| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 第一章 前言 | 第12-38页 |
| 1 畜禽遗传多样性研究的重要性 | 第12-13页 |
| 2 我国家养动物遗传多样性研究的必要性 | 第13-14页 |
| 3 家鸡的起源与中国乌骨鸡种质资源研究概况 | 第14-17页 |
| ·家鸡的起源和演化 | 第14-15页 |
| ·乌骨鸡的品种 | 第15-16页 |
| ·乌骨鸡的乌色性状与羽色遗传 | 第16页 |
| ·乌骨鸡的开发利用 | 第16-17页 |
| 4 家鸡遗传多样性研究进展 | 第17-28页 |
| ·形态学水平的遗传多样性研究 | 第17-18页 |
| ·染色体水平的遗传多样性研究 | 第18-21页 |
| ·蛋白质水平的遗传多样性研究 | 第21-23页 |
| ·血型基因座位多态性 | 第21-22页 |
| ·蛋白质、同工酶多态性 | 第22-23页 |
| ·DNA水平的遗传多态性 | 第23-28页 |
| ·微卫星DNA多态性 | 第24-25页 |
| ·RAPD多态性 | 第25页 |
| ·SNP多态性 | 第25-26页 |
| ·PCR-RFLP多态性 | 第26-27页 |
| ·AFL多态性 | 第27-28页 |
| 5 线粒体DNA在禽类遗传多样性研究中的应用 | 第28-36页 |
| ·动物线粒体基因组的遗传特征 | 第29页 |
| ·家鸡线粒体基因组结构 | 第29-31页 |
| ·mtDNA多态性的研究方法 | 第31页 |
| ·动物mtDNA标记在群体遗传多样性研究中的应用 | 第31-36页 |
| ·分析种间多态性 | 第31-32页 |
| ·分析种内品种间及品种内多态性 | 第32页 |
| ·动物品种的起源与分化研究 | 第32-34页 |
| ·动物品种及类型的分类研究 | 第34页 |
| ·动物群体遗传结构及基因流动的研究 | 第34-35页 |
| ·标记经济性状,开展标记辅助选择 | 第35-36页 |
| 6 雪峰乌骨鸡遗传多样性与起源研究的必要性 | 第36-37页 |
| 7 本研究的目标和主要内容 | 第37-38页 |
| 第二章 雪峰乌骨鸡线粒体DNA(mtDNA)D-loop区序列遗传多样性研究 | 第38-56页 |
| 1 实验材料 | 第38-40页 |
| ·实验对象 | 第38页 |
| ·样品采集 | 第38页 |
| ·GenBank中家鸡和原鸡mtDNA D-loop区序列 | 第38-39页 |
| ·主要仪器设备 | 第39页 |
| ·主要试剂及工具酶 | 第39-40页 |
| ·部分试验试剂的配制 | 第40页 |
| 2 实验方法 | 第40-44页 |
| ·mtDNA提取、检测及稀释 | 第40-41页 |
| ·PCR扩增 | 第41-43页 |
| ·扩增引物的设计 | 第41-42页 |
| ·PCR反应体系 | 第42页 |
| ·PCR反应程序 | 第42页 |
| ·PCR产物检测 | 第42页 |
| ·PCR产物回收 | 第42-43页 |
| ·测序 | 第43页 |
| ·数据处理与分析 | 第43-44页 |
| ·序列的编辑比对 | 第43页 |
| ·序列多态性及群体遗传结构分析 | 第43-44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-53页 |
| ·雪峰乌骨鸡mtDNA的提取与检测图 | 第44页 |
| ·PCR扩增及电泳检测图 | 第44-45页 |
| ·雪峰乌骨鸡mtDNAD-loop区序列比较及多态性 | 第45-46页 |
| ·数据库的建立 | 第46页 |
| ·雪峰乌骨鸡mtDNAD-loop区序列变异位点分析 | 第46-49页 |
| ·群体遗传多样性研究 | 第49-53页 |
| ·mtDNA单倍型分析 | 第49-52页 |
| ·单倍型多样度、核苷酸多样度和核苷酸差异均数 | 第52-53页 |
| 4 讨论 | 第53-55页 |
| ·mtDNA提取方法的探讨 | 第53-54页 |
| ·不同组织中线粒体的分离 | 第53-54页 |
| ·线粒体DNA的提取 | 第54页 |
| ·D-loop区的生物学价值 | 第54-55页 |
| ·单倍型分析方法的应用探讨 | 第55页 |
| 5 小结 | 第55-56页 |
| 第三章 雪峰乌骨鸡的起源与分化研究 | 第56-68页 |
| 1 实验材料 | 第56页 |
| 2 数据分析 | 第56-57页 |
| ·单倍型间的系统进化研究 | 第56-57页 |
| ·单倍型间的网络关系分析 | 第57页 |
| 3 结果与分析 | 第57-64页 |
| ·群体间的遗传距离 | 第57-61页 |
| ·雪峰乌骨鸡、其它家鸡与红色原鸡的系统发育关系研究 | 第61-64页 |
| ·分子系统进化树的构建 | 第61-63页 |
| ·单倍型网络关系分析 | 第63-64页 |
| 4 讨论 | 第64-66页 |
| ·家鸡的起源 | 第64-65页 |
| ·雪峰乌骨鸡的起源 | 第65页 |
| ·雪峰乌骨鸡的遗传结构与多样性 | 第65-66页 |
| ·雪峰乌骨鸡的保护 | 第66页 |
| ·需要进一步研究和解决的问题 | 第66页 |
| 5 小结 | 第66-68页 |
| 全文结论 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-80页 |
| 附录:已登录的雪峰乌骨鸡mtDNAD-loop区基因序列 | 第80-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 作者简历 | 第84页 |
