| 缩略词 | 第1-12页 |
| 摘要 | 第12-15页 |
| Abstract | 第15-18页 |
| 第一章 前言 | 第18-40页 |
| 1 深海微生物研究的概况 | 第19-21页 |
| 2 深海微生物极端环境适应性机理研究进展 | 第21-26页 |
| ·深海微生物低温适应性机理的研究 | 第22-23页 |
| ·深海微生物高压适应性机理的研究 | 第23-26页 |
| 3 脂肪酸系统与环境关系的研究 | 第26-30页 |
| 4 丝状噬菌体研究概况 | 第30-38页 |
| ·丝状噬菌体的基因结构和功能 | 第30-31页 |
| ·丝状噬菌体的生活史 | 第31-36页 |
| ·丝状噬菌体的感染过程 | 第32页 |
| ·丝状噬菌体DNA的复制 | 第32-33页 |
| ·丝状噬菌体基因的转录和翻译 | 第33-34页 |
| ·丝状噬菌体的装配 | 第34-36页 |
| ·丝状噬菌体诱导机制的研究 | 第36-38页 |
| 5 本论文的研究目的和意义 | 第38-40页 |
| 第二章 深海细菌Shewanella piezotolerans WP3脂肪酸系统在不同温度和压力下的作用和调控 | 第40-82页 |
| 1 材料与方法 | 第40-58页 |
| ·材料 | 第40-48页 |
| ·菌株与质粒 | 第40页 |
| ·引物 | 第40-42页 |
| ·主要仪器 | 第42页 |
| ·工具软件 | 第42-43页 |
| ·主要试剂 | 第43页 |
| ·工具酶 | 第43页 |
| ·试剂盒 | 第43页 |
| ·常用溶液、培养基的配制 | 第43-48页 |
| ·方法 | 第48-58页 |
| ·不同条件下的细菌培养 | 第48页 |
| ·细菌总DNA的提取 | 第48-49页 |
| ·WP3总RNA的提取 | 第49页 |
| ·基因组DNA的去除及RNA的纯化 | 第49-50页 |
| ·DNA乙醇沉淀 | 第50页 |
| ·PCR反应 | 第50-51页 |
| ·菌落PCR | 第51页 |
| ·琼脂糖凝胶上DNA片段的回收 | 第51-52页 |
| ·PCR产物的回收 | 第52页 |
| ·核酸内切酶酶切反应 | 第52页 |
| ·质粒去磷酸化处理 | 第52页 |
| ·连接反应 | 第52页 |
| ·化学感受态细胞的制备 | 第52页 |
| ·质粒的化学转化 | 第52-53页 |
| ·质粒提取 | 第53页 |
| ·同源性比对 | 第53页 |
| ·反转录PCR(RT—PCR) | 第53-54页 |
| ·脂肪酸样品的制备与检测 | 第54页 |
| ·缺失突变载体和突变菌株的构建(双亲杂交) | 第54-58页 |
| 2 结果与分析 | 第58-76页 |
| ·希瓦氏菌中与脂肪酸合成相关的基因和途径 | 第58-60页 |
| ·WP3脂肪酸在不同温度和压力下的变化 | 第60-61页 |
| ·EPA,而不是单不饱和脂肪酸是WP3低温高压生长所必需的 | 第61-65页 |
| ·EPA缺失突变菌株的构建及其脂肪酸成分的分析 | 第61-62页 |
| ·EPA对WP3低温高压生长的影响 | 第62-64页 |
| ·浅蓝菌素(Cerulenin)处理后WP3脂肪酸成分的变化 | 第64页 |
| ·单不饱和脂肪酸含量的降低对WP3低温高压生长的影响 | 第64-65页 |
| ·EPA和单不饱和脂肪酸合成的调控 | 第65-70页 |
| ·脂肪酸相关基因转录水平的分析 | 第65-66页 |
| ·EPA合成的调控 | 第66-69页 |
| ·Fis型转录调控因子(swp3548)缺失突变株的构建及其脂肪酸成分的分析 | 第67页 |
| ·Fis突变菌株EPA基因转录水平的分析 | 第67-69页 |
| ·单不饱和脂肪酸合成的调控 | 第69-70页 |
| ·需氧途径在WP3单不饱和脂肪酸合成中的作用 | 第69页 |
| ·厌氧途径在WP3单不饱和脂肪酸合成中的作用 | 第69-70页 |
| ·支链脂肪酸的作用和调控 | 第70-74页 |
| ·支链氨基酸转运系统(LIV-I)结构和功能分析 | 第70-71页 |
| ·LIV-I突变菌株的构建及其脂肪酸成分的分析 | 第71-72页 |
| ·支链脂肪酸含量的降低对WP3生长的影响 | 第72-73页 |
| ·同位素示踪实验对LIV-I调控作用的验证 | 第73-74页 |
| ·LIV-I系统在希瓦氏细菌中的进化 | 第74-76页 |
| 3 讨论 | 第76-81页 |
| 4 小结 | 第81-82页 |
| 第三章 深海噬菌体SW1的分离鉴定及其低温特性的研究 | 第82-107页 |
| 1 材料和方法 | 第83-92页 |
| ·材料 | 第83页 |
| ·引物序列 | 第83页 |
| ·探针序列 | 第83页 |
| ·方法 | 第83-92页 |
| ·丝状噬菌体颗粒的提取 | 第83-84页 |
| ·质粒形式(RF)丝状噬菌体DNA的提取 | 第84页 |
| ·单链形式(SS)丝状噬菌体DNA的提取 | 第84-85页 |
| ·噬菌体侵染实验 | 第85页 |
| ·噬菌体热稳定性的检测 | 第85页 |
| ·噬菌体宿主范围的检测 | 第85页 |
| ·噬菌体颗粒的透射电镜观察 | 第85-86页 |
| ·Southern杂交 | 第86-88页 |
| ·双向电泳 | 第88-92页 |
| 2 结果与分析 | 第92-103页 |
| ·SW1丝状噬菌体基因组结构分析 | 第92-94页 |
| ·SW1丝状噬菌体颗粒的分离及形态的观察 | 第94页 |
| ·SW1丝状噬菌体基本性质的测定 | 第94-97页 |
| ·SW1丝状噬菌体宿主范围的检测 | 第97页 |
| ·SW1丝状噬菌体低温侵染特性及热稳定性的研究 | 第97-98页 |
| ·温度对SW1丝状噬菌体表达调控的研究 | 第98-101页 |
| ·SW1丝状噬菌体低温诱导机制的初步研究 | 第101-103页 |
| 3 讨论 | 第103-106页 |
| 4 小结 | 第106-107页 |
| 第四章 总结与展望 | 第107-110页 |
| 参考文献 | 第110-117页 |
| 附录 | 第117-119页 |
| 致谢 | 第119页 |
