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猪黑素皮质素受体1(MC1R)基因与毛色表型相关及5UTR变异研究

摘要第1-6页
Abstract第6-10页
1 引言第10-17页
   ·毛色遗传的研究现状第10-11页
   ·MC1R基因的研究第11-13页
     ·MC1R基因的作用机理第11页
     ·MC1R基因的研究现状第11-13页
   ·试验中所涉及的分子标记方法第13-14页
     ·单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,缩写SNP)第13页
     ·限制性片断长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism缩写RFLP)第13-14页
     ·单链构象多态性(Single-Strand Conformational Polymorphism缩写SSCP)第14页
   ·高GC含量PCR第14-16页
   ·本研究目的意义及主要内容第16-17页
     ·本研究目的意义第16页
     ·研究的主要内容第16-17页
2 材料与方法第17-27页
   ·实验材料第17-20页
     ·试验猪样品来源及采样方法第17页
     ·药品种类第17页
     ·试剂的配制及保存第17-18页
     ·主要仪器设备第18-19页
     ·主要分析工具软件及在线分析网站第19-20页
   ·试验方法第20-27页
     ·猪耳及尾组织DNA的提取第20-21页
     ·编码区序列比对第21页
     ·引物的设计与合成第21页
     ·PCR扩增第21-23页
     ·PCR-RFLP确定MCIR基因编码区基因型第23-24页
     ·PCR-SSCP确定MCIR基因编码区基因型第24-26页
     ·不同毛色品种猪5'UTR多态性筛查第26页
     ·物种间MCIR基因5'UTR系统聚类分析第26-27页
3 结果分析第27-36页
   ·猪样品DNA提取结果第27页
   ·编码区序列比对结果第27-28页
   ·PCR-RFLP确定编码区基因型第28-30页
     ·PCR扩增结果第28-29页
     ·G1197A和G1554A突变位位点PCR-RFLP分析结果第29-30页
   ·PCR-SSCP确定MC1R基因编码区基因型第30-32页
     ·PCR扩增结果第30页
     ·nt894insCCC和C1318T突变位点SSCP分析结果第30-31页
     ·序列测定第31-32页
   ·长白、大自、杜洛克猪MCIR基因5'UTR多态性分析第32-34页
     ·PCR扩增结果第32页
     ·扩增片断序列的测定第32-33页
     ·PCR-RFLP确定MC1R基因5'UTR基因型第33-34页
   ·物种间MC1R基因遗传距离和系统聚类图第34-36页
     ·不同山羊和绵羊品种5'UTR扩增第34页
     ·不同毛色品种山羊、绵羊5'UTR扩增片断序列的测定第34-35页
     ·物种间MC1R基因5'UTR系统聚类分析结果第35-36页
4 讨论第36-42页
   ·样品DNA的提取第36页
   ·PCR扩增第36-39页
     ·模板的质量第36页
     ·引物的设计、使用和保存第36-37页
     ·引物和dNTP的浓度第37页
     ·退火温度第37页
     ·退火时间第37页
     ·循环数第37-38页
     ·高GC含量PCR第38-39页
   ·影响SSCP的因素第39-40页
     ·PCR扩增产物第39页
     ·聚丙烯酰胺凝胶成分和浓度第39-40页
     ·电泳条件第40页
   ·MC1R基因多态与猪毛色的关系第40-41页
     ·MC1R基因多态第40页
     ·G668C、C1318T和G1554A突变与杜洛克的红毛色存在相关第40-41页
     ·nt894insCC与长白、大白白毛色存在相关第41页
   ·5'UTRG296A,A544G和T129C突变可能与萨伏克黑头和四肢表型存在相关第41-42页
5 结论第42-43页
参考文献第43-46页
在读期间发表的论文第46-52页
作者简历第52-53页
致谢第53页

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