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猪Sar1b基因的克隆、染色体定位、原核表达及其与部分性状的关联分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
1 文献综述第11-21页
 1.1 前言第11页
 1.2 应用生物信息学进行基因的电子克隆第11-14页
  1.2.1 生物信息学(Bioinformatics)第11-12页
  1.2.2 主要核酸序列数据库第12页
  1.2.3 表达序列标签(EST)第12-13页
  1.2.4 基因的电子克隆第13-14页
 1.3 小分子GTP结合蛋白概述第14-15页
 1.4 小泡第15-17页
 1.5 Sar1蛋白简介第17-19页
  1.5.1 Sar1蛋白与COPⅡ型被膜组装第17-18页
  1.5.2 Sar1蛋白结构特点第18-19页
 1.6 Sar1b与脂肪吸收第19-21页
2 研究的目的和意义第21-22页
3 材料与方法第22-40页
 3.1 材料第22-27页
  3.1.1 组织样品第22页
  3.1.2 DNA样品第22-23页
  3.1.3 载体和菌株第23-24页
  3.1.4 酶和试剂盒第24-25页
  3.1.5 主要试剂第25页
  3.1.6 主要试剂的配制第25-27页
  3.1.7 主要仪器设备第27页
  3.1.8 主要分子生物学软件和统计软件第27页
 3.2 方法第27-40页
  3.2.1 候选基因的克隆方法第27-30页
   3.2.1.1 猪Sar1b基因EST-重叠群的构建第27-28页
   3.2.1.2 引物设计第28页
   3.2.1.3 总RNA提取第28页
   3.2.1.4 RNA的琼脂糖凝胶电泳检测第28页
   3.2.1.5 反转录反应(Reverse transcription RT)第28-29页
   3.2.1.6 PCR扩增条件第29页
   3.2.1.7 PCR产物的纯化、克隆和测序第29-30页
  3.2.2 基因染色体定位的SCHP和RH法第30-32页
   3.2.2.1 引物设计第30-31页
   3.2.2.2 PCR分型方法第31页
   3.2.2.3 数据分析方法第31-32页
  3.2.3 Sar1b基因组织表达谱研究第32-33页
   3.2.3.1 总RNA的提取及RNA浓度与质量的检测第32页
   3.2.3.2 RT-PCR扩增体系第32页
   3.2.3.3 数据分析第32-33页
  3.2.4 猪Sar1b基因遗传多态性的PCR-SSCP检测第33-34页
   3.2.4.1 PCR反应第33页
   3.2.4.2 SSCP检测第33-34页
  3.2.5 多态标记与性状的关联分析第34页
  3.2.6 猪Sar1b基因的原核表达第34-40页
   3.2.6.1 pET28a-Sar1b重组原核表达载体的构建第34-36页
   3.2.6.2 Sar1b蛋白的诱导表达第36页
   3.2.6.3 Sar1b蛋白诱导表达的检测第36-40页
4 结果第40-56页
 4.1 Sar1b基因的克隆第40-42页
  4.1.1 总RNA的提取与质量检测结果第40页
  4.1.2 RT-PCR扩增的结果第40页
  4.1.3 猪Sar1b基因cDNA序列分析结果第40-42页
 4.2 猪Sar1b基因的染色体定位结果第42-45页
  4.2.1 染色体区域定位结果第42-44页
  4.3.2 精细定位结果第44-45页
 4.3 猪Sar1b基因的组织表达结果第45-47页
 4.4 猪Sar1b基因的遗传多态性检测结果第47-49页
  4.4.1 检测片段的PCR扩增第47页
  4.4.2 SSCP检测遗传变异第47-48页
  4.4.3 Sar1b基因在不同猪群中的多态性分析结果第48-49页
 4.5 猪Sar1b基因的缺失突变位点与部分经济性状的关联分析结果第49-51页
 4.6 猪Sar1b基因的原核表达结果第51-56页
  4.6.1 RT-PCR扩增结果第51页
  4.6.2 猪Sar1b基因重组原核表达载体的构建第51页
  4.6.3 原核表达载体pET28a-Sar1b的鉴定第51-54页
   4.6.3.1 重组子的菌液PCR鉴定结果第51页
   4.6.3.2 重组子的酶切鉴定结果第51-53页
   4.6.3.4 重组子中的插入基因片断的测序鉴定结果第53-54页
  4.6.4 IPTG诱导重组原核表达载体表达Sar1b蛋白第54-55页
  4.6.5 Sar1b基因原核表达蛋白的Western-blot检测结果第55-56页
5 讨论第56-61页
 5.1 关于候选基因法及候选基因的选取第56页
 5.2 关于Sar1b基因的物理定位第56-58页
 5.3 关于Sar1b基因的组织表达谱第58页
 5.4 关于Sar1b基因的多态性检测及性状关联分析第58-61页
6 小结第61-63页
 6.1 本研究获得的结果第61页
 6.2 本研究的创新点第61页
 6.3 本研究不足之处及下一步值得研究的工作第61-63页
参考文献第63-68页
附录1 缩略词表第68-69页
附录2 猪Sar1b基因第5内含子序列第69-70页
致谢第70页

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