生物序列及其索引的压缩存储技术的研究与实现
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 第1章 绪论 | 第8-18页 |
| ·课题背景 | 第8-9页 |
| ·国内外综述 | 第9-16页 |
| ·传统的数据压缩方法 | 第9-11页 |
| ·生物序列数据的压缩算法 | 第11-13页 |
| ·生物序列索引结构 | 第13-16页 |
| ·本文的研究目的和意义 | 第16-17页 |
| ·本文的内容安排 | 第17-18页 |
| 第2章 生物序列的压缩技术 | 第18-26页 |
| ·生物序列压缩特点 | 第18页 |
| ·并行压缩算法 | 第18-24页 |
| ·结构并行 | 第18-19页 |
| ·单个处理机对序列片段的压缩 | 第19-23页 |
| ·归并生成全局字典 | 第23-24页 |
| ·压缩与解压缩 | 第24-25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 第3章 压缩的分层存储索引结构 | 第26-39页 |
| ·分层存储索引结构 | 第26-30页 |
| ·建立思想 | 第27-29页 |
| ·索引的存储结构 | 第29-30页 |
| ·比特压缩优化存储 | 第30-34页 |
| ·分层索引结构特点 | 第30页 |
| ·比特压缩存储 | 第30-34页 |
| ·子后缀树的存储结构 | 第34-36页 |
| ·后缀数组存储 | 第36-37页 |
| ·直接存储法存储 | 第37-38页 |
| ·本章小结 | 第38-39页 |
| 第4章 搜索技术 | 第39-47页 |
| ·结构并行的搜索技术 | 第39-40页 |
| ·比特压缩存储的搜索算法 | 第40-43页 |
| ·后缀树的搜索算法 | 第43-45页 |
| ·精确字符串匹配 | 第43-44页 |
| ·近似字符串匹配 | 第44-45页 |
| ·后缀数组搜索算法 | 第45页 |
| ·本章小结 | 第45-47页 |
| 第5章 实验结果及分析 | 第47-54页 |
| ·生物序列压缩 | 第47-48页 |
| ·单个处理机上的压缩 | 第47-48页 |
| ·多个处理机上并行压缩 | 第48页 |
| ·分层索引几种存储方式的压缩效果 | 第48-52页 |
| ·搜索方法 | 第52-53页 |
| ·本章小结 | 第53-54页 |
| 结论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-60页 |
| 致谢 | 第60页 |