基于基因芯片数据的基因调控网络的重构及其疾病学应用
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-14页 |
| ·引言 | 第9-10页 |
| ·论文研究内容 | 第10-12页 |
| ·复杂网络社团结构的剖分 | 第10页 |
| ·基因调控网络的重构 | 第10-11页 |
| ·疾病基因的排序和预测 | 第11-12页 |
| ·论文内容安排 | 第12页 |
| 参考文献 | 第12-14页 |
| 第二章 基于谱聚类的复杂网络社团结构的剖分 | 第14-28页 |
| ·引言 | 第14-15页 |
| ·谱方法能最大化模块函数 | 第15-19页 |
| ·算法框架 | 第19-21页 |
| ·仿真算例 | 第21-26页 |
| ·Zacharcy 空手道俱乐部网络 | 第21-23页 |
| ·科研合作网络 | 第23-25页 |
| ·美国大学校园足球赛网络 | 第25-26页 |
| ·本章小结 | 第26页 |
| 参考文献 | 第26-28页 |
| 第三章 基于基因芯片表达数据重构基因调控网络 | 第28-45页 |
| ·基因调控网络的背景和现状 | 第28-30页 |
| ·基因调控网络 | 第28-29页 |
| ·基因调控网络研究的现状 | 第29-30页 |
| ·基因调控网络的多时延动态贝叶斯网络模型 | 第30-33页 |
| ·基因调控的动态贝叶斯网络模型 | 第30-32页 |
| ·基因调控的多时延动态贝叶斯网络模型 | 第32-33页 |
| ·重构算法 | 第33-36页 |
| ·调控基因的选择及时延的估计 | 第33-34页 |
| ·推断基因调控网络的结构 | 第34-36页 |
| ·重构酵母基因调控网络 | 第36-41页 |
| ·基因芯片数据 | 第36-37页 |
| ·重构酵母细胞基因调控网络 | 第37-39页 |
| ·九个转录调控子构成的子网络 | 第39-41页 |
| ·本章小结 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-45页 |
| 第四章 疾病基因的排序和预测 | 第45-61页 |
| ·引言 | 第45-48页 |
| ·疾病基因的研究背景 | 第45-46页 |
| ·基于生物网络的疾病基因的预测 | 第46-48页 |
| ·基于网络模块化的疾病基因的排序和预测 | 第48-54页 |
| ·基本框架 | 第48-50页 |
| ·疾病症状相似网络的构建 | 第50-51页 |
| ·基因作用网络的构建 | 第51-52页 |
| ·疾病症状与致病基因的对应关系提取 | 第52-53页 |
| ·网络模块化预测算法 | 第53-54页 |
| ·方法验证 | 第54-58页 |
| ·验证基因网络表示基因功能的相关性 | 第54-56页 |
| ·留一法验证预测算法 | 第56-58页 |
| ·本章小结 | 第58页 |
| 参考文献 | 第58-61页 |
| 第五章 总结与展望 | 第61-63页 |
| ·论文结论 | 第61页 |
| ·展望 | 第61-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第64页 |
