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造纸废水纸浆沉淀物宏基因组文库的构建及纤维素酶基因的克隆和鉴定

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-11页
第一章 前言第11-26页
   ·未培养微生物第11-13页
   ·环境微生物混合基因组 DNA的提取和纯化第13-14页
     ·混合基因组 DNA的提取第13页
     ·混合基因组 DNA的纯化第13-14页
   ·宏基因组文库第14-19页
     ·宏基因组文库的构建第14-16页
     ·宏基因组文库的筛选第16-19页
       ·基于功能基因表达的筛选方法第16-17页
       ·基于序列特异性的筛选方法第17-19页
     ·宏基因组文库的测序第19页
   ·纤维素与纤维素酶第19-25页
     ·纤维素第19-20页
     ·降解纤维素的微生物第20-22页
     ·微生物的纤维素酶第22页
     ·纤维素酶的结构第22-24页
     ·纤维素酶基因的克隆和鉴定第24页
     ·纤维素酶的应用第24-25页
   ·本研究的目的第25-26页
第二章 材料与方法第26-44页
   ·材料第26-30页
     ·环境样品第26页
     ·菌株和质粒第26-28页
     ·菌种保存第28页
     ·培养基、培养条件和抗生素第28-29页
       ·培养基第28-29页
       ·培养条件第29页
     ·常规试剂、溶液和缓冲液第29-30页
   ·方法第30-44页
     ·质粒提取第30页
     ·DNA的酶切、连接和电泳第30页
     ·电透析洗脱法回收 DNA片段第30-31页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备和质粒的转化第31-32页
       ·氯化钙法制备大肠杆菌感受态细胞第31-32页
       ·氯化铷法制备大肠杆菌感受态细胞第32页
       ·转化反应第32页
     ·环境样品宏基因组 DNA的提取第32-34页
       ·直接提取法第32-33页
       ·间接提取法第33-34页
     ·环境样品宏基因组 DNA的纯化第34页
     ·环境中细菌的系统发育和多样性分析第34-35页
     ·造纸废水纸浆沉淀物宏基因组文库的构建第35-36页
     ·文库中表达纤维素酶活性克隆的筛选第36-37页
     ·文库中纤维素酶基因的克隆第37页
     ·GenBank索引号第37页
     ·PCR引物设计与基因扩增第37-38页
     ·基因的表达与检测第38-39页
     ·SDS-PAGE蛋白质电泳第39-40页
       ·SDS-PAGE蛋白质电泳所需的溶液和试剂第39页
       ·SDS-PAGE电泳过程第39-40页
     ·蛋白质浓度测定第40页
     ·重组蛋白的纯化第40-41页
     ·内切葡聚糖酶的酶活测定第41-43页
     ·糖类的薄层层析第43页
     ·粘度测定第43-44页
第三章 结果与分析第44-68页
   ·造纸废水纸浆沉淀物的采集第44页
   ·造纸废水纸浆沉淀物的宏基因组DNA的提取和纯化第44-46页
     ·间接提取法提取宏基因组DNA第44-45页
     ·直接提取法提取宏基因组DNA第45页
     ·宏基因组 DNA的纯化第45-46页
   ·造纸废水纸浆沉淀物的细菌多样性分析第46页
   ·造纸废水纸浆沉淀物宏基因组文库的构建第46-49页
   ·宏基因组文库中纤维素酶活性克隆的筛选第49-51页
   ·活性克隆中纤维素酶基因的克隆和鉴定第51-62页
     ·内切葡聚糖酶基因umcel5F的克隆和鉴定第52-54页
     ·内切葡聚糖酶基因umcel5L的克隆和鉴定第54-57页
     ·纤维糊精酶基因umcel5M的克隆和鉴定第57-59页
     ·β-葡萄糖营酶基因umbgl3D的克隆和鉴定第59-62页
   ·内切葡聚糖酶Umcel5F的纯化第62-64页
     ·使用镍柱(Ni-NTA agarose)纯化 Umcel5F第62页
     ·使用阴离子交换柱Source 15Q纯化Umcel5F第62-63页
     ·内切葡聚糖酶 Umcel5F的纯化结果第63-64页
   ·Umcel5F的酶学特性分析第64-68页
     ·Umcel5F的最适反应pH值第64页
     ·Umcel5F的最适反应温度第64-65页
     ·Umcel5F的pH耐受性第65页
     ·Umcel5F的温度耐受性第65-66页
     ·Umcel5F的 Km和 Vmax测定第66页
     ·Umcel5F的底物特异性分析第66-67页
     ·Umcel5F水解 CMC的粘度测定第67-68页
第四章 总结与讨论第68-71页
   ·造纸废水纸浆沉淀物的细菌多样性分析第68页
   ·造纸废水纸浆沉淀物宏基因组文库的构建第68-69页
   ·宏基因组文库的筛选及纤维素酶基因的克隆和鉴定第69页
   ·重组内切葡聚糖酶 Umcel5F的纯化和酶学特性鉴定第69-70页
   ·宏基因组文库技术展望第70-71页
参考文献第71-80页
致谢第80-81页
攻读硕士学位期间所发表论文和取得的研究成果第81-82页

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