| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要 | 第9-11页 |
| 1 前言 | 第11-25页 |
| ·分布和症状 | 第11页 |
| ·病害的传毒介体及其传毒特性 | 第11-12页 |
| ·血清学 | 第12页 |
| ·病毒粒体 | 第12-14页 |
| ·粒体形态 | 第12-13页 |
| ·粒体特性 | 第13页 |
| ·病毒粒体在感染水稻植株和昆虫介体细胞中的定位 | 第13-14页 |
| ·病毒蛋白及其功能 | 第14-19页 |
| ·结构蛋白的定位 | 第14-16页 |
| ·RGDV外壳蛋白P8和P2 | 第16-17页 |
| ·RGDV核心结构蛋白 | 第17-18页 |
| ·非结构蛋白 | 第18-19页 |
| ·基因组结构 | 第19-21页 |
| ·病毒基因组的转录、复制和组装机制 | 第21-22页 |
| ·发病规律及防治措施 | 第22-23页 |
| ·本项目研究的目的及意义 | 第23-25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-34页 |
| ·材料 | 第25页 |
| ·供试病毒 | 第25页 |
| ·载体和菌株 | 第25页 |
| ·试剂及酶类 | 第25页 |
| ·供试仪器 | 第25页 |
| ·实验方法 | 第25-34页 |
| ·RGDV-dsRNA的提取、纯化及定量 | 第25-26页 |
| ·RGDV-dsRNA的提取和纯化 | 第26页 |
| ·dsRNA的定量 | 第26页 |
| ·病毒基因组的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第26-27页 |
| ·RGDV中国广东信宜分离物的同源克隆 | 第27-29页 |
| ·已知基因组片段的引物设计 | 第27-28页 |
| ·RT-PCR扩增 | 第28-29页 |
| ·cDNA合成 | 第28页 |
| ·PCR扩增 | 第28-29页 |
| ·单引物技术扩增水稻瘤矮病毒新基因组S12片段 | 第29-31页 |
| ·引物设计与cDNA的合成及扩增策略 | 第29-30页 |
| ·cDNA第一链的合成 | 第30页 |
| ·连接反应 | 第30页 |
| ·反转录 | 第30页 |
| ·RNA的降解和cDNA复性 | 第30页 |
| ·离心柱层析 | 第30页 |
| ·cDNA双链的补平 | 第30-31页 |
| ·单引物PCR扩增 | 第31页 |
| ·克隆操作 | 第31-33页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳及DNA片段的回收 | 第31页 |
| ·连接载体 | 第31-32页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的简易制备 | 第32页 |
| ·转化 | 第32页 |
| ·质粒的提取 | 第32页 |
| ·重组质粒的酶切鉴定 | 第32-33页 |
| ·克隆子序列的测定及分析 | 第33页 |
| ·生物信息学分析 | 第33-34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-56页 |
| ·RGDV-dsRNA的提取及纯化 | 第34页 |
| ·RGDV中国广东信宜分离物的同源克隆 | 第34-47页 |
| ·基因组S2片段 | 第34-36页 |
| ·PCR扩增及克隆 | 第34-35页 |
| ·全序列分析 | 第35-36页 |
| ·所编码蛋白的功能 | 第36页 |
| ·基因组S3片段 | 第36-38页 |
| ·PCR扩增及克隆 | 第36页 |
| ·全序列分析 | 第36-37页 |
| ·所编码蛋白的基本性质及功能 | 第37-38页 |
| ·基因组S8片段 | 第38-40页 |
| ·PCR扩增及克隆 | 第38-39页 |
| ·全序列分析 | 第39页 |
| ·外层衣壳蛋白基因序列与保守结构域分析 | 第39-40页 |
| ·基因组S9片段 | 第40-43页 |
| ·PCR扩增及克隆 | 第40-41页 |
| ·全序列分析 | 第41-42页 |
| ·所编码蛋白的功能分析 | 第42-43页 |
| ·基因组S10片段 | 第43-45页 |
| ·PCR扩增及克隆 | 第43-44页 |
| ·全序列分析 | 第44页 |
| ·氨基酸序列与保守结构域分析 | 第44-45页 |
| ·基因组S11片段 | 第45-47页 |
| ·PCR扩增及克隆 | 第45页 |
| ·全序列分析 | 第45-46页 |
| ·RGDV-Pns11保守结构域分析 | 第46-47页 |
| ·RGDV中国广东信宜分离物新基因组S12片段克隆 | 第47-50页 |
| ·S12片段的克隆 | 第47-48页 |
| ·全序列分析 | 第48-49页 |
| ·编码特性及功能分析 | 第49-50页 |
| ·系统进化 | 第50-56页 |
| ·外层衣壳蛋白系统发育分析 | 第50-53页 |
| ·RGDV-Pns10系统发育分析 | 第53-54页 |
| ·RGDV-Pns11系统发育分析 | 第54-56页 |
| 4 讨论 | 第56-61页 |
| ·单引物扩增技术与新基因组片段的扩增 | 第56页 |
| ·基因组末端序列和反向重复序列 | 第56-57页 |
| ·保守结构域 | 第57页 |
| ·系统进化 | 第57-60页 |
| ·小结 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 附录1 攻读学位期间发表的论文 | 第68-69页 |
| 附录2 攻读学位期间登录的RGDV-C及其基因 | 第69-70页 |
| 附录3 原创性声明 | 第70页 |