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甘蓝型油菜产量及其相关性状比较基因组学的初步研究

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
缩略词表第9-10页
1 文献综述第10-23页
   ·分子标记第10页
   ·分子标记的分类及原理第10-14页
     ·基于DNA-DNA杂交的DNA标记第10-11页
     ·基于PCR的DNA标记第11页
     ·基于限制性内切酶与PCR技术相结合的DNA标记第11-12页
     ·基于单核苷酸多态性的DNA标记第12-14页
       ·PCR-SSCP分析技术的基本原理第12页
       ·PCR-SSCP分析技术的影响因素第12-13页
       ·PCR-SSCP分析技术的研究进展第13-14页
   ·分子标记在油菜上的应用第14-18页
     ·种子纯度鉴定第14-15页
     ·遗传多样性分析第15页
     ·遗传图谱的发展第15-16页
     ·重要性状的基因定位第16-18页
   ·比较基因组研究进展第18-22页
     ·标记水平的比较研究第18-19页
     ·序列水平的比较研究第19-20页
     ·功能水平的比较研究第20页
     ·性状水平的比较研究第20-21页
     ·单子叶植物与双子叶植物的比较第21-22页
   ·本研究的目的意义第22-23页
2 材料和方法第23-31页
   ·材料第23页
     ·供试材料第23页
     ·菌种第23页
     ·主要仪器与试剂第23页
   ·SRAP分析第23-25页
     ·扩增产物的电泳检测第24-25页
       ·PAGE胶制备第24页
       ·电泳分离第24页
       ·染色与显影第24-25页
   ·功能分子标记的SSCP分析第25页
     ·引物来源第25页
     ·PCR反应体系、反应程序及多态性检测第25页
   ·基因型记载第25-26页
   ·片段回收,克隆及测序第26-27页
     ·片段的回收及再扩增第26页
     ·连接反应第26页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备及转化第26页
     ·重组子筛选、鉴定第26-27页
     ·克隆片段的测序及其序列分析第27页
   ·基因克隆的方法第27-29页
     ·同源序列法第27页
     ·PCR步行第27-28页
     ·3'RACE克隆第28-29页
       ·提取总RNA第28页
       ·RT-PCR第28-29页
       ·3'cDNA的克隆第29页
   ·序列拼接及基因结构预测第29-30页
   ·数据分析第30-31页
     ·等位基因的分离频率检测第30页
     ·分子标记连锁图构建第30页
     ·测序结果的比对分析及相似序列查找第30-31页
3 结果与分析第31-59页
   ·功能分子标记序列测定与分析第31-38页
     ·SRAP标记序列的测定与分析第31-32页
     ·功能基因分子标记序列的测定与分析第32-35页
     ·部分功能分子标记序列的BLASTn分析第35页
     ·功能基因的来源及其引物序列第35-38页
   ·甘蓝型油菜与水稻的比较基因组研究第38-45页
     ·基于功能分子标记进行油菜与水稻重要农艺性状的比较分析第38-40页
     ·甘蓝型油菜与水稻产量相关QTLs的比较第40-42页
     ·油菜产量相关性状功能标记在水稻遗传连锁图上的定位第42-45页
       ·分析水稻群体的简并引物来源及序列第42-43页
       ·在水稻中的定位结果第43-45页
   ·功能分子标记在不同油菜群体的定位与比较第45-52页
     ·功能分子标记在三个群体中的定位分析第46-52页
     ·三个群体中产量相关QTLs的比较第52页
   ·甘蓝型油菜中SUC1基因的克隆第52-59页
     ·已知近缘物种SUC1基因序列信息查询第52-53页
     ·同源序列法第53-54页
     ·SUC1基因的3'Walking扩增第54-55页
     ·SUC1基因序列的拼接、BLAST2分析及基因结构预测第55-56页
     ·总RNA含量和质量的检测第56页
     ·RT-PCR扩增结果第56-57页
     ·SUC1基因的3'RACE-PCR扩增结果第57-59页
4 讨论与小结第59-63页
   ·功能基因定位油菜产量及其相关性状的可行性第59-60页
   ·功能基因与性状的连锁关系第60-61页
   ·利用功能分子标记进行油菜的初步比较研究第61页
   ·甘蓝型油菜SUC1基因的克隆第61-63页
参考文献第63-72页
致谢第72-73页
硕士阶段已发及待发文章第73页

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