用生物统计方法预测蛋白质相互作用
| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-12页 |
| 第1章 前言 | 第12-17页 |
| ·生物统计学简介 | 第12-13页 |
| ·蛋白质间相互作用的预测 | 第13-14页 |
| ·课题的来源和意义 | 第14-15页 |
| ·论文的主要内容 | 第15-17页 |
| 第2章 蛋白质及蛋白质间相互作用 | 第17-28页 |
| ·蛋白质的氨基酸组成 | 第17-18页 |
| ·蛋白质相互作用的原理 | 第18-20页 |
| ·蛋白质相互作用的数据库 | 第20-21页 |
| ·鉴别蛋白质相互作用的研究方法 | 第21-28页 |
| ·鉴别蛋白质相互作用的实验方法 | 第22-24页 |
| ·鉴别蛋白质相互作用的计算机方法 | 第24-28页 |
| 第3章 实验数据选取及结果评价方法 | 第28-34页 |
| ·DIP数据库 | 第28-29页 |
| ·实验数据分析及预处理 | 第29-32页 |
| ·正集数据 | 第29-30页 |
| ·负集数据 | 第30-32页 |
| ·训练集和测试集的选取 | 第32页 |
| ·结果评价方法 | 第32-34页 |
| 第4章 应用 SVM方法预测蛋白质相互作用 | 第34-59页 |
| ·基于统计学习理论的支持向量机算法简介 | 第34-40页 |
| ·理论背景 | 第34-36页 |
| ·方法介绍 | 第36-39页 |
| ·LIBSVM软件包介绍 | 第39-40页 |
| ·CTD编码方式预测蛋白质相互作用 | 第40-47页 |
| ·编码方法 | 第40-43页 |
| ·预报结果与讨论 | 第43页 |
| ·变量选择结合SVM做分类预报 | 第43-46页 |
| ·5-fold交叉验证检验及预报结果 | 第46-47页 |
| ·氨基酸单编码方式预测蛋白质相互作用 | 第47-48页 |
| ·编码方法 | 第47页 |
| ·预报结果 | 第47页 |
| ·5-fold交叉验证检验及预报结果 | 第47-48页 |
| ·氨基酸双编码方式预测蛋白质相互作用 | 第48-50页 |
| ·编码方法 | 第48-49页 |
| ·预报结果与讨论 | 第49-50页 |
| ·5-fold交叉验证检验及预报结果 | 第50页 |
| ·Gauss函数分布编码方式预测蛋白质相互作用 | 第50-54页 |
| ·编码方法 | 第50-53页 |
| ·预报结果与讨论 | 第53-54页 |
| ·5-fold交叉验证检验及预报结果 | 第54页 |
| ·伪氨基酸组成编码方式预测蛋白质相互作用 | 第54-59页 |
| ·编码方法 | 第54-58页 |
| ·5-fold交叉验证检验及预报结果 | 第58-59页 |
| 第5章 融合网络模型预测蛋白质相互作用 | 第59-63页 |
| ·投票方案(Voting scheme) | 第59页 |
| ·双层 SVM预报方法 | 第59-60页 |
| ·5-fold交叉验证预报结果与讨论 | 第60-63页 |
| 第6章 结论与展望 | 第63-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-69页 |
| 个人简历 在读期间发表的学术论文和研究成果 | 第69页 |
| 个人简历: | 第69页 |
| 己发表论文: | 第69页 |
