摘要 | 第1-6页 |
Abstract(英文摘要) | 第6-8页 |
目录 | 第8-11页 |
缩略语表 | 第11-12页 |
表格目录 | 第12-13页 |
插图目录 | 第13-15页 |
第一章 绪论 | 第15-21页 |
·论文的目的和意义 | 第15页 |
·国际国内研究状况和进展 | 第15-20页 |
·论文主要内容的安排 | 第20-21页 |
第二章 Armillariella sp.(E-20)cDNA文库的构建 | 第21-33页 |
·前言 | 第21页 |
·材料与方法 | 第21-30页 |
·材料与主要仪器设备 | 第21-24页 |
·Armillariella sp.(E-20)的培养 | 第24页 |
·总RNA的提取 | 第24-25页 |
·mRNA纯化 | 第25页 |
·第一链cDNA的合成 | 第25-26页 |
·LD-PCR合成第二链cDNA | 第26页 |
·蛋白酶K消化 | 第26-27页 |
·Sfil酶切 | 第27页 |
·cDNA的分级分离 | 第27-28页 |
·cDNA与λTriplEx2载体连接及连接产物的体外包装 | 第28页 |
·cDNA文库的滴度和重组率测定 | 第28-29页 |
·cDNA文库的扩增及质量鉴定 | 第29-30页 |
·结果与讨论 | 第30-33页 |
·总RNA的提取 | 第30-31页 |
·mRNA纯化 | 第31页 |
·cDNA的第二链合成 | 第31页 |
·cDNA的分级分离 | 第31-32页 |
·未扩增cDNA文库的质量鉴定 | 第32页 |
·扩增文库及其质量鉴定 | 第32-33页 |
第三章 Armillariella sp.(E-20)cDNA文库部分克隆的随机测序 | 第33-60页 |
·前言 | 第33页 |
·材料与方法 | 第33-36页 |
·材料与主要仪器设备 | 第33-34页 |
·部分文库铺平板 | 第34页 |
·随机挑选20个克隆转换克隆的形式 | 第34-35页 |
·测序 | 第35页 |
·测序结果的初步分析 | 第35-36页 |
·结果与讨论 | 第36-60页 |
·测序结果 | 第36-40页 |
·多序列比对分析 | 第40-41页 |
·VecScreen去除已测序列中的载体序列 | 第41-49页 |
·BLAST同源性分析结果 | 第49-60页 |
第四章 随机测序克隆序列的生物信息学分析 | 第60-89页 |
·前言 | 第60页 |
·材料与方法 | 第60-65页 |
·材料与主要仪器设备 | 第60页 |
·核酸序列的基本分析 | 第60-61页 |
·开放阅读框(ORF)分析 | 第61页 |
·密码子偏好性分析 | 第61页 |
·E20-GPD蛋白质一级序列的基本分析 | 第61页 |
·E20-GPD二级结构和功能预测 | 第61-63页 |
·E20-GPD三级结构预测 | 第63-64页 |
·同源性分析与系统发育分析 | 第64-65页 |
·结果与讨论 | 第65-89页 |
·核酸序列的基本分析 | 第65-73页 |
·开放阅读框(ORF)分析 | 第73-74页 |
·密码子偏好性分析 | 第74-75页 |
·E20-GPD蛋白质一级序列的基本分析 | 第75-76页 |
·E20-GPD二级结构和功能预测 | 第76-81页 |
·E20-GPD三级结构预测 | 第81-85页 |
·同源性分析与系统发育分析 | 第85-89页 |
第五章 总结与展望 | 第89-92页 |
参考文献 | 第92-100页 |
附录1 测序峰形图 | 第100-117页 |
附录2 测序序列多序列比对结果 | 第117-132页 |
附录3 去除载体序列对GenBank EST数据库同源性分析结果 | 第132-138页 |
附录4 E20-GPD氨基酸序列在GenBank中做BlastP分析 | 第138-140页 |
附录5 E20-GPD同源建模所用模板 | 第140-142页 |
附录6 同源性分析和系统发育分析所涉及15种真菌的分类学位置 | 第142-144页 |
攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第144-145页 |
致谢 | 第145页 |