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柿及其部分近缘种mtDNA和cpDNA多态性分析

摘要第1-11页
Abstract第11-14页
缩略词表第14-15页
第一章 课题的提出与文献综述第15-44页
   ·课题的提出第15-17页
   ·柿种质资源和育种研究进展第17-23页
     ·柿近缘野生种第17页
     ·柿品种资源第17-18页
     ·柿品种分类第18-19页
     ·柿系统进化第19-20页
     ·柿育种研究第20-22页
       ·引种筛选第20页
       ·芽变选种第20-21页
       ·杂交育种第21-22页
     ·柿甜涩遗传规律第22-23页
   ·高等植物胞质基因组研究进展第23-39页
     ·线粒体基因组研究进展第23-28页
       ·线粒体基因组结构特点第23-24页
       ·线粒体基因组功能第24页
       ·线粒体基因组起源与进化第24-25页
       ·线粒体基因组变异特点第25页
       ·线粒体基因组在分子系统学上的应用第25-27页
       ·线粒体基因组其他研究领域第27-28页
     ·叶绿体基因组研究进展第28-34页
       ·叶绿体基因组的结构特点第28-29页
       ·叶绿体基因组功能第29页
       ·叶绿体基因组起源与进化第29-30页
       ·叶绿体基因组的变异特点第30-31页
       ·叶绿体基因组在植物系统学研究中的应用第31-34页
     ·植物胞质基因组遗传方式第34页
     ·胞质基因组的研究方法第34-38页
       ·RFLP分析第35页
       ·PCR-RFLP分析第35-36页
       ·SSR分析第36-37页
       ·基因组序列测定第37-38页
       ·其他胞质基因组分子标记第38页
     ·胞质基因组的研究优势和局限性第38-39页
   ·分子标记概述第39-41页
   ·本研究的目的、意义和内容第41-44页
     ·研究目的和意义第41-43页
     ·研究内容第43-44页
第二章 部分柿属植物mtDNA非编码区扩增片段多态性分析第44-54页
   ·前言第44页
   ·材料与方法第44-48页
     ·仪器及试剂耗材第44-45页
     ·试材第45页
     ·样品采集第45页
     ·DNA提取第45-47页
     ·DNA模板浓度与质量检测第47-48页
     ·mtDNA基因间隔区和内含子扩增第48页
     ·数据分析第48页
   ·结果与分析第48-51页
     ·mtDNA通用引物PCR扩增第48-50页
     ·聚类分析第50-51页
   ·讨论第51-54页
     ·mtDNA分析应用范围第51-52页
     ·柿的起源第52-53页
     ·原产中国柿种质亲缘关系第53-54页
第三章 部分柿属植物cpDNA PCR-RFLP分析第54-65页
   ·前言第54页
   ·材料与方法第54-56页
     ·仪器及试剂耗材第54页
     ·试材第54-56页
     ·DNA提取第56页
     ·DNA质量检测第56页
     ·PCR扩增和限制性酶切第56页
     ·数据分析第56页
   ·结果与分析第56-60页
     ·柿属植物种间及柿种内cpDNA PCR-RFLP的多态性第56-59页
     ·柿与供试其他柿属植物种间的亲缘关系第59-60页
   ·讨论第60-65页
     ·cpDNA PCR-RFLP的应用范围第60-62页
     ·美洲柿的分类学地位第62-63页
     ·金枣柿的分类学地位第63-64页
     ·柿属植物系统进化第64-65页
第四章 柿属植物cpDNA trnS-trnfM区域序列分析第65-76页
   ·前言第65-66页
   ·材料与方法第66-70页
     ·仪器及试剂耗材第66页
     ·试材第66页
     ·DNA提取第66-67页
     ·质量检测第67页
     ·trnS-trnfM区域PCR扩增第67页
     ·PCR产物检测第67页
     ·trnS-trnfM PCR扩增产物测序第67-70页
       ·目的片段回收第67-68页
       ·PCR产物克隆第68页
       ·感受态细胞制备第68页
       ·转化第68-69页
       ·质粒DNA的提取第69页
       ·阳性克隆检测第69-70页
       ·测序与序列分析第70页
     ·序列比对和聚类分析第70页
   ·结果与分析第70-73页
     ·柿属植物cpDNA trnS-trnfM区域的通用引物扩增及其序列分析第70-72页
     ·基于cpDNA trnS-trnfM区域序列变异的柿属植物系统发育分析第72-73页
   ·讨论第73-76页
     ·trnS-trnfM区域测序在系统发育研究中的应用第73-74页
     ·柿属植物cpDNA分析结果比较第74-75页
     ·柿种内水平trnS-trnfM区域序列分析第75-76页
第五章 部分柿属植物mtDNA ORF25区域测序及cpSSR通用性初探第76-82页
   ·前言第76-77页
   ·材料与方法第77-78页
     ·试材第77页
     ·DNA提取第77页
     ·质量检测第77页
     ·PCR扩增第77页
     ·ORF25区域目的片段的克隆第77页
     ·数据分析第77-78页
   ·结果与分析第78-80页
     ·ORF25区域序列比较第78-79页
     ·mtDNA ORF25区域的系统发育分析第79-80页
     ·cpSSR引物扩增检测第80页
   ·讨论第80-82页
     ·ORF25区域分析第80-81页
     ·cpSSR的通用性第81-82页
第六章 磨盘柿×罗田甜柿F_1代遗传分析第82-95页
   ·前言第82页
   ·材料与方法第82-86页
     ·仪器及试剂耗材第82-83页
     ·试材第83页
     ·DNA提取第83页
     ·质量检测第83页
     ·人工授粉第83页
     ·荧光显微镜观察第83页
     ·幼胚培养第83-85页
     ·RAPD和SSR分析第85-86页
     ·数据分析第86页
   ·结果与分析第86-89页
     ·花粉萌发和授粉相关数据统计第86页
     ·RAPD和SSR分析第86-89页
     ·与其他种质比较分析第89页
   ·讨论第89-95页
     ·磨盘柿结实方式第89-90页
     ·甜柿育种亲本的选择第90-91页
     ·中国雄性资源的利用第91-92页
     ·F_1杂种植株的鉴定第92-93页
     ·其他原产中国甜柿种质的起源第93-95页
第七章 总讨论第95-101页
   ·研究方法第95-96页
   ·研究对象第96-97页
   ·种间系统关系第97-98页
   ·柿种内遗传关系第98页
   ·柿种质创新第98-99页
   ·研究展望第99-101页
参考文献第101-121页
附录I mtDNA通用引物序列及其扩增条件第121-122页
附录II mtDNA分析26份供试材料任意两个样品间的相似指数第122-123页
附录III 扩增柿属植物cpDNA所选用通用引物序列及扩增条件第123-124页
附录IV 23个柿品种及其6个近缘种10个cpDNA扩增区域酶切数据第124-126页
附录V cpSSR引物扩增区域,序列及来源第126-127页
附录VI 攻读博士学位期间发表论文目录第127-128页
致谢第128页

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