第26-39页
   ·分层存储索引结构第26-30页
     ·建立思想第27-29页
     ·索引的存储结构第29-30页
   ·比特压缩优化存储第30-34页
     ·分层索引结构特点第30页
     ·比特压缩存储第30-34页
   ·子后缀树的存储结构第34-36页
   ·后缀数组存储第36-37页
   ·直接存储法存储第37-38页
   ·本章小结第38-39页
第4章 搜索技术第39-47页
   ·结构并行的搜索技术第39-40页
   ·比特压缩存储的搜索算法第40-43页
   ·后缀树的搜索算法第43-45页
     ·精确字符串匹配第43-44页
     ·近似字符串匹配第44-45页
   ·后缀数组搜索算法第45页
   ·本章小结第45-47页
第5章 实验结果及分析第47-54页
   ·生物序列压缩第47-48页
     ·单个处理机上的压缩第47-48页
     ·多个处理机上并行压缩第48页
   ·分层索引几种存储方式的压缩效果第48-52页
   ·搜索方法第52-53页
   ·本章小结第53-54页
结论第54-55页
参考文献第55-60页
致谢第60页

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